ತಾಪ ನಕ್ಷೆ
ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಡೇಟಾ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಹೀಟ್ ಮ್ಯಾಪ್ ಡ್ರಾಯಿಂಗ್‌ಗಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ಫಿಲ್ಟರ್ ಮಾಡಬಹುದು, ಸಾಮಾನ್ಯಗೊಳಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಕ್ಲಸ್ಟರ್ ಮಾಡಬಹುದು.ವಿವಿಧ ಮಾದರಿಗಳ ನಡುವಿನ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮಟ್ಟದ ಕ್ಲಸ್ಟರ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ಇದನ್ನು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಜೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ
ವಿವಿಧ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ವಿರುದ್ಧ FASTA ಫೈಲ್‌ನಲ್ಲಿ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಜೀನ್ ಕ್ರಿಯೆಯ ಟಿಪ್ಪಣಿಯನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಜೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ
ಮೂಲ ಸ್ಥಳೀಯ ಜೋಡಣೆ ಹುಡುಕಾಟ ಸಾಧನ
CDS_UTR_Prediction
ತಿಳಿದಿರುವ ಪ್ರೊಟೀನ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಮತ್ತು ORF ಮುನ್ಸೂಚನೆಯ ವಿರುದ್ಧ ಬ್ಲಾಸ್ಟಿಂಗ್ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ನೀಡಿದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅನುಕ್ರಮಗಳಲ್ಲಿ ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶಗಳು (CDS) ಮತ್ತು ಕೋಡಿಂಗ್ ಅಲ್ಲದ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು (UTR) ಊಹಿಸಲು ಈ ಉಪಕರಣವನ್ನು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ.
ಮ್ಯಾನ್ಹ್ಯಾಟನ್ ಪ್ಲಾಟ್
ಮ್ಯಾನ್ಹ್ಯಾಟನ್ ಕಥಾವಸ್ತುವು ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಡೇಟಾ ಬಿಂದುಗಳೊಂದಿಗೆ ಡೇಟಾದ ಪ್ರದರ್ಶನವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.ಇದನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಸ್ಟಡೀಸ್ (GWAS) ನಲ್ಲಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಸರ್ಕೋಸ್
CIRCOS ರೇಖಾಚಿತ್ರವು ಜೀನೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ SNP, InDeL, SV, CNV ವಿತರಣೆಗಳ ನೇರ ಪ್ರಸ್ತುತಿಯನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
GO_Enrichment
TopGO ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪುಷ್ಟೀಕರಣಕ್ಕಾಗಿ ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾದ ಸಾಧನವಾಗಿದೆ.TopGO-ಬಯೋಕಂಡಕ್ಟರ್ ಪ್ಯಾಕೇಜ್ ವಿಭಿನ್ನ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, GO ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಫಲಿತಾಂಶಗಳ ದೃಶ್ಯೀಕರಣವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.ಇದು "ಗ್ರಾಫ್" ಹೆಸರಿನ ಔಟ್‌ಪುಟ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಫೋಲ್ಡರ್ ಅನ್ನು ರಚಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು topGO_BP, topGO_CC ಮತ್ತು topGO_MF ಗಾಗಿ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ.
WGCNA
WGCNA ವಂಶವಾಹಿ ಸಹ-ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮಾಡ್ಯೂಲ್‌ಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುವ ಡೇಟಾ ಮೈನಿಂಗ್ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ.ಮುಂದಿನ ಪೀಳಿಗೆಯ ಅನುಕ್ರಮದಿಂದ ಹುಟ್ಟಿಕೊಂಡ ಮೈಕ್ರೋಅರೇ ಡೇಟಾ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ರೆಶನ್ ಡೇಟಾ ಸೇರಿದಂತೆ ವಿವಿಧ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಡೇಟಾಸೆಟ್‌ಗೆ ಇದು ಅನ್ವಯಿಸುತ್ತದೆ.
ಇಂಟರ್‌ಪ್ರೊಸ್ಕ್ಯಾನ್
ಇಂಟರ್‌ಪ್ರೊ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುಕ್ರಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ವರ್ಗೀಕರಣ
GO_KEGG_Enrichment
ಒದಗಿಸಿದ ಜೀನ್ ಸೆಟ್ ಮತ್ತು ಅನುಗುಣವಾದ ಟಿಪ್ಪಣಿಯನ್ನು ಆಧರಿಸಿ GO ಎನ್‌ರಿಚ್‌ಮೆಂಟ್ ಹಿಸ್ಟೋಗ್ರಾಮ್, KEGG ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ಹಿಸ್ಟೋಗ್ರಾಮ್ ಮತ್ತು KEGG ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ಮಾರ್ಗವನ್ನು ರಚಿಸಲು ಈ ಉಪಕರಣವು ವಿನ್ಯಾಸವಾಗಿದೆ.