ವಿಕಸನೀಯ ತಳಿಶಾಸ್ತ್ರ
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
ಟಕಗಿ ಮತ್ತು ಇತರರು,ಸಸ್ಯ ಜರ್ನಲ್, 2013
● ● ದಶಾಸಮಗ್ರ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ:ಜಾತಿಗಳ ವಿಕಸನೀಯ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಪ್ರತಿಬಿಂಬಿಸುವ ಆನುವಂಶಿಕ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಅಂದಾಜು ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ಒಮ್ಮುಖ ವಿಕಸನ ಮತ್ತು ಸಮಾನಾಂತರ ವಿಕಾಸದ ಕಡಿಮೆ ಪ್ರಭಾವದೊಂದಿಗೆ ಜಾತಿಗಳ ನಡುವಿನ ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ.
● ● ದಶಾಐಚ್ಛಿಕ ಕಸ್ಟಮೈಸ್ ಮಾಡಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಉದಾಹರಣೆಗೆ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಮತ್ತು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಡೈವರ್ಜೆನ್ಸ್ ಸಮಯ ಮತ್ತು ವೇಗದ ಅಂದಾಜು.
● ● ದಶಾವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ ಮತ್ತು ಪ್ರಕಟಣೆ ದಾಖಲೆಗಳು: BMKGene 15 ವರ್ಷಗಳಿಗೂ ಹೆಚ್ಚು ಕಾಲ ಜನಸಂಖ್ಯೆ ಮತ್ತು ವಿಕಸನೀಯ ತಳಿಶಾಸ್ತ್ರ ಯೋಜನೆಗಳಲ್ಲಿ ಬೃಹತ್ ಅನುಭವವನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದೆ, ಸಾವಿರಾರು ಪ್ರಭೇದಗಳು ಇತ್ಯಾದಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ ಮತ್ತು ನೇಚರ್ ಕಮ್ಯುನಿಕೇಷನ್ಸ್, ಮಾಲಿಕ್ಯೂಲರ್ ಪ್ಲಾಂಟ್ಸ್, ಪ್ಲಾಂಟ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ಜರ್ನಲ್ ಇತ್ಯಾದಿಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರಕಟವಾದ 1000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಉನ್ನತ ಮಟ್ಟದ ಯೋಜನೆಗಳಿಗೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡಿದೆ.
● ಹೆಚ್ಚು ಕೌಶಲ್ಯಪೂರ್ಣ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ತಂಡ ಮತ್ತು ಸಣ್ಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ಚಕ್ರ: ಮುಂದುವರಿದ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಉತ್ತಮ ಅನುಭವ ಹೊಂದಿರುವ BMKGene ತಂಡವು ತ್ವರಿತ ತಿರುವು ಸಮಯದೊಂದಿಗೆ ಸಮಗ್ರ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ.
● ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲ:ನಮ್ಮ ಬದ್ಧತೆಯು 3 ತಿಂಗಳ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವಾ ಅವಧಿಯೊಂದಿಗೆ ಯೋಜನೆಯ ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಮೀರಿ ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಫಲಿತಾಂಶಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಯಾವುದೇ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು ನಾವು ಯೋಜನೆಯ ಅನುಸರಣೆ, ದೋಷನಿವಾರಣೆ ಸಹಾಯ ಮತ್ತು ಪ್ರಶ್ನೋತ್ತರ ಅವಧಿಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತೇವೆ.
ಸೇವಾ ವಿಶೇಷಣಗಳು ಮತ್ತು ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು
| ಅನುಕ್ರಮದ ಪ್ರಕಾರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಜನಸಂಖ್ಯಾ ಮಾಪಕ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು |
| ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮ | ≥ 30 ವ್ಯಕ್ತಿಗಳು, ಪ್ರತಿ ಉಪಗುಂಪಿನಿಂದ ≥ 10 ವ್ಯಕ್ತಿಗಳು
| 10x | ಸಾಂದ್ರತೆ: ≥ 1 ng/ µL ಒಟ್ಟು ಮೊತ್ತ≥ 30ng ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಅವನತಿ ಅಥವಾ ಮಾಲಿನ್ಯವಿಲ್ಲ |
| ನಿರ್ದಿಷ್ಟ-ಲೋಕಸ್ ಆಂಪ್ಲಿಫೈಡ್ ಫ್ರಾಗ್ಮೆಂಟ್ (SLAF) | ಟ್ಯಾಗ್ ಆಳ: 10x ಟ್ಯಾಗ್ಗಳ ಸಂಖ್ಯೆ: <400 Mb: WGS ಅನ್ನು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿದೆ <1Gb: 100K ಟ್ಯಾಗ್ಗಳು 1 ಜಿಬಿ >2Gb: 300K ಟ್ಯಾಗ್ಗಳು ಗರಿಷ್ಠ 500k ಟ್ಯಾಗ್ಗಳು | ಸಾಂದ್ರತೆ ≥ 5 ng/µL ಒಟ್ಟು ಮೊತ್ತ ≥ 80 ng ನ್ಯಾನೋಡ್ರಾಪ್ OD260/280=1.6-2.5 ಅಗರೋಸ್ ಜೆಲ್: ಇಲ್ಲ ಅಥವಾ ಸೀಮಿತ ಅವನತಿ ಅಥವಾ ಮಾಲಿನ್ಯ.
|
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಪ್ರಯೋಗ ವಿನ್ಯಾಸ
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
ಸೇವೆಯು ಜನಸಂಖ್ಯಾ ರಚನೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಟ್ರೀ, ಪಿಸಿಎ, ಜನಸಂಖ್ಯಾ ಶ್ರೇಣೀಕರಣ ಚಾರ್ಟ್), ಜನಸಂಖ್ಯಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ಮತ್ತು ಜನಸಂಖ್ಯಾ ಆಯ್ಕೆ (ಲಿಂಕೇಜ್ ಅಸಂತೋಲನ, ಅನುಕೂಲಕರ ತಾಣಗಳ ಆಯ್ದ ಸ್ವೀಪ್-ಆಯ್ಕೆ) ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಸೇವೆಯು ಕಸ್ಟಮೈಸ್ ಮಾಡಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಹ ಒಳಗೊಂಡಿರಬಹುದು (ಉದಾ. ಡೈವರ್ಜೆನ್ಸ್ ಸಮಯ, ಜೀನ್ ಹರಿವು).
*ಇಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಿರುವ ಡೆಮೊ ಫಲಿತಾಂಶಗಳೆಲ್ಲವೂ BMKGENE ನೊಂದಿಗೆ ಪ್ರಕಟವಾದ ಜೀನೋಮ್ಗಳಿಂದ ಬಂದಿವೆ.
1.ವಿಕಾಸದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಆನುವಂಶಿಕ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರದ ನಿರ್ಮಾಣ, ಜನಸಂಖ್ಯಾ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಪಿಸಿಎ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.
ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರವು ಸಾಮಾನ್ಯ ಪೂರ್ವಜರನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಜಾತಿಗಳ ನಡುವಿನ ವರ್ಗೀಕರಣ ಮತ್ತು ವಿಕಸನೀಯ ಸಂಬಂಧಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ.
ಪಿಸಿಎ ಉಪ-ಜನಸಂಖ್ಯೆಗಳ ನಡುವಿನ ನಿಕಟತೆಯನ್ನು ದೃಶ್ಯೀಕರಿಸುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.
ಜನಸಂಖ್ಯಾ ರಚನೆಯು ಆಲೀಲ್ ಆವರ್ತನಗಳ ವಿಷಯದಲ್ಲಿ ತಳೀಯವಾಗಿ ವಿಭಿನ್ನ ಉಪ-ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
ಚೆನ್, ಮತ್ತು ಇತರರು,ಪಿಎನ್ಎಎಸ್, 2020
2.ಆಯ್ದ ಸ್ವೀಪ್
ಆಯ್ದ ಸ್ವೀಪ್ ಎಂದರೆ ಅನುಕೂಲಕರ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಲಿಂಕ್ ಮಾಡಲಾದ ತಟಸ್ಥ ಸೈಟ್ಗಳ ಆವರ್ತನಗಳನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಲಿಂಕ್ ಮಾಡದ ಸೈಟ್ಗಳ ಆವರ್ತನಗಳನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದರ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಪ್ರಾದೇಶಿಕ ಕಡಿತವಾಗುತ್ತದೆ.
ಆಯ್ದ ಸ್ವೀಪ್ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಪತ್ತೆಹಚ್ಚುವಿಕೆಯನ್ನು ಎಲ್ಲಾ SNP ಗಳ ಜನಸಂಖ್ಯಾ ಆನುವಂಶಿಕ ಸೂಚ್ಯಂಕ (π，Fst, Tajima's D) ಅನ್ನು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಹಂತದಲ್ಲಿ (10 Kb) ಸ್ಲೈಡಿಂಗ್ ವಿಂಡೋದೊಳಗೆ (100 Kb) ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವ ಮೂಲಕ ಸಂಸ್ಕರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ವೈವಿಧ್ಯತೆ (π)
ತಜಿಮಾ ಅವರ ಡಿ
ಸ್ಥಿರೀಕರಣ ಸೂಚ್ಯಂಕ (Fst)
ವು, ಮತ್ತು ಇತರರು,ಆಣ್ವಿಕ ಸಸ್ಯ, 2018
3.ಜೀನ್ ಹರಿವು
ವು, ಮತ್ತು ಇತರರು,ಆಣ್ವಿಕ ಸಸ್ಯ, 2018
4. ಜನಸಂಖ್ಯಾ ಇತಿಹಾಸ
ಜಾಂಗ್, ಮತ್ತು ಇತರರು,ಪ್ರಕೃತಿ ಪರಿಸರ ವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ವಿಕಾಸ, 2021
5.ವ್ಯತ್ಯಾಸ ಸಮಯ
ಜಾಂಗ್, ಮತ್ತು ಇತರರು,ಪ್ರಕೃತಿ ಪರಿಸರ ವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ವಿಕಾಸ, 2021
BMKGene ನ ವಿಕಸನೀಯ ತಳಿಶಾಸ್ತ್ರ ಸೇವೆಗಳಿಂದ ಸುಗಮಗೊಳಿಸಲಾದ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಪ್ರಕಟಣೆಗಳ ಸಂಗ್ರಹದ ಮೂಲಕ ಅನ್ವೇಷಿಸಿ:
ಹಸ್ಸಾನ್ಯಾರ್, ಎಕೆ ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಸಂಪೂರ್ಣ-ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮದ ಮೂಲಕ ಅಪಿಸ್ ಸೆರಾನಾ ಸೆರಾನಾ ಲಾರ್ವಾಗಳಲ್ಲಿ ಸ್ಯಾಕ್ಬ್ರೂಡ್ ವೈರಸ್ ಪ್ರತಿರೋಧದೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿತವಾಗಿರುವ ಎಸ್ಎನ್ಪಿ ಆಣ್ವಿಕ ಗುರುತುಗಳು ಮತ್ತು ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಜೀನ್ಗಳ ಆವಿಷ್ಕಾರ',ಅಂತರರಾಷ್ಟ್ರೀಯ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಸೈನ್ಸಸ್ ಜರ್ನಲ್, 24(7). doi: 10.3390/IJMS24076238.
ಚಾಯ್, ಜೆ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಕಾಡು, ತಳೀಯವಾಗಿ ಶುದ್ಧವಾದ ಚೀನೀ ದೈತ್ಯ ಸಲಾಮಾಂಡರ್ನ ಆವಿಷ್ಕಾರವು ಹೊಸ ಸಂರಕ್ಷಣಾ ಅವಕಾಶಗಳನ್ನು ಸೃಷ್ಟಿಸುತ್ತದೆ',ಪ್ರಾಣಿಶಾಸ್ತ್ರ ಸಂಶೋಧನೆ, 2022, ಸಂಪುಟ 43, ಸಂಚಿಕೆ 3, ಪುಟಗಳು: 469-480, 43(3), ಪುಟಗಳು 469–480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.
ಹಾನ್, ಎಂ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಕ್ವಿಂಗ್ಹೈ-ಟಿಬೆಟಿಯನ್ ಪ್ರಸ್ಥಭೂಮಿಯಲ್ಲಿ ಸ್ಥಳೀಯ ಎಲಿಮಸ್ ಸಿಬಿರಿಕಸ್ ಎಲ್. ನ ಫೈಲೋಜಿಯೋಗ್ರಾಫಿಕಲ್ ಪ್ಯಾಟರ್ನ್ ಮತ್ತು ಜನಸಂಖ್ಯಾ ವಿಕಸನ ಇತಿಹಾಸ',ಸಸ್ಯ ವಿಜ್ಞಾನದಲ್ಲಿ ಗಡಿನಾಡುಗಳು, 13, ಪುಟ 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.
ವಾಂಗ್, ಜೆ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್-ಮಟ್ಟದ ಜೀನೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಮತ್ತು ಲಾಂಗನ್ ಪ್ರವೇಶಗಳ ಜನಸಂಖ್ಯಾ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ನಿಂದ ಲಾಂಗನ್ ವಿಕಸನದ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಒಳನೋಟಗಳು',ತೋಟಗಾರಿಕೆ ಸಂಶೋಧನೆ, 9. ಡೋಯಿ: 10.1093/HR/UHAC021.
