ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ mRNA ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (ಉಲ್ಲೇಖದೊಂದಿಗೆ)
ತಿಳಿದಿರುವ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮ ಮತ್ತು ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಹಿತಿಯ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ, ಹೊಸ ಪೀಳಿಗೆಯ ಹೆಚ್ಚಿನ ಥ್ರೋಪುಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (RNA-Seq) ಡೇಟಾವನ್ನು ಇನ್‌ಪುಟ್ ಆಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಹೊಸ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಸೈಟ್‌ಗಳು (ಹೊಸ ಜೀನ್) ಮತ್ತು ಹೊಸ ವೇರಿಯಬಲ್ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ಈವೆಂಟ್‌ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.ಅನುಕ್ರಮ ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟದ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ;ಆಯ್ದ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್‌ನ ಅನುಕ್ರಮ ಡೇಟಾ ಮತ್ತು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆ, ಎಕ್ಸಾನ್ / ಇಂಟ್ರಾನ್‌ನ ಗಡಿಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವುದು, ಜೀನ್ ರೂಪಾಂತರದ ವಿಭಜನೆಯನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುವುದು, ಜೀನ್ ಪ್ರದೇಶಗಳು ಮತ್ತು ಹೊಸ ಪ್ರತಿಗಳನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸುವುದು, ನಕಲು ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರದೇಶದ SNP ಸೈಟ್‌ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವುದು, 3' ಮತ್ತು 5 ನಡುವಿನ ಗಡಿ ಜೀನ್ಗಳು, ಮತ್ತು ವಿಭಿನ್ನ ಮಾದರಿಗಳ (ಗುಂಪುಗಳು) ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ.
ದೀರ್ಘ ಕೋಡಿಂಗ್ ಅಲ್ಲದ ಆರ್‌ಎನ್‌ಎಗಳು
ಲಾಂಗ್ ಕೋಡಿಂಗ್ ಅಲ್ಲದ ಆರ್‌ಎನ್‌ಎಗಳು (ಎಲ್‌ಎನ್‌ಸಿಆರ್‌ಎನ್‌ಎ) 200 ಎನ್‌ಟಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಉದ್ದವಿರುವ ಒಂದು ರೀತಿಯ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳಾಗಿವೆ, ಅವು ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಕೋಡ್ ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುವುದಿಲ್ಲ.ಹೆಚ್ಚಿನ ಎಲ್‌ಎನ್‌ಸಿಆರ್‌ಎನ್‌ಎಗಳು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿರುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ ಎಂದು ಸಂಚಿತ ಪುರಾವೆಗಳು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ.ಹೈ-ಥ್ರೋಪುಟ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳು ಮತ್ತು ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ಸಾಧನಗಳು lncRNA ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಸ್ಥಾನಿಕ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲು ನಮಗೆ ಅಧಿಕಾರ ನೀಡುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ನಿರ್ಣಾಯಕ ನಿಯಂತ್ರಕ ಕಾರ್ಯಗಳೊಂದಿಗೆ lncRNA ಗಳನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಲು ನಮಗೆ ದಾರಿ ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತವೆ.ವೇಗವಾದ, ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹ ಮತ್ತು ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುವ lncRNA ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಲು ನಮ್ಮ ಗ್ರಾಹಕರಿಗೆ lncRNA ಅನುಕ್ರಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ವೇದಿಕೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸಲು BMKCloud ಹೆಮ್ಮೆಪಡುತ್ತದೆ.
16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಅನುಕ್ರಮ
ಮೈಕ್ರೋಬಿಯಲ್ ಡೈವರ್ಸಿಟಿ ಅನಾಲಿಸಿಸ್ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಅನ್ನು ಮೈಕ್ರೋಬಿಯಲ್ ಡೈವರ್ಸಿಟಿ ಪ್ರಾಜೆಕ್ಟ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ವರ್ಷಗಳ ಅನುಭವದೊಂದಿಗೆ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಪ್ರಮಾಣಿತ ಮೂಲ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ: ಮೂಲ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪ್ರಸ್ತುತ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಶೋಧನೆಯ ಮುಖ್ಯವಾಹಿನಿಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವಿಷಯವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ವಿಷಯವು ಶ್ರೀಮಂತ ಮತ್ತು ಸಮಗ್ರವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಯೋಜನಾ ವರದಿಗಳ ರೂಪದಲ್ಲಿ;ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ವಿಷಯವು ವೈವಿಧ್ಯಮಯವಾಗಿದೆ.ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಬಹುದು ಮತ್ತು ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳನ್ನು ಅರಿತುಕೊಳ್ಳಲು ಮೂಲಭೂತ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವರದಿ ಮತ್ತು ಸಂಶೋಧನಾ ಉದ್ದೇಶದ ಪ್ರಕಾರ ನಿಯತಾಂಕಗಳನ್ನು ಮೃದುವಾಗಿ ಹೊಂದಿಸಬಹುದು.ವಿಂಡೋಸ್ ಆಪರೇಟಿಂಗ್ ಸಿಸ್ಟಮ್, ಸರಳ ಮತ್ತು ವೇಗವಾಗಿದೆ.
ಶಾಟ್‌ಗನ್ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ (NGS)
ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಿಂದ ಹೊರತೆಗೆಯಲಾದ ಮಿಶ್ರ ಜೀನೋಮಿಕ್ ವಸ್ತುಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಜಾತಿಗಳ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ಮತ್ತು ಸಮೃದ್ಧಿ, ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ರಚನೆ, ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಸಂಬಂಧ, ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಅಂಶಗಳೊಂದಿಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧದ ಜಾಲದ ಬಗ್ಗೆ ವಿವರವಾದ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ.
NGS-WGS(ಇಲ್ಯುಮಿನಾ/BGI)
ಪೂರ್ವ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಜ್ಞಾನವಿಲ್ಲದೆ ಸಂಶೋಧನಾ ವೃತ್ತಿಪರರಿಗಾಗಿ ಸಂಯೋಜಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಪೈಪ್‌ಲೈನ್ ಅನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಉನ್ನತ-ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಯ ಸರ್ವರ್‌ನಲ್ಲಿ ಚಲಿಸುತ್ತದೆ.ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ, ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆ, SNP/InDel/SV ವ್ಯತ್ಯಾಸ ಪತ್ತೆ, ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ರೂಪಾಂತರ ಜೀನ್‌ನಂತಹ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ತ್ವರಿತವಾಗಿ ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸಲು ಇದು ಅನುಕೂಲವಾಗುತ್ತದೆ.
GWAS
ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಂಖ್ಯಾಶಾಸ್ತ್ರೀಯ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, GWAS ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳೊಂದಿಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿರುವ ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.ಸಂಕೀರ್ಣ ಮಾನವ ರೋಗಗಳು ಮತ್ತು ಸಸ್ಯಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರಾಣಿಗಳಲ್ಲಿನ ಸಂಕೀರ್ಣ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸುವಲ್ಲಿ ಇದು ನಿರ್ಣಾಯಕ ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತದೆ.
ಬಿಎಸ್ಎ
ಸಂಯೋಜಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವೇದಿಕೆಯು ಪ್ರಮಾಣಿತ ಮತ್ತು ವೈಯಕ್ತಿಕಗೊಳಿಸಿದ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ಬಳಕೆದಾರ ಸ್ನೇಹಿ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ ಅನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ.BSA ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸುವ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯಿಂದ ತೀವ್ರವಾದ ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುತ್ತದೆ.ಪೂಲ್ ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿಗಳ ನಡುವಿನ ಡಿಫರೆನ್ಷಿಯಲ್ ಲೊಕಿಯನ್ನು ಹೋಲಿಸುವ ಮೂಲಕ, ಈ ವಿಧಾನವು ಗುರಿ ಜೀನ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ನಿಕಟವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿಸಿರುವ ಆಣ್ವಿಕ ಗುರುತುಗಳನ್ನು ತ್ವರಿತವಾಗಿ ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ.ಸಸ್ಯಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರಾಣಿಗಳ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್‌ನಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಮಾರ್ಕರ್-ನೆರವಿನ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಸ್ಥಾನಿಕಕ್ಕೆ ಒಂದು ಅಮೂಲ್ಯ ಸಾಧನವಾಗಿದೆ.
ವಿಕಾಸಾತ್ಮಕ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್
ಇದು ಸೀಮಿತ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಪರಿಣತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಸಂಶೋಧನಾ ವೃತ್ತಿಪರರಿಗಾಗಿ ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾದ ಸಮಗ್ರ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ವರ್ಕ್‌ಫ್ಲೋ ಆಗಿದೆ.ಆನುವಂಶಿಕ ವಿಕಸನ ಯೋಜನೆಗಳಲ್ಲಿ BMKGENE ನ ವ್ಯಾಪಕ ಅನುಭವವನ್ನು ಹತೋಟಿಯಲ್ಲಿಟ್ಟುಕೊಂಡು, ಈ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಉನ್ನತ-ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಯ ಸರ್ವರ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಚಲಿಸುತ್ತದೆ, ವೈಯಕ್ತಿಕಗೊಳಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳ ತ್ವರಿತ ಮತ್ತು ನಿಖರವಾದ ಕಾರ್ಯಗತಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಖಾತ್ರಿಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.ಇವುಗಳು ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಟ್ರೀ ನಿರ್ಮಾಣ, ಲಿಂಕೇಜ್ ಅಸಮತೋಲನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಆನುವಂಶಿಕ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ, ಆಯ್ದ ಸ್ವೀಪ್ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ, ರಕ್ತಸಂಬಂಧ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಪ್ರಧಾನ ಘಟಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ರಚನೆಯ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಂತಹ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.
