ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ -NGS
ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್ ಎನ್ನುವುದು ಪರಿಸರ ಮತ್ತು ಮಾನವ ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್ಗಳಂತಹ ಜೀವಿಗಳ ಮಿಶ್ರ ಸಮುದಾಯದ ಒಟ್ಟು ಆನುವಂಶಿಕ ವಸ್ತುಗಳ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿದೆ. ಇದು ಬೆಳೆಸಬಹುದಾದ ಮತ್ತು ಬೆಳೆಸಲಾಗದ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಜೀನೋಮ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. NGS ನೊಂದಿಗೆ ಶಾಟ್ಗನ್ ಮೆಟಾಜಿನೋಮಿಕ್ ಅನುಕ್ರಮವು ವರ್ಗೀಕರಣದ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನದನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಹುದುಗಿರುವ ಈ ಸಂಕೀರ್ಣ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಭೂದೃಶ್ಯಗಳ ಅಧ್ಯಯನವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಜಾತಿಗಳ ವೈವಿಧ್ಯತೆ, ಸಮೃದ್ಧಿ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಸಂಕೀರ್ಣ ಜನಸಂಖ್ಯಾ ರಚನೆಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಸೂಕ್ಷ್ಮ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ವರ್ಗೀಕರಣದ ಅಧ್ಯಯನಗಳನ್ನು ಮೀರಿ, ಶಾಟ್ಗನ್ ಮೆಟಾಜಿನೋಮಿಕ್ಸ್ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ದೃಷ್ಟಿಕೋನವನ್ನು ಸಹ ನೀಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಜೀನ್ಗಳ ಪರಿಶೋಧನೆ ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಸಂಭಾವ್ಯ ಪಾತ್ರಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಅಂತಿಮವಾಗಿ, ಆನುವಂಶಿಕ ಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಅಂಶಗಳ ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಜಾಲಗಳ ಸ್ಥಾಪನೆಯು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯಗಳು ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ಪರಿಸರ ಹಿನ್ನೆಲೆಯ ನಡುವಿನ ಸಂಕೀರ್ಣ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯ ಸಮಗ್ರ ತಿಳುವಳಿಕೆಗೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡುತ್ತದೆ. ಕೊನೆಯಲ್ಲಿ, ಮೆಟಾಜಿನೋಮಿಕ್ ಅನುಕ್ರಮವು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯಗಳ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಜಟಿಲತೆಗಳನ್ನು ಬಿಚ್ಚಿಡಲು ಒಂದು ಪ್ರಮುಖ ಸಾಧನವಾಗಿ ನಿಂತಿದೆ, ಈ ಸಂಕೀರ್ಣ ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಲ್ಲಿ ತಳಿಶಾಸ್ತ್ರ ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ವಿಜ್ಞಾನದ ನಡುವಿನ ಬಹುಮುಖಿ ಸಂಬಂಧಗಳನ್ನು ಬೆಳಗಿಸುತ್ತದೆ.
ವೇದಿಕೆಗಳು: ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ ಮತ್ತು DNBSEQ-T7
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
● ● ದಶಾಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ಗಾಗಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆ ಮತ್ತು ಕೃಷಿ-ಮುಕ್ತ ವಿಧಾನ: ಕೃಷಿಯೋಗ್ಯವಲ್ಲದ ಜೀವಿಗಳಿಂದ ಆನುವಂಶಿಕ ವಸ್ತುಗಳ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವುದು.
● ● ದಶಾಹೆಚ್ಚಿನ ರೆಸಲ್ಯೂಷನ್: ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಕಡಿಮೆ-ಸಮೃದ್ಧತೆಯಿರುವ ಪ್ರಭೇದಗಳನ್ನು ಪತ್ತೆ ಮಾಡಿ.
● ● ದಶಾಸಮಗ್ರ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ:ವರ್ಗೀಕರಣದ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಮೇಲೆ ಮಾತ್ರವಲ್ಲದೆ ಸಮುದಾಯದ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಮೇಲೂ ಗಮನಹರಿಸಲಾಗಿದೆ.
● ● ದಶಾವ್ಯಾಪಕ ಅನುಭವ:ವಿವಿಧ ಸಂಶೋಧನಾ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಬಹು ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ಯೋಜನೆಗಳನ್ನು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಮುಗಿಸಿದ ಮತ್ತು 200,000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸಂಸ್ಕರಿಸಿದ ದಾಖಲೆಯೊಂದಿಗೆ, ನಮ್ಮ ತಂಡವು ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಯೋಜನೆಗೂ ಅನುಭವದ ಸಂಪತ್ತನ್ನು ತರುತ್ತದೆ.
ಸೇವಾ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ಅನುಕ್ರಮ ವೇದಿಕೆ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಡೇಟಾ | ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ |
| ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ನೋವಾಸೆಕ್ ಅಥವಾ DNBSEQ-T7 | ಪಿಇ150 | 6-20 ಜಿಬಿ | ಕ್ಯೂ30≥85% |
ಸೇವಾ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು
| ಸಾಂದ್ರತೆ (ng/µL) | ಒಟ್ಟು ಮೊತ್ತ (ng) | ವಾಲ್ಯೂಮ್ (μL) |
| ≥1 | ≥30 | ≥20 |
● ಮಣ್ಣು/ಕೆಸರು: 2-3 ಗ್ರಾಂ
● ಕರುಳಿನ ವಿಷಯ-ಪ್ರಾಣಿ: 0.5-2 ಗ್ರಾಂ
● ಕರುಳಿನಲ್ಲಿರುವ ವಸ್ತುಗಳು-ಕೀಟ: 0.1-0.25 ಗ್ರಾಂ
● ಸಸ್ಯದ ಮೇಲ್ಮೈ (ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ ಕೆಸರು): 0.5-1 ಗ್ರಾಂ
● ಹುದುಗುವಿಕೆ ಸಾರು ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಿದ ಕೆಸರು): 0.2-0.5 ಗ್ರಾಂ
● ಮಲ (ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಾಣಿಗಳು): 0.5-2 ಗ್ರಾಂ
● ಮಲ (ಇಲಿ): 3-5 ಧಾನ್ಯಗಳು
● ಪಲ್ಮನರಿ ಅಲ್ವಿಯೋಲಾರ್ ಲ್ಯಾವೆಜ್ ದ್ರವ: ಫಿಲ್ಟರ್ ಪೇಪರ್
● ಯೋನಿ ಸ್ವ್ಯಾಬ್: 5-6 ಸ್ವ್ಯಾಬ್ಗಳು
● ಚರ್ಮ/ಜನನಾಂಗದ ಸ್ವ್ಯಾಬ್/ಲಾಲಾರಸ/ಮೌಖಿಕ ಮೃದು ಅಂಗಾಂಶ/ಗಂಟಲಿನ ಸ್ವ್ಯಾಬ್/ಗುದನಾಳದ ಸ್ವ್ಯಾಬ್: 2-3 ಸ್ವ್ಯಾಬ್ಗಳು
● ಮೇಲ್ಮೈ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ: 5-6 ಸ್ವ್ಯಾಬ್ಗಳು
● ಜಲಮೂಲ/ಗಾಳಿ/ಜೈವಿಕ ಪದರ: ಫಿಲ್ಟರ್ ಪೇಪರ್
● ಎಂಡೋಫೈಟ್ಗಳು: 2-3 ಗ್ರಾಂ
● ದಂತ ಪ್ಲೇಕ್: 0.5-1 ಗ್ರಾಂ
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
ಈ ಕೆಳಗಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ:
● ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣದ ಅನುಕ್ರಮ
● ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್ ಜೋಡಣೆ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಭವಿಷ್ಯ
● ಜೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ
● ವರ್ಗೀಕರಣ ಆಲ್ಫಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
● ಸಮುದಾಯದ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಜೈವಿಕ ಕಾರ್ಯ, ಚಯಾಪಚಯ, ಪ್ರತಿಜೀವಕ ಪ್ರತಿರೋಧ
● ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ವರ್ಗೀಕರಣ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ಎರಡರ ಕುರಿತಾದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ:
ಬೀಟಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಅಂತರ-ಗುಂಪು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಪರಿಸರ ಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಹೊರಗಿನ ಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ನಡುವೆ
ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಕಾರ್ಡ್ ಪ್ರತಿಜೀವಕ ಪ್ರತಿರೋಧ
KEGG ಚಯಾಪಚಯ ಮಾರ್ಗಗಳ ಭೇದಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಗಮನಾರ್ಹ ಮಾರ್ಗಗಳ ಹೀಟ್ಮ್ಯಾಪ್
ವರ್ಗೀಕರಣ ವಿತರಣೆಯ ಆಲ್ಫಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆ: ACE ಸೂಚ್ಯಂಕ
ವರ್ಗೀಕರಣ ವಿತರಣೆಯ ಬೀಟಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆ: ಪಿಸಿಒಎ
ಇಲ್ಯುಮಿನಾ ಜೊತೆಗಿನ BMKGene ನ ಮೆಟಾಜಿನೋಮ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಸೇವೆಗಳಿಂದ ಸುಗಮಗೊಳಿಸಲಾದ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಪ್ರಕಟಣೆಗಳ ಸಂಗ್ರಹದ ಮೂಲಕ ಅನ್ವೇಷಿಸಿ.
ಹಾಯ್, ಕ್ಯೂ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ವಿಭಿನ್ನ ಕೃಷಿ ನೀರಿನ ತಾಪಮಾನದಲ್ಲಿ ಸಾಂಕ್ರಾಮಿಕ ಹೆಮಟೊಪಯಟಿಕ್ ನೆಕ್ರೋಸಿಸ್ ವೈರಸ್ ಸೋಂಕಿಗೆ ಒಳಗಾದ ಮಳೆಬಿಲ್ಲು ಟ್ರೌಟ್ (ಓಂಕೋರ್ಹೈಂಚಸ್ ಮೈಕಿಸ್) ನ ಕರುಳಿನ ಅಂಶಗಳಲ್ಲಿನ ಬದಲಾವಣೆಗಳ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಮತ್ತು ಮೆಟಾಬಾಲೊಮಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ',ಸೂಕ್ಷ್ಮ ಜೀವವಿಜ್ಞಾನದಲ್ಲಿ ಗಡಿನಾಡುಗಳು, 14, ಪುಟ 1275649. doi: 10.3389/FMICB.2023.1275649.
ಮಾವೋ, ಸಿ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ವಿವಿಧ ಟ್ರೋಫಿಕ್ ಸ್ಥಿತಿಗಳ ನಗರ ಸರೋವರಗಳಲ್ಲಿ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯಗಳು, ಪ್ರತಿರೋಧ ಜೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರತಿರೋಧಕ ಅಪಾಯಗಳು: ಆಂತರಿಕ ಕೊಂಡಿಗಳು ಮತ್ತು ಬಾಹ್ಯ ಪ್ರಭಾವಗಳು',ಅಪಾಯಕಾರಿ ವಸ್ತುಗಳ ಪ್ರಗತಿಗಳ ಜರ್ನಲ್, 9, ಪು. 100233. doi: 10.1016/J.HAZADV.2023.100233.
ಸು, ಎಂ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಕುರಿ ರುಮೆನ್ನ ದ್ರವ-ಸಂಬಂಧಿತ ಮತ್ತು ಘನ-ಸಂಬಂಧಿತ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ನಡುವಿನ ಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯದಲ್ಲಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿದೆ',ಸೂಕ್ಷ್ಮ ಜೀವವಿಜ್ಞಾನದಲ್ಲಿ ಗಡಿನಾಡುಗಳು, 13, ಪುಟ 851567. doi: 10.3389/FMICB.2022.851567.
ಯಿನ್, ಜೆ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಒಬೆಸ್ ನಿಂಗ್ಕ್ಸಿಯಾಂಗ್ ಹಂದಿಯಿಂದ ಪಡೆದ ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಟಾ ಕಾರ್ನಿಟೈನ್ ಚಯಾಪಚಯ ಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಪುನಃ ಸ್ಥಾಪಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನೇರ DLY ಹಂದಿಗಳಲ್ಲಿ ಸ್ನಾಯು ಕೊಬ್ಬಿನಾಮ್ಲ ಶೇಖರಣೆಯನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುತ್ತದೆ',ನಾವೀನ್ಯತೆ, 4(5), ಪು. 100486. doi: 10.1016/J.XINN.2023.100486.
ಝಾವೋ, ಎಕ್ಸ್. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಚೀನಾದ ಹೈಹೆ ನದೀಮುಖದ ಮೇಲ್ಭಾಗ ಮತ್ತು ಕೆಳಭಾಗದಲ್ಲಿ ಪ್ರಾತಿನಿಧಿಕ ಜೈವಿಕ/ವಿಘಟನೀಯವಲ್ಲದ ಪ್ಲಾಸ್ಟಿಕ್ ಮತ್ತು ಪ್ಲಾಸ್ಟಿಕ್ ಅಲ್ಲದ ಶಿಲಾಖಂಡರಾಶಿಗಳ ಸಂಭಾವ್ಯ ಅಪಾಯಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಒಳನೋಟಗಳು',ಒಟ್ಟು ಪರಿಸರದ ವಿಜ್ಞಾನ, 887, ಪು. 164026. doi: 10.1016/J.SCITOTENV.2023.164026.
