16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ
ಸೇವಾ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
● ಅನುಕ್ರಮ ವೇದಿಕೆ: ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ರೆವಿಯೊ
● ಅನುಕ್ರಮ ಮೋಡ್: CCS (ಹೈಫೈ ರೀಡ್ಗಳು)
● ಹೈಫೈ SMRT ಬೆಲ್ ಲೈಬ್ರರಿ ಸಿದ್ಧತೆಗೆ ಮೊದಲು ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ಗಳ ಟಂಡೆಮ್ ಲಿಂಕ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಗುರಿ ಪ್ರದೇಶದ ವರ್ಧನೆ.
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
● ● ದಶಾಹೆಚ್ಚಿನ ವರ್ಗೀಕರಣದ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್: ಟಿಹ್ಯಾನ್ ಶಾರ್ಟ್-ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಅನುಕ್ರಮ,ಜಾತಿಗಳ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ OTU ವರ್ಗೀಕರಣ ದರಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
● ● ದಶಾಅತ್ಯಂತ ನಿಖರವಾದ ಮೂಲ ಕರೆ: ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಸಿಸಿಎಸ್ ಮೋಡ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (ಹೈಫೈ ರೀಡ್ಗಳು).
● ● ದಶಾಪ್ರತ್ಯೇಕತೆ-ಮುಕ್ತ: ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಯೋಜನೆಯ ತ್ವರಿತ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ.
● ● ದಶಾವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಅನ್ವಯಿಸುತ್ತದೆ: ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯ ಅಧ್ಯಯನಗಳು.
● ● ದಶಾಸಮಗ್ರ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಡೇಟಾಬೇಸ್, ಟಿಪ್ಪಣಿ, OTU/ASV ವಿಷಯದಲ್ಲಿ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಇತ್ತೀಚಿನ QIIME2 ಪ್ಯಾಕೇಜ್ (ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಪರಿಸರ ವಿಜ್ಞಾನದ ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ಒಳನೋಟ).
● ● ದಶಾವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ: ವಾರ್ಷಿಕವಾಗಿ ಸಾವಿರಾರು ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಯೋಜನೆಗಳನ್ನು ನಡೆಸುವುದರೊಂದಿಗೆ, BMKGENE ಒಂದು ದಶಕದ ಅನುಭವ, ಹೆಚ್ಚು ಕೌಶಲ್ಯಪೂರ್ಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ತಂಡ, ಸಮಗ್ರ ವಿಷಯ ಮತ್ತು ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲವನ್ನು ತರುತ್ತದೆ.
ಸೇವಾ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಡೇಟಾ |
| ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ | ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ರೆವಿಯೊ | 10/30/50 ಕೆ ಟ್ಯಾಗ್ಗಳು (CCS) |
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು
| ಸಾಂದ್ರತೆ (ng/µL) | ಒಟ್ಟು ಪ್ರಮಾಣ (µg) | ವಾಲ್ಯೂಮ್ (μL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ದ್ರವ ಸಾರಜನಕದಲ್ಲಿ 3-4 ಗಂಟೆಗಳ ಕಾಲ ಫ್ರೀಜ್ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು ದ್ರವ ಸಾರಜನಕದಲ್ಲಿ ಅಥವಾ -80 ಡಿಗ್ರಿಯಿಂದ ದೀರ್ಘಾವಧಿಯವರೆಗೆ ಕಾಯ್ದಿರಿಸುವಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ. ಡ್ರೈ-ಐಸ್ನೊಂದಿಗೆ ಮಾದರಿ ಸಾಗಣೆ ಅಗತ್ಯವಿದೆ.
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
ಈ ಕೆಳಗಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ:
● ಕಚ್ಚಾ ದತ್ತಾಂಶ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ
●OTU ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್/ಶಬ್ದ ನಿವಾರಣೆ (ASV)
●OTU ಟಿಪ್ಪಣಿ
●ಆಲ್ಫಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಶಾನನ್, ಸಿಂಪ್ಸನ್ ಮತ್ತು ACE ಸೇರಿದಂತೆ ಬಹು ಸೂಚ್ಯಂಕಗಳು.
●ಬೀಟಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
●ಅಂತರ-ಗುಂಪು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
●ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಪರಿಸರ ಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಹೊರಗಿನ ಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ನಡುವೆ
●16S ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಜೀನ್ ಭವಿಷ್ಯ
ವರ್ಗೀಕರಣ ವಿತರಣೆಯ ಹಿಸ್ಟೋಗ್ರಾಮ್
ಸಮುದಾಯ ವಿತರಣಾ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರ
ಆಲ್ಫಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ACE
ಸೂಚ್ಯಂಕ
ಬೀಟಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ಪಿಸಿಒಎ
ಅಂತರ ಗುಂಪು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ: ANOVA
BMKGene ನ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಸೇವೆಗಳಿಂದ ಸುಗಮಗೊಳಿಸಲಾದ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಪ್ಯಾಕ್ಬಯೋ ಜೊತೆಗಿನ ಪ್ರಕಟಣೆಗಳ ಸಂಗ್ರಹದ ಮೂಲಕ ಅನ್ವೇಷಿಸಿ.
ಗಾವೊ, ಎಕ್ಸ್. ಮತ್ತು ವಾಂಗ್, ಹೆಚ್. (2023) 'ಆಲ್ಪೈನ್ ಹುಲ್ಲುಗಾವಲಿನಲ್ಲಿ ಎರಡು ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಹಂತಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಆಲ್ಪೈನ್ ಮೆರಿನೊ ಕುರಿಗಳಲ್ಲಿ ವಿಭಿನ್ನ ಫಿನಾಲಜಿಗೆ (ರೀಗ್ರೀನ್ ವರ್ಸಸ್ ಗ್ರಾಸಿ) ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುವ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ರುಮೆನ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪ್ರೊಫೈಲ್ಗಳು ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯಗಳ ತುಲನಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ', ಹುದುಗುವಿಕೆ, 9(1), ಪುಟ 16. doi: 10.3390/ಫರ್ಮೆಂಟೇಶನ್ 9010016/S1.
ಲಿ, ಎಸ್. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಕಲ್ಚುರೋಮಿಕ್ಸ್-ಆಧಾರಿತ ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಹೈ-ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಮರುಭೂಮಿ ಮಣ್ಣಿನಲ್ಲಿ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಡಾರ್ಕ್ ಮ್ಯಾಟರ್ ಅನ್ನು ಸೆರೆಹಿಡಿಯುವುದು', npj ಬಯೋಫಿಲ್ಮ್ಸ್ ಮತ್ತು ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್ಗಳು 2023 9:1, 9(1), ಪುಟಗಳು 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
ಮು, ಎಲ್. ಮತ್ತು ಇತರರು (2022) 'ಹುದುಗುವಿಕೆ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ಮೇಲೆ ಕೊಬ್ಬಿನಾಮ್ಲ ಲವಣಗಳ ಪರಿಣಾಮಗಳು, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ಮತ್ತು ಅಲ್ಫಾಲ್ಫಾ, ಅಕ್ಕಿ ಹುಲ್ಲು ಮತ್ತು ಗೋಧಿ ಹೊಟ್ಟುಗಳಿಂದ ತಯಾರಿಸಿದ ಮಿಶ್ರ ಸೈಲೇಜ್ನ ಏರೋಬಿಕ್ ಸ್ಥಿರತೆ', ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ದಿ ಸೈನ್ಸ್ ಆಫ್ ಫುಡ್ ಅಂಡ್ ಅಗ್ರಿಕಲ್ಚರ್, 102(4), ಪುಟಗಳು 1475–1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
ಯಾಂಗ್, ಜೆ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2023) 'ಆಕ್ಸಜೋಲೋನ್-ಪ್ರೇರಿತ ಕರುಳಿನ ಆಕ್ಸಿಡೇಟಿವ್ ಒತ್ತಡದಲ್ಲಿ ವಯಸ್ಕ ಜೀಬ್ರಾಫಿಶ್ನಲ್ಲಿ ಸೋಂಚಸ್ ಬ್ರಾಕಿಯೋಟಸ್ ಡಿಸಿಯಿಂದ ಸಾರಗಳ ಉತ್ಕರ್ಷಣ ನಿರೋಧಕ ಪರಿಣಾಮಗಳಲ್ಲಿ ಆಕ್ಸಿಡೇಟಿವ್ ಒತ್ತಡ ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ಗಳು ಮತ್ತು ಗಟ್ ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಟಾ ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆ', ಆಂಟಿಆಕ್ಸಿಡೆಂಟ್ಗಳು 2023, ಸಂಪುಟ 12, ಪುಟ 192, 12(1), ಪುಟ 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
