16S/18S/ITS ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್-PacBio
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
● 16S/18S/ITS ನ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುವ ದೀರ್ಘ-ಓದುವಿಕೆಗಳು
● PacBio CCS ಮೋಡ್ ಅನುಕ್ರಮದೊಂದಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ಮೂಲ ಕರೆ ಮಾಡುವಿಕೆ
● OTU/ASV ಟಿಪ್ಪಣಿಯಲ್ಲಿ ಜಾತಿ-ಮಟ್ಟದ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್
● ಇತ್ತೀಚಿನ QIIME2 ಡೇಟಾಬೇಸ್, ಟಿಪ್ಪಣಿ, OTU/ASV ವಿಷಯದಲ್ಲಿ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಹರಿವನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುತ್ತದೆ.
● ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ ಸಮುದಾಯ ಅಧ್ಯಯನಗಳಿಗೆ ಅನ್ವಯಿಸುತ್ತದೆ
● BMK ವರ್ಷಕ್ಕೆ 100,000 ಮಾದರಿಗಳೊಂದಿಗೆ ವ್ಯಾಪಕ ಅನುಭವವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಮಣ್ಣು, ನೀರು, ಅನಿಲ, ಕೆಸರು, ಮಲ, ಕರುಳು, ಚರ್ಮ, ಹುದುಗುವಿಕೆಯ ಸಾರು, ಕೀಟಗಳು, ಸಸ್ಯಗಳು, ಇತ್ಯಾದಿ.
● BMKCloud 45 ವೈಯಕ್ತೀಕರಿಸಿದ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಡೇಟಾ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನವನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸಿದೆ
ಸೇವೆಯ ವಿಶೇಷಣಗಳು
| ಅನುಕ್ರಮವೇದಿಕೆ | ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಡೇಟಾ | ತಿರುವು ಸಮಯ |
| PacBio ಸೀಕ್ವೆಲ್ II | SMRT-ಬೆಲ್ | 5K/10K/20K ಟ್ಯಾಗ್‌ಗಳು | 44 ಕೆಲಸದ ದಿನಗಳು |
ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು
● ಕಚ್ಚಾ ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ
● OTU ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್/ಡಿ-ಶಬ್ದ(ASV)
● OTU ಟಿಪ್ಪಣಿ
● ಆಲ್ಫಾ ವೈವಿಧ್ಯ
● ಬೀಟಾ ವೈವಿಧ್ಯತೆ
● ಅಂತರ ಗುಂಪು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
● ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಅಂಶಗಳ ವಿರುದ್ಧ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
● ಫಂಕ್ಷನ್ ಜೀನ್ ಭವಿಷ್ಯ
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು ಮತ್ತು ವಿತರಣೆ
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು:
ಫಾರ್ಡಿಎನ್ಎ ಸಾರಗಳು:
| ಮಾದರಿ ಪ್ರಕಾರ | ಮೊತ್ತ | ಏಕಾಗ್ರತೆ | ಶುದ್ಧತೆ |
| ಡಿಎನ್ಎ ಸಾರಗಳು | ＞ 1 μg | ＞ 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
ಪರಿಸರ ಮಾದರಿಗಳಿಗಾಗಿ:
| ಮಾದರಿ ಪ್ರಕಾರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿಧಾನ |
| ಮಣ್ಣು | ಮಾದರಿ ಪ್ರಮಾಣ: ಅಂದಾಜು.5 ಗ್ರಾಂ;ಉಳಿದಿರುವ ಕಳೆಗುಂದಿದ ವಸ್ತುವನ್ನು ಮೇಲ್ಮೈಯಿಂದ ತೆಗೆದುಹಾಕಬೇಕಾಗಿದೆ;ದೊಡ್ಡ ತುಂಡುಗಳನ್ನು ಪುಡಿಮಾಡಿ ಮತ್ತು 2 ಮಿಮೀ ಫಿಲ್ಟರ್ ಮೂಲಕ ಹಾದುಹೋಗಿರಿ;ಕಾಯ್ದಿರಿಸುವಿಕೆಗಾಗಿ ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಇಪಿ-ಟ್ಯೂಬ್ ಅಥವಾ ಸೈರೋಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಅಲಿಕ್ವಾಟ್ ಮಾದರಿಗಳು. |
| ಮಲ | ಮಾದರಿ ಪ್ರಮಾಣ: ಅಂದಾಜು.5 ಗ್ರಾಂ;ಕಾಯ್ದಿರಿಸುವಿಕೆಗಾಗಿ ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಇಪಿ-ಟ್ಯೂಬ್ ಅಥವಾ ಕ್ರೈಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಆಲ್ಕೋಟ್ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ ಮತ್ತು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ. |
| ಕರುಳಿನ ವಿಷಯಗಳು | ಅಸೆಪ್ಟಿಕ್ ಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸಂಸ್ಕರಿಸಬೇಕಾಗಿದೆ.ಸಂಗ್ರಹಿಸಿದ ಅಂಗಾಂಶವನ್ನು PBS ನೊಂದಿಗೆ ತೊಳೆಯಿರಿ;PBS ಅನ್ನು ಕೇಂದ್ರಾಪಗಾಮಿ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು EP-ಟ್ಯೂಬ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಅವಕ್ಷೇಪಕವನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ. |
| ಕೆಸರು | ಮಾದರಿ ಪ್ರಮಾಣ: ಅಂದಾಜು.5 ಗ್ರಾಂ;ಕಾಯ್ದಿರಿಸುವಿಕೆಗಾಗಿ ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಇಪಿ-ಟ್ಯೂಬ್ ಅಥವಾ ಕ್ರೈಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಆಲ್ಕೋಟ್ ಕೆಸರು ಮಾದರಿಯನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ ಮತ್ತು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ |
| ಜಲಮೂಲ | ಟ್ಯಾಪ್ ನೀರು, ಬಾವಿ ನೀರು, ಇತ್ಯಾದಿಗಳಂತಹ ಸೀಮಿತ ಪ್ರಮಾಣದ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಮಾದರಿಗಾಗಿ, ಕನಿಷ್ಠ 1 ಲೀ ನೀರನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ ಮತ್ತು ಪೊರೆಯ ಮೇಲೆ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯನ್ನು ಸಮೃದ್ಧಗೊಳಿಸಲು 0.22 μm ಫಿಲ್ಟರ್ ಮೂಲಕ ಹಾದುಹೋಗಿರಿ.ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಪೊರೆಯನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ. |
| ಚರ್ಮ | ಕ್ರಿಮಿನಾಶಕ ಹತ್ತಿ ಸ್ವ್ಯಾಬ್ ಅಥವಾ ಸರ್ಜಿಕಲ್ ಬ್ಲೇಡ್‌ನಿಂದ ಚರ್ಮದ ಮೇಲ್ಮೈಯನ್ನು ಎಚ್ಚರಿಕೆಯಿಂದ ಕೆರೆದು ಅದನ್ನು ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ ಇರಿಸಿ. |
ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
3-4 ಗಂಟೆಗಳ ಕಾಲ ದ್ರವ ಸಾರಜನಕದಲ್ಲಿ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಫ್ರೀಜ್ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು ದ್ರವ ಸಾರಜನಕ ಅಥವಾ -80 ಡಿಗ್ರಿಯಲ್ಲಿ ದೀರ್ಘಕಾಲ ಕಾಯ್ದಿರಿಸುವಿಕೆಗೆ ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ.ಡ್ರೈ-ಐಸ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಮಾದರಿ ಶಿಪ್ಪಿಂಗ್ ಅಗತ್ಯವಿದೆ.
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
1.ವಿ3+ವಿ4(ಇಲ್ಯುಮಿನಾ)-ಆಧಾರಿತ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ ಸಮುದಾಯದ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ ವಿರುದ್ಧ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ (ಪ್ಯಾಕ್‌ಬಯೋ) ಆಧಾರಿತ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್‌ನ ಟಿಪ್ಪಣಿ ದರ.
(30 ಯಾದೃಚ್ಛಿಕವಾಗಿ ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿದ ಯೋಜನೆಗಳ ಡೇಟಾವನ್ನು ಅಂಕಿಅಂಶಗಳಿಗಾಗಿ ಅನ್ವಯಿಸಲಾಗಿದೆ)
2.ವಿವಿಧ ಮಾದರಿ ಪ್ರಕಾರಗಳಲ್ಲಿ ಜಾತಿ-ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಪೂರ್ಣ-ಉದ್ದದ ಆಂಪ್ಲಿಕಾನ್ ಅನುಕ್ರಮದ ಟಿಪ್ಪಣಿ ದರ
3.ಜಾತಿಗಳ ವಿತರಣೆ
4.ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರ
ಬಿಎಂಕೆ ಪ್ರಕರಣ
ಆರ್ಸೆನಿಕ್ ಮಾನ್ಯತೆ ಕರುಳಿನ ತಡೆಗೋಡೆ ಹಾನಿಯನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅದರ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಕರುಳಿನ-ಯಕೃತ್ತಿನ ಅಕ್ಷವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಬಾತುಕೋಳಿಗಳಲ್ಲಿ ಯಕೃತ್ತಿನ ಉರಿಯೂತ ಮತ್ತು ಪೈರೋಪ್ಟೋಸಿಸ್ಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ
ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಗಿದೆ:ಒಟ್ಟು ಪರಿಸರ ವಿಜ್ಞಾನ,2021
ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ:
ಮಾದರಿಗಳು: ನಿಯಂತ್ರಣ ವಿರುದ್ಧ 8 mg/kg ATO ಬಹಿರಂಗ ಗುಂಪು
ಅನುಕ್ರಮ ಡೇಟಾ ಇಳುವರಿ: ಒಟ್ಟು 102,583 ಕಚ್ಚಾ CCS ಅನುಕ್ರಮಗಳು
ನಿಯಂತ್ರಣ: 54,518 ± 747 ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ CCS
ATO-ಎಕ್ಸ್ಪೋಸ್ಡ್ : 45,050 ± 1675 ಪರಿಣಾಮಕಾರಿ CCS
ಪ್ರಮುಖ ಫಲಿತಾಂಶಗಳು
ಆಲ್ಫಾ ವೈವಿಧ್ಯ:ATO ಮಾನ್ಯತೆ ಬಾತುಕೋಳಿಗಳಲ್ಲಿನ ಕರುಳಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಶ್ರೀಮಂತಿಕೆ ಮತ್ತು ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಬದಲಾಯಿಸಿತು.
ಮೆಟಾಸ್ಟಾಟ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ:
ಫೈಲಮ್ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ: 2 ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಫೈಲಾ ನಿಯಂತ್ರಣ ಗುಂಪುಗಳಲ್ಲಿ ಮಾತ್ರ ಪತ್ತೆಯಾಗಿದೆ
ಕುಲದ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ: ಸಾಪೇಕ್ಷ ಸಮೃದ್ಧಿಯಲ್ಲಿ 6 ಕುಲಗಳು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿವೆ
ಜಾತಿಯ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ: ಒಟ್ಟು 36 ಜಾತಿಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ 6 ರಿಲೇವ್ ಹೇರಳವಾಗಿ ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿವೆ
ಉಲ್ಲೇಖ
ಥಿಂಗ್ಹೋಮ್, ಎಲ್ಬಿ, ಮತ್ತು ಇತರರು."ಟೈಪ್ 2 ಡಯಾಬಿಟಿಸ್ ಹೊಂದಿರುವ ಮತ್ತು ಇಲ್ಲದ ಬೊಜ್ಜು ವ್ಯಕ್ತಿಗಳು ವಿಭಿನ್ನ ಕರುಳಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಸಾಮರ್ಥ್ಯ ಮತ್ತು ಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತಾರೆ."ಸೆಲ್ ಹೋಸ್ಟ್ ಮತ್ತು ಮೈಕ್ರೋಬ್26.2(2019)
