ಉಲ್ಲೇಖ-ಅಲ್ಲದ mRNA ಅನುಕ್ರಮ-NGS
ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳು
● ಗ್ರಂಥಾಲಯ ಸಿದ್ಧತೆಗೆ ಮುನ್ನ ಪಾಲಿ mRNA ಸೆರೆಹಿಡಿಯುವಿಕೆ
● ಯಾವುದೇ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ನಿಂದ ಸ್ವತಂತ್ರ: ಪ್ರತಿಲಿಪಿಗಳ ಡಿ ನೊವೊ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಆಧರಿಸಿ, ಬಹು ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾದ ಯುನಿಜೀನ್ಗಳ ಪಟ್ಟಿಯನ್ನು ರಚಿಸುವುದು (NR, ಸ್ವಿಸ್-ಪ್ರೋಟ್, COG, KOG, ಎಗ್ಎನ್ಒಜಿ, ಪಿಎಫ್ಎಎಂ, GO, KEGG)
● ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಲಿಪಿ ರಚನೆಯ ಸಮಗ್ರ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಸೇವೆಯ ಅನುಕೂಲಗಳು
● ● ದಶಾವ್ಯಾಪಕ ಪರಿಣತಿ: BMKGENE ನಲ್ಲಿ 600,000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸಂಸ್ಕರಿಸಿದ ದಾಖಲೆಯೊಂದಿಗೆ, ಕೋಶ ಸಂಸ್ಕೃತಿಗಳು, ಅಂಗಾಂಶಗಳು ಮತ್ತು ದೇಹದ ದ್ರವಗಳಂತಹ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಮಾದರಿ ಪ್ರಕಾರಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ, ನಮ್ಮ ತಂಡವು ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಯೋಜನೆಗೂ ಅನುಭವದ ಸಂಪತ್ತನ್ನು ತರುತ್ತದೆ. ನಾವು ವಿವಿಧ ಸಂಶೋಧನಾ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿ 100,000 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು mRNA-Seq ಯೋಜನೆಗಳನ್ನು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಮುಚ್ಚಿದ್ದೇವೆ.
● ● ದಶಾಕಠಿಣ ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ: ಮಾದರಿ ಮತ್ತು ಗ್ರಂಥಾಲಯ ತಯಾರಿಕೆಯಿಂದ ಹಿಡಿದು ಅನುಕ್ರಮ ಮತ್ತು ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ವರೆಗೆ ಎಲ್ಲಾ ಹಂತಗಳಲ್ಲಿ ನಾವು ಕೋರ್ ನಿಯಂತ್ರಣ ಬಿಂದುಗಳನ್ನು ಕಾರ್ಯಗತಗೊಳಿಸುತ್ತೇವೆ. ಈ ನಿಖರವಾದ ಮೇಲ್ವಿಚಾರಣೆಯು ಸ್ಥಿರವಾಗಿ ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಫಲಿತಾಂಶಗಳ ವಿತರಣೆಯನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸುತ್ತದೆ.
● ಸಮಗ್ರ ಟಿಪ್ಪಣಿ: ನಾವು ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು (DEG ಗಳು) ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ಅನುಗುಣವಾದ ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಲು ಬಹು ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತೇವೆ, ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯ ಆಧಾರವಾಗಿರುವ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಮತ್ತು ಆಣ್ವಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳ ಕುರಿತು ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತೇವೆ.
● ● ದಶಾಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಬೆಂಬಲ: ನಮ್ಮ ಬದ್ಧತೆಯು 3 ತಿಂಗಳ ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವಾ ಅವಧಿಯೊಂದಿಗೆ ಯೋಜನೆಯ ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಮೀರಿ ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಫಲಿತಾಂಶಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಯಾವುದೇ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳನ್ನು ಪರಿಹರಿಸಲು ನಾವು ಯೋಜನೆಯ ಅನುಸರಣೆ, ದೋಷನಿವಾರಣೆ ಸಹಾಯ ಮತ್ತು ಪ್ರಶ್ನೋತ್ತರ ಅವಧಿಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತೇವೆ.
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು ಮತ್ತು ವಿತರಣೆ
| ಗ್ರಂಥಾಲಯ | ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರ | ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಡೇಟಾ | ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಣ |
| ಪಾಲಿ ಎ ಪುಷ್ಟೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ | ಇಲ್ಯುಮಿನಾ PE150 ಡಿಎನ್ಬಿಎಸ್ಇಕ್ಯೂ-ಟಿ7 | 6-10 ಜಿಬಿ | ಕ್ಯೂ30≥85% |
ಮಾದರಿ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳು:
ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು:
| ಒಟ್ಟು (ng/μl) | ಪ್ರಮಾಣ (μg) | ಶುದ್ಧತೆ | ಸಮಗ್ರತೆ |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | ಓಡಿ260/280=1.7-2.5 ಓಡಿ260/230=0.5-2.5 ಜೆಲ್ ಮೇಲೆ ತೋರಿಸಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಥವಾ ಡಿಎನ್ಎ ಮಾಲಿನ್ಯ ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಇಲ್ಲ. | ಸಸ್ಯಗಳಿಗೆ: RIN≥4.0; ಪ್ರಾಣಿಗಳಿಗೆ: RIN≥4.5; 5.0≥28ಎಸ್/18ಎಸ್≥1.0; ಸೀಮಿತ ಅಥವಾ ಮೂಲ ಎತ್ತರವಿಲ್ಲ |
● ಸಸ್ಯಗಳು:
ಬೇರು, ಕಾಂಡ ಅಥವಾ ದಳ: 450 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಎಲೆ ಅಥವಾ ಬೀಜ: 300 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಹಣ್ಣು: 1.2 ಗ್ರಾಂ
● ಪ್ರಾಣಿ:
ಹೃದಯ ಅಥವಾ ಕರುಳು: 300 ಮಿಗ್ರಾಂ
ವಿಸ್ಸೆರಾ ಅಥವಾ ಮೆದುಳು: 240 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಸ್ನಾಯು: 450 ಮಿಗ್ರಾಂ
ಮೂಳೆಗಳು, ಕೂದಲು ಅಥವಾ ಚರ್ಮ: 1 ಗ್ರಾಂ
● ಆರ್ತ್ರೋಪಾಡ್ಗಳು:
ಕೀಟಗಳು: 6 ಗ್ರಾಂ
ಕ್ರಸ್ಟೇಸಿಯಾ: 300 ಮಿಗ್ರಾಂ
● ಸಂಪೂರ್ಣ ರಕ್ತ: 1 ಟ್ಯೂಬ್
● ಕೋಶಗಳು: 106 ಜೀವಕೋಶಗಳು
ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಕಂಟೇನರ್: 2 ಮಿಲಿ ಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್ (ಟಿನ್ ಫಾಯಿಲ್ ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿಲ್ಲ)
ಮಾದರಿ ಲೇಬಲಿಂಗ್: ಗುಂಪು+ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಉದಾ. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
ಸಾಗಣೆ:
1. ಡ್ರೈ-ಐಸ್: ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಚೀಲಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ಯಾಕ್ ಮಾಡಿ ಡ್ರೈ-ಐಸ್ನಲ್ಲಿ ಹೂಳಬೇಕು.
2. ಆರ್ಎನ್ಎಸ್ಟೇಬಲ್ ಟ್ಯೂಬ್ಗಳು: ಆರ್ಎನ್ಎ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಟೆಬಿಲೈಸೇಶನ್ ಟ್ಯೂಬ್ನಲ್ಲಿ ಒಣಗಿಸಬಹುದು (ಉದಾ ಆರ್ಎನ್ಎಸ್ಟೇಬಲ್®) ಮತ್ತು ಕೋಣೆಯ ಉಷ್ಣಾಂಶದಲ್ಲಿ ರವಾನಿಸಬಹುದು.
ಸೇವಾ ಕೆಲಸದ ಹರಿವು
ಪ್ರಯೋಗ ವಿನ್ಯಾಸ
ಮಾದರಿ ವಿತರಣೆ
ಆರ್ಎನ್ಎ ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆ
ಗ್ರಂಥಾಲಯ ನಿರ್ಮಾಣ
ಅನುಕ್ರಮ
ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ
ಮಾರಾಟದ ನಂತರದ ಸೇವೆಗಳು
ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್
ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಜೋಡಣೆ ಮತ್ತು ಏಕಜೀನ್ ಆಯ್ಕೆ
ಯುನಿಜೀನ್ ಟಿಪ್ಪಣಿ
ಮಾದರಿ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಪ್ರತಿಕೃತಿಗಳ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ
ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಜೀನ್ಗಳು (DEG ಗಳು)
DEG ಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ
DEG ಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪುಷ್ಟೀಕರಣ
BMKGene ನ ಯುಕ್ಯಾರಿಯೋಟಿಕ್ NGS mRNA ಅನುಕ್ರಮ ಸೇವೆಗಳಿಂದ ಸುಗಮಗೊಳಿಸಲಾದ ಪ್ರಗತಿಗಳನ್ನು ಪ್ರಕಟಣೆಗಳ ಸಂಗ್ರಹದ ಮೂಲಕ ಅನ್ವೇಷಿಸಿ.
ಶೆನ್, ಎಫ್. ಮತ್ತು ಇತರರು (2020) 'ಅಮುರ್ ಕ್ಯಾಟ್ಫಿಶ್ (ಸಿಲುರಸ್ ಅಸೋಟಸ್) ನ ಗೊನಾಡ್ಗಳಲ್ಲಿ ಡಿ ನೊವೊ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಮತ್ತು ಲೈಂಗಿಕ-ಪಕ್ಷಪಾತ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ', ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್, 112(3), ಪುಟಗಳು 2603–2614. doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.
ಜಾಂಗ್, ಸಿ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2016) 'ಈರುಳ್ಳಿಯಲ್ಲಿ ಬಲ್ಬ್ ಊತ ಮತ್ತು ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಸುಕ್ರೋಸ್ ಚಯಾಪಚಯ ಕ್ರಿಯೆಯ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (ಆಲಿಯಮ್ ಸೆಪಾ ಎಲ್.)', ಫ್ರಾಂಟಿಯರ್ಸ್ ಇನ್ ಪ್ಲಾಂಟ್ ಸೈನ್ಸ್, 7(ಸೆಪ್ಟೆಂಬರ್), ಪುಟ 212763. doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.
ಝು, ಸಿ. ಮತ್ತು ಇತರರು (2017) 'ಸಾರ್ಕೊಚೈಲಿಚ್ತಿಸ್ ಸಿನೆನ್ಸಿಸ್ನ ಪ್ರತಿಲೇಖನಕ್ಕಾಗಿ ಡಿ ನೊವೊ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ, ಗುಣಲಕ್ಷಣ ಮತ್ತು ಟಿಪ್ಪಣಿ', PLoS ONE, 12(2). doi: 10.1371/ಜರ್ನಲ್.ಪೋನ್.0171966.
ಝೌ, ಎಲ್. ಮತ್ತು ಇತರರು (2021) 'ಡಿ ನೊವೊ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಲವಣಾಂಶದ ಒತ್ತಡದಲ್ಲಿ ಪೊಡೊಕಾರ್ಪಸ್ ಮ್ಯಾಕ್ರೋಫಿಲ್ಲಸ್ನ ಉಪ್ಪು ಸಹಿಷ್ಣುತೆಯ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ', ಬಿಎಂಸಿ ಸಸ್ಯ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ, 21(1), ಪುಟಗಳು 1–17. doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9.
