BMKCloud Log in
条形baneris-03

Produktai

Eukariotinės mRNR sekos nustatymas-Illumina

mRNR sekos nustatymas leidžia profiliuoti visas mRNR, transkribuotas iš ląstelių tam tikromis sąlygomis.Tai galinga technologija, atskleidžianti genų ekspresijos profilį, genų struktūras ir tam tikrų biologinių procesų molekulinius mechanizmus.Iki šiol mRNR sekos nustatymas buvo plačiai naudojamas fundamentiniuose tyrimuose, klinikinėje diagnostikoje, vaistų kūrime ir kt.

Platforma: „Illumina NovaSeq“ platforma


Paslaugos informacija

Bioinformatika

Demonstraciniai rezultatai

Privalumai

● Didelė patirtis: BMK buvo apdorota daugiau nei 200 000 mėginių, apimančių įvairius mėginių tipus, įskaitant ląstelių kultūrą, audinius, kūno skysčius ir kt., o uždaryta daugiau nei 7 000 mRNA-Seq projektų, apimančių įvairias tyrimų sritis.

● Griežta kokybės kontrolės sistema: norint gauti aukštos kokybės rezultatus, pagrindiniai kokybės kontrolės taškai, atliekant visus etapus, įskaitant mėginių paruošimą, bibliotekos paruošimą, sekos nustatymą ir bioinformatiką, yra atidžiai stebimi.

● Galimos kelios duomenų bazės funkcijų anotavimo ir praturtinimo tyrimams, kad būtų pasiekti įvairūs tyrimo tikslai.

● Paslaugos po pardavimo: Po pardavimo paslaugos galioja 3 mėnesius po projekto užbaigimo, įskaitant projekto stebėjimą, trikčių šalinimą, rezultatų klausimus ir atsakymus ir kt.

Pavyzdžių reikalavimai ir pristatymas

biblioteka Sekos nustatymo strategija Rekomenduojami duomenys Kokybės kontrolė
Poli A praturtintas Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85 %

Pavyzdiniai reikalavimai:

Nukleotidai:

Konc. (ng/μl)

Kiekis (μg)

Grynumas

Sąžiningumas

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Ant gelio rodomas ribotas baltymų ar DNR užterštumas arba jo nėra.

Augalams: RIN≥6,5;

Gyvūnams: RIN≥7,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

ribotas arba jo nėra

Audinys: Svoris (sausas):≥1 g
*Audiniams, kurių svoris mažesnis nei 5 mg, rekomenduojame siųsti greitai užšaldytą (skystame azotu) audinių mėginį.

Ląstelių suspensija:Ląstelių skaičius = 3×106- 1 × 107
*Rekomenduojame siųsti šaldytą ląstelių lizatą.Jei tų ląstelių skaičius mažesnis nei 5×105.

Kraujo mėginiai:Tūris≥1 ml

Mikroorganizmas:Masė ≥ 1 g

Rekomenduojamas pavyzdžių pristatymas

Talpykla: 2 ml centrifugos mėgintuvėlis (Alavo folija nerekomenduojama)

Mėginio ženklinimas: Grupė+pakartojimas pvz. A1, A2, A3;B1, B2, B3.....

Siuntimas:

  1. Sausas ledas: Mėginius reikia supakuoti į maišus ir palaidoti sausame lede.
  2. RNR stabilūs mėgintuvėliai: RNR mėginius galima džiovinti RNR stabilizavimo mėgintuvėlyje (pvz., RNAstable®) ir gabenti kambario temperatūroje.

Aptarnavimo darbų eiga

QC pavyzdys

Eksperimento dizainas

pavyzdžio pristatymas

Mėginio pristatymas

Pilotinis eksperimentas

RNR ekstrahavimas

Bibliotekos paruošimas

Bibliotekos statyba

Sekos nustatymas

Sekos nustatymas

Duomenų analizė

Duomenų analizė

Paslaugos po pardavimo

Paslaugos po pardavimo


  • Ankstesnis:
  • Kitas:

  • Bioinformatika

    wps_doc_10

    Eukariotas mRNR sekos analizės darbo eiga

    Bioinformatika

    ØNeapdorotų duomenų kokybės kontrolė

    ØEtaloninis genomo derinimas

    ØNuorašo struktūros analizė

    ØIšraiškos kiekybinis įvertinimas

    ØDiferencialinės išraiškos analizė

    ØFunkcijų anotacija ir praturtinimas

    1.mRNR duomenų prisotinimo kreivė

    3 straipsnio 1 dalis

    2.Diferencialinės išraiškos analizė-Vulkano brėžinys

    4 straipsnio 1 dalis

    3.KEGG anotacija ant DEG

    5 straipsnio 1 dalis

    4.GO klasifikacija pagal DEG

    6 straipsnio 1 dalis

    gauti citatą

    Parašykite savo žinutę čia ir atsiųskite mums

    Siųskite mums savo žinutę: