page_head_bg

Produktai

Eukariotinės mRNR sekos nustatymas - Illumina

mRNR sekos nustatymas leidžia profiliuoti visas mRNR, transkribuotas iš ląstelių tam tikromis sąlygomis.Tai galinga technologija, atskleidžianti genų ekspresijos profilį, genų struktūras ir tam tikrų biologinių procesų molekulinius mechanizmus.Iki šiol mRNR sekos nustatymas buvo plačiai naudojamas fundamentiniuose tyrimuose, klinikinėje diagnostikoje, vaistų kūrime ir kt.

Platforma: Illumina NovaSeq 6000


Paslaugos informacija

Bioinformatika

Demonstraciniai rezultatai

Privalumai

ØDidelė patirtis: BMK buvo apdorota daugiau nei 200 000 mėginių, apimančių įvairius mėginių tipus, įskaitant ląstelių kultūrą, audinius, kūno skysčius ir kt., ir daugiau nei 7 000 mRNA-Seq projektų, apimančių įvairias tyrimų sritis.

ØGriežta kokybės kontrolės sistema: siekiant gauti aukštos kokybės rezultatus, pagrindiniai kokybės kontrolės taškai, atliekantys visus etapus, įskaitant mėginių paruošimą, bibliotekos paruošimą, sekos nustatymą ir bioinformatiką.

ØGalimos kelios duomenų bazės, skirtos funkcijų anotacijai ir sodrinimo tyrimams, siekiant įgyvendinti įvairius tyrimo tikslus.

ØPaslaugos po pardavimo: Paslaugos po pardavimo galioja 3 mėnesius po projekto užbaigimo, įskaitant projekto stebėjimą, trikčių šalinimą, rezultatų klausimus ir atsakymus ir kt.

Pavyzdžių reikalavimai ir pristatymas

biblioteka Sekos nustatymo strategija Rekomenduojami duomenys Kokybės kontrolė
Poli A praturtintas Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85 %

Pavyzdiniai reikalavimai:

Nukleotidai:

Grynumas Sąžiningumas Suma
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Ant gelio rodomas ribotas baltymų ar DNR užterštumas arba jo nėra. Augalams: RIN≥6,5;Gyvūnams: RIN≥7;28S/18S≥1,0;ribotas arba jo nėra Konc.≥30 ng/μl;Tūris ≥ 10 μl;Iš viso ≥ 1,5 μg

Audinys: Svoris (sausas):≥1 g
*Audiniams, kurių svoris mažesnis nei 5 mg, rekomenduojame siųsti greitai užšaldytą (skystame azotu) audinių mėginį.

Ląstelių suspensija:Ląstelių skaičius = 3×106- 1 × 107
*Rekomenduojame siųsti šaldytą ląstelių lizatą.Jei ląstelių skaičius mažesnis nei 5 × 105, rekomenduojamas greitas užšaldymas skystame azote, kuris yra tinkamesnis mikro ekstrahavimui.

Kraujo mėginiai:Tūris≥1 ml

Mikroorganizmas:Masė ≥ 1 g

Rekomenduojamas pavyzdžių pristatymas

Talpykla: 2 ml centrifugos mėgintuvėlis (Alavo folija nerekomenduojama)

Mėginio ženklinimas: Grupė+pakartojimas pvz. A1, A2, A3;B1, B2, B3.....

Siuntimas:

  1. Sausas ledas: Mėginiai turi būti supakuoti į maišus ir palaidoti sausame lede.
  2. RNR stabilūs mėgintuvėliai: RNR mėginius galima džiovinti RNR stabilizavimo mėgintuvėlyje (pvz., RNAstable®) ir gabenti kambario temperatūroje.

Aptarnavimo darbų eiga

logo_01

Eksperimento dizainas

logo_02

Mėginio pristatymas

logo_03

RNR ekstrahavimas

logo_04

Bibliotekos statyba

logo_05

Sekos nustatymas

logo_06

Duomenų analizė

logo_07

Paslaugos po pardavimo


  • Ankstesnis:
  • Kitas:

  • Bioinformatika

    2(1)

    Eukariotas mRNR sekos analizės darbo eiga

    Bioinformatika

    ØNeapdorotų duomenų kokybės kontrolė

    ØEtaloninis genomo derinimas

    ØNuorašo struktūros analizė

    ØIšraiškos kiekybinis įvertinimas

    ØDiferencialinės išraiškos analizė

    ØFunkcijų anotacija ir praturtinimas

    1.mRNR duomenų prisotinimo kreivė

    3(1)

    2.Diferencialinės išraiškos analizė-Vulkano brėžinys

    4(1)

    3.KEGG anotacija ant DEG

    5(1)

    4.GO klasifikacija pagal DEG

    6(1)

    gauti citatą

    Parašykite savo žinutę čia ir atsiųskite mums

    Siųskite mums savo žinutę: