Metatranskripto sekos nustatymas
Aptarnavimo funkcijos
● RRNR išeikvojimas, po kurio seka kryptinė mRNR bibliotekos paruošimas.
● „Illumina NovaSeq“ sekos nustatymas.
Aptarnavimo pranašumai
●Ištirkite sudėtingų mikrobų bendruomenių pokyčius:Tai atsitinka transkripcijos lygiu ir tiria galimus naujus genus.
●Paaiškinti mikrobų bendruomenės sąveiką su šeimininku ar aplinka.
●Išsami bioinformatinė analizė: Tai suteikia įžvalgos apie bendruomenės taksonomines ir funkcines kompozicijas, taip pat diferencinės genų išraiškos analizę.
●Platus genų anotacija:Naudojant naujausius genų funkcijų duomenų bazes, skirtas informatyvioms genų ekspresijos informacija apie mikrobų bendruomenes.
●Palaikymas po pardavimo:Mūsų įsipareigojimas apima ne tik projekto pabaigą su 3 mėnesių aptarnavimo laikotarpiu po pardavimo. Per tą laiką mes siūlome projekto tolesnius veiksmus, pagalbą trikčių šalinimui ir klausimų ir atsakymų sesijoms, kad išspręstume bet kokius su rezultatus susijusius klausimus.
Aptarnavimo specifikacijos
| Sekos platforma | Sekos strategija | Rekomenduojami duomenys | Duomenų kokybės kontrolė |
| „Illumina NovaSeq“ | PE150 | 12 GB | Q30≥85% |
Imties reikalavimai
| Koncentracija (ng/µl) | Bendras kiekis (µg) | Tūris (µL) | OD260/280 | OD260/230 | Rinas |
| ≥50 | ≥1,0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1,0–2,5 | ≥6,5 |
Aptarnavimo darbo srautas
Mėginio pristatymas
Bibliotekos statyba
Sekos nustatymas
Duomenų analizė
Paslaugos po pardavimo
Apima šią analizę:
● Duomenų kokybės kontrolė seka
● Transkripto rinkinys
● Takotacija ir gausa
● Funkcinis anotacija ir gausa
● išraiškos kiekybinis įvertinimas ir diferencinė analizė
Kiekvieno imties taksonominis pasiskirstymas:
Beta įvairovės analizė: UPGMA
Funkcinė anotacija - eikite gausu
Diferencinės taksonomijos gausa - LEFSE
Ištirkite pasiekimus, kuriuos palengvina Bmkgene meta transkriptikos sekos nustatymo paslaugos per kurtą leidinių kolekciją.
Lu, Z. ir kt. (2023 m.) „Laktatų vartojimo bakterijų rūgšties tolerancija Bacteroidales prisideda prie atrajolinės acidozės prevencijos ožkose, pritaikytose dietos aukštai concentruojančiai“, “,-“,Gyvūnų mityba, 14, p. 130–140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.
Daina, Z. et al. )Mikrobiologijos sienos, 8 (liepa). doi: 10.3389/fmicb.2017.01294/pilnas.
Wang, W. et al. (2022) „Nauji mikovirusai, aptikti iš fitopatogeninės alternarinės grybelio metatranskriptomikos tyrimo“,Virusai, 14 (11), p. 2552. Doi: 10.3390/v14112552/s1.
Wei, J. ir kt. (2022) „Lygiagrečios metatranskripto analizė atskleidžia augalų antrinių metabolitų skilimą vabalais ir jų žarnyno simbiontais“,Molekulinė Ekologija, 31 (15), p. 3999–4016. doi: 10.1111/mec.16557.
