Metagenomika (NGS)

Šautuvo metagenomika su „Illumina“ yra populiarus įrankis mikrobiomoms tirti, tiesiogiai seka DNR iš sudėtingų mėginių, leidžiančių tirti ir taksonominę, ir funkcinę įvairovę. „BMKCloud Metagenomic“ (NGS) dujotiekis prasideda nuo kokybės kontrolės ir metagenomų surinkimo, iš kurio prognozuojami genai ir suskirstomi į neatsiejamus duomenų rinkinius, kurie yra anotuoti funkcijai ir taksonomijai, naudojant kelias duomenų bazes. Ši informacija naudojama analizuoti taksonominės įvairovės (alfa įvairovę) ir tarp imties įvairovės (beta įvairovė). Diferencinė analizė tarp grupių nustato OTU ir biologines funkcijas, kurios skiriasi abiejų grupių, naudojant ir parametrinius, ir neparametrinius testus, o koreliacijos analizė sieja šiuos skirtumus su aplinkos veiksniais.