Ilgas nekoduojantis sekvenavimas-Illumina
Paslaugos privalumai
●Bendra mRNR ir lncRNR analizė: derinant mRNR transkriptų kiekybinį nustatymą su lncRNR ir jų taikinių tyrimu, galima gauti išsamią reguliavimo mechanizmo, kuriuo grindžiamas ląstelių atsakas, apžvalgą.
●Plati ekspertizė: Mūsų komanda kiekvienam projektui suteikia daug patirties, o BMK apdorojant daugiau nei 23 000 mėginių, apimančių įvairius mėginių tipus ir lncRNA projektus.
●Griežta kokybės kontrolė: Diegiame pagrindinius valdymo taškus visuose etapuose, nuo mėginių ir bibliotekos paruošimo iki sekos nustatymo ir bioinformatikos. Šis kruopštus stebėjimas užtikrina nuolatinių aukštos kokybės rezultatų teikimą.
●Pagalba po pardavimo: Mūsų įsipareigojimas apima ne tik projekto užbaigimą, bet ir 3 mėnesių aptarnavimo po pardavimo laikotarpį. Per šį laiką siūlome tolesnius projekto veiksmus, trikčių šalinimo pagalbą ir klausimų ir atsakymų sesijas, kad galėtume atsakyti į visas su rezultatais susijusias užklausas.
Pavyzdžių reikalavimai ir pristatymas
| biblioteka | Platforma | Rekomenduojami duomenys | Duomenų kokybės užtikrinimas |
| rRNR išeikvota kryptinė biblioteka | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85 % |
Nukleotidai:
| Konc. (ng/μl) | Kiekis (μg) | Grynumas | Sąžiningumas |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ant gelio rodomas ribotas baltymų ar DNR užterštumas arba jo nėra. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; ribotas arba jo nėra |
● Augalai:
Šaknis, stiebas arba žiedlapis: 450 mg
Lapai arba sėklos: 300 mg
Vaisiai: 1,2 g
● Gyvūnas:
Širdis arba žarnynas: 450 mg
Viscera arba smegenys: 240 mg
Raumenys: 600 mg
Kaulai, plaukai arba oda: 1,5 g
● Nariuotakojai:
Vabzdžiai: 9g
Vėžiagyviai: 450 mg
● Visas kraujas:2 vamzdeliai
● Ląstelės: 106 ląstelės
● Serumas ir plazma: 6 ml
Rekomenduojamas pavyzdžių pristatymas
Talpykla: 2 ml centrifugos mėgintuvėlis (Alavo folija nerekomenduojama)
Mėginio ženklinimas: Grupė+pakartojimas pvz. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Siuntimas:
1. Sausas ledas: Mėginiai turi būti supakuoti į maišus ir užkasti sausajame lede.
2. RNR stabilūs mėgintuvėliai: RNR mėginius galima džiovinti RNR stabilizavimo mėgintuvėlyje (pvz., RNAstable®) ir gabenti kambario temperatūroje.
Aptarnavimo darbų eiga
Eksperimento dizainas
Mėginio pristatymas
RNR ekstrahavimas
Bibliotekos statyba
Sekos nustatymas
Duomenų analizė
Paslaugos po pardavimo
Bioinformatika
Diferencialinės genų ekspresijos (DEG) analizė
LncRNR ekspresijos kiekybinis įvertinimas – klasterizavimas
LncRNR tikslinių genų praturtinimas
Jungtinės mRNR ir lncRNR padėties analizė – Circos diagrama (vidurinis ratas yra mRNR, o vidinis ciklinis yra lncRNR)
Naršykite pažangą, kurią palengvino BMKGene lncRNR išlyginimo paslaugos, naudodami kuruojamą leidinių kolekciją.
Ji, H. ir kt. (2020) „Su šaltu stresu susijusių lncRNR identifikavimas, funkcinis numatymas ir pagrindinė lncRNR patikra žiurkių kepenyse“, Scientific Reports 2020, 10:1, 10(1), p. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. ir kt. (2021) „Integracinė transkriptominė analizė atskleidžia CyHV-3 atsparios paprastosios karpių padermės imuninį mechanizmą“, „Frontiers in Immunology“, 12, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ ir kt. (2022) „Kelių omikų integracija pagrįstas konkuruojančių endogeninių RNR reguliavimo tinklų prioritetų suteikimas sergant smulkialąsteliniu plaučių vėžiu: molekulinės charakteristikos ir kandidatai į vaistus“, „Onkologijos sienos“, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. ir kt. (2020) „Genų koekspresijos tinklo, kuriuo grindžiama Populus fotosintezė, genetinis išskaidymas“, Augalų biotechnologijos žurnalas, 18 (4), p. 1015–1026. doi: 10.1111 / PBI.13270.
Zheng, H. ir kt. (2022) „Pasaulinis reguliavimo tinklas, skirtas sutrikusios genų ekspresijos ir nenormalaus metabolizmo signalizavimui imuninėse ląstelėse Graveso ligos ir Hashimoto tiroidito mikroaplinkoje“, „Frontiers in Immunology“, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
