mRNR seka (NGS) su etaloniniu genomu
RNR sekoskaita yra standartinė priemonė, naudojama gyvybės ir augalininkystės moksluose, jungianti genomus ir proteomas. Jos stiprybė slypi naujų transkriptų atradime ir jų raiškos kiekybiniame įvertinime vienu tyrimu. Ji plačiai naudojama lyginamiesiems transkriptominiams tyrimams, nušviečiant genus, susijusius su įvairiais požymiais ar fenotipais, pavyzdžiui, lyginant mutantus su laukiniais tipais arba atskleidžiant genų raišką tam tikromis sąlygomis. „BMKCloud mRNA(Reference)“ programėlė integruoja raiškos kiekybinį įvertinimą, diferencinės raiškos analizę (DEG) ir sekos struktūros analizę į mRNA-seq(NGS) bioinformatikos procesą ir sujungia panašios programinės įrangos stipriąsias puses, užtikrindama patogumą ir paprastumą. Vartotojai gali įkelti savo RNR sekoskaitos duomenis į debesį, kur programėlė siūlo išsamų, vieno langelio bioinformatikos analizės sprendimą. Be to, ji teikia pirmenybę klientų patirčiai, siūlydama suasmenintas operacijas, pritaikytas konkretiems vartotojų poreikiams. Vartotojai gali patys nustatyti parametrus ir pateikti procesą, patikrinti interaktyvią ataskaitą, peržiūrėti duomenis / diagramas ir atlikti duomenų gavybą, pvz., tikslinio geno pasirinkimą, funkcinį klasterizavimą, diagramų sudarymą ir kt.
Platforma:Illumina, MGI
Strategija:RNR-sekvenavimas
Išdėstymas: Suporuoti, švarūs duomenys.
Bibliotekos tipas:fr-nesujungta, fr-pirmoji arba fr-antroji grandinė
Skaitymo ilgis:150 bp
Failo tipas:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz arba *.fq.gz. Sistemaautomatiškai suporuoja .fastq failus pagal jų pavadinimus,pvz., *_1.fastq suporuotas su *._2.fastq.
Mėginių skaičius:Skaičiui nėra jokių apribojimųmėginių, tačiau analizės laikas ilgės didėjant mėginių skaičiuimėginiai auga.
Rekomenduojamas duomenų kiekis:6G vienam mėginiui
