Šilumos žemėlapis
Matricos duomenų failas naudojamas šilumos žemėlapio piešimui, kuris gali filtruoti, normalizuoti ir sugrupuoti matricos duomenis.Jis dažniausiai naudojamas genų ekspresijos lygio tarp skirtingų mėginių klasterinei analizei.
Genų anotacija
Genų funkcijos anotacija atliekama susiejant sekas FASTA faile su įvairia duomenų baze.
Genų anotacija
Pagrindinis vietos lygiavimo paieškos įrankis
CDS_UTR_Numatymas
Šis įrankis skirtas numatyti koduojančius regionus (CDS) ir nekoduojančius regionus (UTR) tam tikrose transkripto sekose, remiantis žinomos baltymų duomenų bazės ir ORF prognozėmis.
Manheteno siužetas
Manheteno sklypas leidžia rodyti duomenis su daugybe duomenų taškų.Jis dažniausiai naudojamas viso genomo asociacijos tyrimuose (GWAS).
Cirkos
CIRCOS diagrama leidžia tiesiogiai pateikti SNP, InDeL, SV, CNV pasiskirstymą genome.
GO_Enrichment
TopGO yra įrankis, skirtas funkcionalumui praturtinti.TopGO-Bioconductor paketą sudaro diferencinės išraiškos analizė, GO sodrinimo analizė ir rezultatų vizualizacija.Jis sugeneruos aplanką su išvestimi pavadinimu „Grafas“, kuriame bus topGO_BP, topGO_CC ir topGO_MF rezultatai.
WGCNA
WGCNA yra plačiai naudojamas duomenų gavybos metodas genų koekspresijos moduliams atrasti.Jis taikomas įvairiems ekspresijos duomenų rinkiniams, įskaitant „microarray“ duomenis ir genų ekspresijos duomenis, gautus iš naujos kartos sekos nustatymo.
InterProScan
InterPro baltymų sekos analizė ir klasifikavimas
GO_KEGG_Sodrinimas
Šis įrankis skirtas generuoti GO sodrinimo histogramą, KEGG sodrinimo histogramą ir KEGG sodrinimo kelią, remiantis pateiktu genų rinkiniu ir atitinkama anotacija.