-
Viso genomo asociacijos analizė
Genomo masto asociacijos tyrimas (GWAS) skirtas nustatyti genetinius variantus (genotipus), susijusius su specifiniais bruožais (fenotipu).GWAS tyrimas tiria genetinius žymenis per visą daugelio asmenų genomą ir prognozuoja genotipo ir fenotipo asociacijas statistine analize populiacijos lygiu.Jis buvo plačiai taikomas tiriant žmonių ligas ir atliekant sudėtingų gyvūnų ar augalų bruožų funkcinį genų kasimą.
-
Vieno branduolio RNR sekos nustatymas
Vienos ląstelės fiksavimo ir individualios bibliotekos kūrimo technikos pažanga, derinant su didelio našumo sekos nustatymu, leidžia atlikti genų ekspresijos tyrimus kiekvienoje ląstelėje.Tai leidžia atlikti gilesnę ir išsamesnę sudėtingų ląstelių populiacijų sistemos analizę, kurioje iš esmės išvengiama jų heterogeniškumo maskavimo, atsižvelgiant į visų ląstelių vidurkį.
Tačiau kai kurios ląstelės nėra tinkamos gaminti vienaląstę suspensiją, todėl reikalingi kiti mėginio paruošimo būdai – branduolio ekstrahavimas iš audinių, tai yra, branduolys yra tiesiogiai ekstrahuojamas iš audinių ar ląstelės ir ruošiamas į vieno branduolio suspensiją, skirtą vienaląstelei. ląstelių sekos nustatymas.
BMK teikia 10× Genomics ChromiumTM pagrįstą vienos ląstelės RNR sekos nustatymo paslaugą.Ši paslauga buvo plačiai naudojama tiriant su ligomis susijusius tyrimus, tokius kaip imuninių ląstelių diferenciacija, naviko heterogeniškumas, audinių vystymasis ir kt.
Erdvinis transkripto lustas: 10 × genomika
Platforma: „Illumina NovaSeq“ platforma
-
Augalų/gyvūnų viso genomo sekos nustatymas
Viso genomo pakartotinė sekos nustatymas, taip pat žinomas kaip WGS, leidžia atskleisti tiek įprastas, tiek retas viso genomo mutacijas, įskaitant vieno nukleotido polimorfizmą (SNP), įterpimo ištrynimą (InDel), struktūros variaciją (SV) ir kopijų skaičiaus pokytį (CNV). ).SV sudaro didesnę variacijų bazės dalį nei SNP ir turi didesnį poveikį genomui, o tai daro didelę įtaką gyviems organizmams.Ilgai skaitomas pakartotinis sekos nustatymas leidžia tiksliau identifikuoti didelius fragmentus ir sudėtingus variantus, nes ilgai skaitydami daug lengviau pereiti chromosomas per sudėtingas sritis, tokias kaip tandeminiai pasikartojimai, GC / AT turtingi regionai ir hiperkintami regionai.
Platforma: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 erdvinis transkriptas
Erdvinis ląstelių organizavimas vaidina gyvybiškai svarbų vaidmenį įvairiuose biologiniuose procesuose, tokiuose kaip imuninė infiltracija, embriono vystymasis ir kt. Erdvinė transkripto seka, kuri rodo genų ekspresijos profiliavimą, išsaugant informaciją apie erdvinę padėtį, suteikė puikių įžvalgų apie transkripto lygio audinių architektūrą.Tobulėjant technologijoms, itin aiškią audinių morfologiją ir realų erdvinės molekulinės išraiškos struktūrinį skirtumą reikia tirti didesne skiriamąja geba.BMKGENE teikia visapusišką, vieno langelio erdvinio transkripto sekos nustatymo paslaugą nuo mėginių iki biologinių įžvalgų.
Erdvinės transkriptomikos technologijos suteikė naujų perspektyvų įvairiose tyrimų srityse, išspręsdamos genų ekspresijos profilį su erdviniu turiniu heterogeniniuose mėginiuose.
Erdvinis transkripto lustas: BMKMANU S1000
Platforma: „Illumina NovaSeq“ platforma
-
10x Genomics Visium erdvinis transkriptas
Visium Spatial Gene Expression yra pagrindinė erdvinio transkripto sekos nustatymo technologija, skirta audiniams klasifikuoti pagal bendrą mRNR.Susiekite visą transkriptą su morfologiniu kontekstu, kad sužinotumėte naujų įžvalgų apie normalų vystymąsi, ligos patologiją ir klinikinius transliacijos tyrimus.BMKGENE teikia visapusišką, vieno langelio erdvinio transkripto sekos nustatymo paslaugą nuo mėginių iki biologinių įžvalgų.
Erdvinės transkriptomikos technologijos suteikė naujų perspektyvų įvairiose tyrimų srityse, išspręsdamos genų ekspresijos profilį su erdviniu turiniu heterogeniniuose mėginiuose.
Erdvinis transkripto lustas: 10x Genomics Visium
Platforma:„Illumina NovaSeq“ platforma
-
Viso ilgio mRNR sekos nustatymas-nanoporas
RNR sekos nustatymas buvo neįkainojama išsamios transkripto analizės priemonė.Be jokios abejonės, tradicinė trumpo skaitymo seka čia pasiekė daug svarbių pokyčių.Nepaisant to, jis dažnai susiduria su viso ilgio izoformų identifikavimo, kiekybinio nustatymo ir PGR šališkumo apribojimais.
Nanoporų sekos nustatymas iš kitų sekos nustatymo platformų išsiskiria tuo, kad nukleotidai nuskaitomi tiesiogiai be DNR sintezės ir sukuria ilgą skaitymą dešimtimis kilobazių.Tai suteikia galimybę tiesiogiai nuskaityti viso ilgio nuorašus ir spręsti iššūkius atliekant izoformų lygmens tyrimus.
Platforma：Nanopore PromethION
Biblioteka:cDNR-PGR
-
Viso ilgio mRNR sekos nustatymas - PacBio
De novoviso ilgio transkripto seka, dar žinoma kaipDe novo„Iso-Seq“ pasinaudoja PacBio sekvencerio pranašumais skaitymo ilgiu, kuris leidžia be jokių pertraukų nustatyti viso ilgio cDNR molekulių seką.Taip visiškai išvengiama klaidų, sugeneruotų atliekant nuorašo surinkimo veiksmus, ir sukuriami vienetiniai rinkiniai su izoformos lygio skiriamąja geba.Šie unigeniniai rinkiniai suteikia galingą genetinę informaciją kaip „referencinį genomą“ transkripto lygiu.Be to, derinant su naujos kartos sekos duomenimis, ši paslauga suteikia galimybę tiksliai kiekybiškai įvertinti izoformos lygio išraišką.
Platforma: PacBio Sequel IIBiblioteka: SMRT varpų biblioteka -
Eukariotinės mRNR sekos nustatymas-Illumina
mRNR sekos nustatymas leidžia profiliuoti visas mRNR, transkribuotas iš ląstelių tam tikromis sąlygomis.Tai galinga technologija, atskleidžianti genų ekspresijos profilį, genų struktūras ir tam tikrų biologinių procesų molekulinius mechanizmus.Iki šiol mRNR sekos nustatymas buvo plačiai naudojamas fundamentiniuose tyrimuose, klinikinėje diagnostikoje, vaistų kūrime ir kt.
Platforma: „Illumina NovaSeq“ platforma
-
Nereferencinis mRNR sekos nustatymas-Illumina
iRNR sekos nustatymas naudoja naujos kartos sekos nustatymo techniką (NGS), kad gautų pasiuntinio RNR (mRNR) iš eukarioto tam tikru laikotarpiu, kai suaktyvina kai kurios specialios funkcijos.Ilgiausias transkriptas buvo vadinamas „Unigene“ ir naudojamas kaip etaloninė seka tolesnei analizei, kuri yra veiksminga priemonė tirti rūšies molekulinį mechanizmą ir reguliavimo tinklą be nuorodos.
Po transkripto duomenų surinkimo ir unigeninės funkcinės anotacijos
(1) Bus atlikta SSR analizė, CDS prognozė ir genų struktūra.
(2) Bus atliktas kiekvieno mėginio unigeninės ekspresijos kiekybinis įvertinimas.
(3) Skirtingai išreikšti unigenai tarp mėginių (arba grupių) bus aptikti remiantis unigenine išraiška
(4) Bus atlikta skirtingai išreikštų unigenų klasterizavimas, funkcinė anotacija ir sodrinimo analizė.
-
Ilgas nekoduojantis sekvenavimas-Illumina
Ilgos nekoduojančios RNR (lncRNR) yra RNR molekulių tipas, kurių ilgis viršija 200 nt, kurioms būdingas itin mažas kodavimo potencialas.LncRNR, kaip pagrindinis nekoduojančių RNR narys, daugiausia randamas branduolyje ir plazmoje.Sekvenavimo technologijos ir bioinformtikos plėtra leidžia identifikuoti daugybę naujų lncRNR ir susieti jas su biologinėmis funkcijomis.Kaupiamieji įrodymai rodo, kad lncRNR plačiai dalyvauja epigenetiniame reguliavime, transkripcijos reguliavime ir reguliavime po transkripcijos.
-
Mažos RNR sekos nustatymas-Illumina
Maža RNR reiškia nekoduojančių RNR molekulių klasę, kurių ilgis paprastai yra mažesnis nei 200 nt, įskaitant mikro RNR (miRNR), mažą interferencinę RNR (siRNR) ir su piwi sąveikaujančią RNR (piRNR).
MikroRNR (miRNR) yra endogeninės mažos RNR, kurios ilgis yra apie 20–24 nt, klasė, kuri atlieka įvairius svarbius reguliavimo vaidmenis ląstelėse.miRNR dalyvauja daugelyje gyvybės procesų, kurie atskleidžia specifinę ir stadijos specifinę audinių ekspresiją ir yra labai konservuoti įvairiose rūšyse.
-
cirRNR sekos nustatymas-Illumina
CircRNAs (Circular RNR) yra viena nekoduojančių RNR molekulių klasė, kurioms trūksta 5′ galo dangtelio ir 3′ galo poli(A) uodegos.CircRNR atlieka žiedinę struktūrą kovalentiniu ryšiu, kuris yra prieš RNR egzonukleazės virškinimą.cirRNR vaidina svarbų vaidmenį organizmų augimui ir vystymuisi bei jų atsparumui išorinei aplinkai.
CircRNA turi daug funkcijų, kurios gali konkurencingai surišti miRNR, atlikti ceRNR reguliavimo funkciją, reguliuoti genų ekspresiją.Pastaraisiais metais taip pat buvo nustatyta, kad jis yra glaudžiai susijęs su ligų atsiradimu ir vystymusi, turi dideles taikymo perspektyvas ligų diagnostikos žymenų ir pan.
