Bakterijų ir grybelių viso genomo pakartotinis sekvenavimas
Bakterijų ir grybelių viso genomo pakartotinio sekos nustatymo projektai yra labai svarbūs siekiant tobulinti mikrobų genomiką, leidžiantį užbaigti ir palyginti mikrobų genomus. Tai palengvina fermentacijos inžineriją, pramoninių procesų optimizavimą ir antrinių metabolizmo būdų tyrimą. Be to, grybelių ir bakterijų pakartotinė sekos nustatymas yra labai svarbus norint suprasti prisitaikymą prie aplinkos, optimizuoti padermes ir atskleisti genetinės evoliucijos dinamiką, turinčią didelę reikšmę medicinai, žemės ūkiui ir aplinkos mokslui.
Paslaugos privalumai
●Bioinformatinė analizė apima variantų iškvietimą:Funkcinių įžvalgų apie pakartotinai sekvenuotus genomus teikimas.
● Didelė kompetencija: Kasmet atliekame tūkstančius mikrobų pakartotinio sekos nustatymo projektų, todėl mes suteikiame daugiau nei dešimtmečio patirtį, aukštos kvalifikacijos analizės komandą, išsamų turinį ir puikų palaikymą po pardavimo.
●Pagalba po pardavimo:Mūsų įsipareigojimas apima ne tik projekto užbaigimą, bet ir 3 mėnesių aptarnavimo po pardavimo laikotarpį. Per šį laiką siūlome tolesnius projekto veiksmus, trikčių šalinimo pagalbą ir klausimų ir atsakymų sesijas, kad galėtume atsakyti į visas su rezultatais susijusias užklausas.
Paslaugos specifikacijos
| Sekos nustatymo platforma | Sekos nustatymo strategija | Rekomenduojami duomenys | Kokybės kontrolė |
| Illumina NovaSeq | PE150 | Gylis 100x | Q30≥85 % |
Pavyzdiniai reikalavimai
| Koncentracija (ng/µL) | Bendra suma (ng) | Tūris (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bakterijos: ≥1x107 ląstelės
Vienaląsčiai grybai: ≥5x106-1x107 ląstelės
Makro grybai: ≥4g
Aptarnavimo darbų eiga
Mėginio pristatymas
Bibliotekos statyba
Sekos nustatymas
Duomenų analizė
Paslaugos po pardavimo
Apima šią analizę:
- Sekos duomenų kokybės kontrolė
- Suderinimas su etaloniniu genomu
- Skambinimo variantas: SNP ir InDel
- Varianto anotacija
Variantų iškvietimas: SNP tipai
Variantų iškvietimas: InDel ilgio pasiskirstymas
Naršykite pažangą, kurią palengvino BMKGene mikrobų genomo pakartotinio sekos nustatymo paslaugos, per kuruojamą publikacijų rinkinį.
Jia, Y. ir kt. (2023 m.) „Transkripto ir viso genomo pakartotinio sekos nustatymo sujungimas, siekiant nustatyti kviečių nykštukų bandelių atsparumo ligoms genus“,Tarptautinis molekulinių mokslų žurnalas, 24(24). doi: 10.3390 / IJMS242417356.
Jiang, M. ir kt. (2023) „Ampicilinu kontroliuojamas gliukozės metabolizmas manipuliuoja bakterijų perėjimu nuo tolerancijos prie atsparumo“,Mokslo pažanga, 9 straipsnio 10 dalis. doi: 10.1126 / SCIADV.ADE8582 / SUPPL_FILE / SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. ir kt. (2022) „Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., halogenalkalifilinė bakterija, išskirta iš sodos ežero Vidinės Mongolijos autonominiame regione, Kinijoje“, Int. J. Syst. Evol.Microbiol, 72, p. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. ir Wang, G.-H. (2024) „Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a genomo seka, išskirta iš Nasonia vitripennis“,Mikrobiologijos išteklių pranešimai. doi: 10.1128 / MRA.00802-23.
