Bakterijų ir grybelių viso genomo pakartotinis sekvenavimas
Bakterijų ir grybų viso genomo pakartotinio sekvenavimo projektai yra labai svarbūs mikrobų genomikos pažangai, nes leidžia užbaigti ir palyginti mikrobų genomus. Tai palengvina fermentacijos inžineriją, pramoninių procesų optimizavimą ir antrinių metabolizmo kelių tyrimą. Be to, grybų ir bakterijų pakartotinis sekvenavimas yra labai svarbus norint suprasti aplinkos adaptaciją, optimizuoti padermes ir atskleisti genetinės evoliucijos dinamiką, o tai turi didelę reikšmę medicinoje, žemės ūkyje ir aplinkos moksle.
Paslaugų privalumai
●Bioinformatinė analizė apima variantų nustatymą:Suteikti funkcines įžvalgas apie pakartotinai sekvenuotus genomus.
● Didelė patirtisKasmet atlikdami tūkstančius mikrobų pakartotinio sekvenavimo projektų, galime pasiūlyti daugiau nei dešimties metų patirtį, aukštos kvalifikacijos analizės komandą, išsamų turinį ir puikų aptarnavimą po pardavimo.
●Pagalba po pardavimo:Mūsų įsipareigojimas apima ir projekto užbaigimą, suteikiant 3 mėnesių garantinio aptarnavimo laikotarpį. Šiuo laikotarpiu teikiame projekto stebėsenos paslaugas, pagalbą šalinant triktis ir rengiame klausimų bei atsakymų sesijas, kad išspręstume visus su rezultatais susijusius klausimus.
Paslaugų specifikacijos
| Sekvenavimo platforma | Sekavimo strategija | Rekomenduojami duomenys | Kokybės kontrolė |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 100 kartų gylis | Q30≥85% |
Imties reikalavimai
| Koncentracija (ng/µL) | Bendras kiekis (ng) | Tūris (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bakterijos: ≥1x107 ląstelės
Vienaląsčiai grybai: ≥5x106-1x107 ląstelės
Makrogrybiai: ≥4 g
Paslaugų darbo srautas
Pavyzdžio pristatymas
Bibliotekos statyba
Sekvenavimas
Duomenų analizė
Aptarnavimas po pardavimo
Apima šią analizę:
- Sekvenavimo duomenų kokybės kontrolė
- Suderinimas su etaloniniu genomu
- Variantų iškvietimas: SNP ir InDel
- Variantų anotacija
Variantų iškvietimas: SNP tipai
Variantų iškvietimas: InDel ilgio pasiskirstymas
Sužinokite apie BMKGene mikrobų genomo pakartotinio sekvenavimo paslaugų pasiekimus per kuruojamą publikacijų kolekciją.
Jia, Y. ir kt. (2023) „Transkriptomo ir viso genomo pakartotinio sekvenavimo derinimas siekiant atrinkti atsparumo ligoms genus kviečių žemaūgių zylių atveju“,Tarptautinis molekulinių mokslų žurnalas, 24(24). doi: 10.3390 / IJMS242417356.
Jiang, M. ir kt. (2023) „Ampicilino kontroliuojamas gliukozės metabolizmas manipuliuoja bakterijų perėjimu nuo tolerancijos prie atsparumo“,Mokslo pažanga, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. ir kt. (2022) „Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., haloalkalifilinė bakterija, išskirta iš sodos ežero Vidinės Mongolijos autonominiame regione, Kinijoje“, Int. J. Syst. Evol.Mikrobiolas, 72, p. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. ir Wang, G.-H. (2024) „Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, išskirto iš Nasonia vitripennis, genomo seka“,Mikrobiologijos išteklių pranešimaidoi: 10.1128/MRA.00802-23.
