-
БСА
Платформа группового сегрегантного анализа состоит из одноэтапного стандартного анализа и расширенного анализа с индивидуальной настройкой параметров.BSA — это метод, используемый для быстрой идентификации генетических маркеров, связанных с фенотипом.Основной рабочий процесс БСА включает: 1. отбор двух групп особей с крайне противоположными фенотипами;2. объединение ДНК, РНК или SLAF-seq (разработано Biomarker) всех людей для формирования двух объемов ДНК;3. идентификация дифференциальных последовательностей относительно эталонного генома или между ними, 4. прогнозирование связанных областей-кандидатов с помощью алгоритма ED и SNP-индекса;5. Функциональный анализ и обогащение генов в регионах-кандидатах и т. д. Также доступен более продвинутый анализ данных, включая скрининг генетических маркеров и разработку праймеров.
-
Ампликон (16S/18S/ИТС)
Платформа Amplicon (16S/18S/ITS) разработана с учетом многолетнего опыта в проектном анализе микробного разнообразия, который содержит стандартизированный базовый анализ и персонализированный анализ: базовый анализ охватывает основное содержание анализа текущих микробных исследований, содержание анализа является богатым и всеобъемлющим, а результаты анализа представляются в виде отчетов по проекту;Содержание персонализированного анализа разнообразно.Можно выбирать образцы и гибко устанавливать параметры в соответствии с базовым отчетом об анализе и целью исследования для реализации индивидуальных требований.Операционная система Windows, простая и быстрая.
-
Эволюционная генетика
Эволюционная генетика — это комплексная услуга секвенирования, предназначенная для комплексной интерпретации эволюционной информации о данных материалах на основе генетических вариаций, включая SNP, InDels, SV и CNV.Он предоставляет весь фундаментальный анализ, необходимый для описания эволюционных изменений и генетических особенностей популяций, таких как структура популяции, генетическое разнообразие, филогенетические отношения и т. д. Он также содержит исследования потока генов, которые позволяют оценить эффективный размер популяции и время дивергенции.
-
Сравнительная геномика
Сравнительная геномика буквально означает сравнение полных последовательностей и структур генома разных видов.Эта дисциплина направлена на выявление эволюции видов, функций генов, механизмов регуляции генов на уровне генома путем выявления структур последовательностей и элементов, которые сохраняются или дифференцируются у разных видов.Типичное сравнительное геномное исследование включает анализ семейства генов, эволюционного развития, дупликации всего генома, селективного давления и т. Д.
-
Эволюционная генетика
Платформа популяционно-эволюционного генетического анализа создана на основе огромного опыта, накопленного в течение многих лет научно-исследовательской командой BMK.Это удобный инструмент, особенно для исследователей, не специализирующихся в области биоинформатики.Эта платформа обеспечивает базовый анализ, связанный с эволюционной генетикой, включая построение филогенетического дерева, анализ неравновесия по сцеплению, оценку генетического разнообразия, выборочный анализ, анализ родства, PCA, анализ структуры популяции и т. д.
-
Сборка генома на основе Hi-C
Hi-C — это метод, предназначенный для определения конфигурации хромосом путем сочетания исследования взаимодействий на основе близости и высокопроизводительного секвенирования.Считается, что интенсивность этих взаимодействий отрицательно коррелирует с физическим расстоянием на хромосомах.Таким образом, данные Hi-C могут помочь в кластеризации, упорядочении и ориентации собранных последовательностей в черновом геноме и их закреплении на определенном количестве хромосом.Эта технология позволяет собирать геном на уровне хромосом при отсутствии популяционной генетической карты.Каждому геному нужен Hi-C.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq/DNBSEQ
-
Секвенирование генома растений/животных De Novo
Де Новопод секвенированием понимается конструирование полного генома вида с использованием технологий секвенирования, например, PacBio, Nanopore, NGS и т. д., в отсутствие эталонного генома.Значительное улучшение длины чтения технологий секвенирования третьего поколения открыло новые возможности в сборке сложных геномов, например, геномов с высокой гетерозиготностью, высоким соотношением повторяющихся областей, полиплоидов и т. д. Благодаря длине чтения на уровне десятков килобаз эти чтения секвенирования позволяют разрешение повторяющихся элементов, областей с аномальным содержанием GC и других очень сложных областей.
Платформа: PacBio Sequel II/Nanopore PromethION P48/Платформа Illumina NovaSeq
-
Секвенирование всего экзома человека
Секвенирование всего экзома (WES) считается экономически эффективной стратегией секвенирования для выявления мутаций, вызывающих заболевания.Хотя экзоны занимают всего около 1,7% всего генома, они непосредственно отражают профиль общих функций белка.Сообщалось, что в геноме человека более 85% мутаций, связанных с заболеванием, происходят в области, кодирующей белок.
BMKGENE предлагает комплексные и гибкие услуги по секвенированию всего экзома человека с различными стратегиями захвата экзонов, доступными для достижения различных исследовательских целей.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
Секвенирование специфичных локусных амплифицированных фрагментов (SLAF-Seq)
Высокопроизводительное генотипирование, особенно в крупных популяциях, является фундаментальным шагом в исследованиях генетических ассоциаций, который обеспечивает генетическую основу для открытия функциональных генов, эволюционного анализа и т. д. Вместо глубокого повторного секвенирования всего генома применяется секвенирование генома с уменьшенным представлением (RRGS). ) вводится для минимизации затрат на секвенирование на образец, сохраняя при этом разумную эффективность обнаружения генетических маркеров.Обычно это достигается путем извлечения фрагмента ограничения в заданном диапазоне размеров, который называется библиотекой сокращенного представления (RRL).Секвенирование амплифицированных фрагментов специфического локуса (SLAF-Seq) представляет собой самостоятельно разработанную стратегию генотипирования SNP с эталонным геномом или без него.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq -
Иллюмина и BGI
Технология секвенирования Illumina, основанная на Sequencing by Synthesis (SBS), является всемирно признанной инновацией NGS, ответственной за создание более 90% мировых данных секвенирования.Принцип SBS включает в себя визуализацию флуоресцентно меченных обратимых терминаторов при добавлении каждого dNTP и их последующем расщеплении, чтобы обеспечить включение следующего основания.Поскольку все четыре обратимых дНТФ, связанных с терминатором, присутствуют в каждом цикле секвенирования, естественная конкуренция сводит к минимуму систематическую ошибку включения.Эта универсальная технология поддерживает библиотеки как с одним чтением, так и с парными концами, обеспечивая широкий спектр геномных приложений.Высокая производительность и точность секвенирования Illumina делают его краеугольным камнем в исследованиях в области геномики, позволяя ученым разгадывать хитросплетения геномов с непревзойденной детализацией и эффективностью.
DNBSEQ, разработанная BGI, — это еще одна инновационная технология NGS, которая позволила еще больше снизить затраты на секвенирование и повысить производительность.Подготовка библиотек DNBSEQ включает фрагментацию ДНК, подготовку оцДНК и амплификацию по катящемуся кругу для получения наношариков ДНК (DNB).Затем их загружают на твердую поверхность и впоследствии секвенируют с помощью комбинаторного синтеза зонда-якоря (cPAS).
Наша служба секвенирования готовых библиотек помогает клиентам готовить библиотеки секвенирования из различных источников (мРНК, весь геном, ампликон и т. д.).Впоследствии эти библиотеки могут быть отправлены в наши центры секвенирования для контроля качества и секвенирования на платформах Illumina или BGI.
