-
BSA
Bulked Segregant Analysis platform bestaan uit een-stap standaard analise en gevorderde analise met pasgemaakte parameter instelling.BSA is 'n tegniek wat gebruik word om vinnig fenotipe-geassosieerde genetiese merkers te identifiseer.Hoofwerkvloei van BSA bevat: 1. seleksie van twee groepe individue met uiters opponerende fenotipes;2. die samevoeging van die DNA, RNA of SLAF-volgorde (Ontwikkel deur Biomarker) van alle individue om twee massas DNA te vorm;3. identifisering van differensiële volgordes teen verwysingsgenoom of tussenin, 4. voorspelling van kandidaat-gekoppelde streke deur ED en SNP-indeks algoritme;5. Funksionele analise en verryking van gene in kandidaatstreke, ens. Meer gevorderde ontginning van data, insluitend genetiese merker sifting en primer ontwerp is ook beskikbaar.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) platform is ontwikkel met jare se ondervinding in mikrobiese diversiteit projek analise, wat gestandaardiseerde basiese analise en persoonlike analise bevat: basiese analise dek die hoofstroom analise inhoud van huidige mikrobiese navorsing, die analise inhoud is ryk en omvattend, en ontledingsresultate word in die vorm van projekverslae aangebied;Die inhoud van gepersonaliseerde analise is uiteenlopend.Monsters kan gekies word en parameters kan buigsaam gestel word volgens die basiese ontledingsverslag en navorsingsdoel, om persoonlike vereistes te verwesenlik.Windows-bedryfstelsel, eenvoudig en vinnig.
-
Evolusionêre Genetika
Evolusionêre genetika is 'n volgepakte volgorde diens wat ontwerp is vir die verskaffing van 'n omvattende interpretasie van evolusionêre inligting van gegewe materiale gebaseer op genetiese variasies, insluitend SNPs, InDels, SVs en CNVs.Dit verskaf alle fundamentele ontledings wat nodig is vir die beskrywing van evolusionêre veranderinge en genetiese kenmerke van populasies, soos bevolkingstruktuur, genetiese diversiteit, filogenieverwantskappe, ens. Dit bevat ook studies oor geenvloei, wat skatting van effektiewe bevolkingsgrootte, divergensietyd bemagtig.
-
Vergelykende genomika
Vergelykende genomika beteken letterlik om die volledige genoomvolgorde en strukture van verskillende spesies te vergelyk.Hierdie dissipline het ten doel om spesie-evolusie, geenfunksie, geenregulerende meganisme op genoomvlak te openbaar deur die volgordestrukture en elemente wat oor verskillende spesies bewaar of gedifferensieer het, te identifiseer.Tipiese vergelykende genomikastudie sluit ontledings in geenfamilie, evolusionêre ontwikkeling, heelgenoomduplisering, selektiewe druk, ens.
-
Evolusionêre Genetika
Bevolkings- en evolusionêre genetiese ontledingsplatform is gevestig op grond van massiewe ervaring wat jare lank in BMK R&D-span opgehoop is.Dit is 'n gebruikersvriendelike hulpmiddel veral vir navorsers wat nie bioinformatika as hoofvak het nie.Hierdie platform maak basiese evolusionêre genetika-verwante basiese analise moontlik, insluitend filogenetiese boomkonstruksie, koppelingswanbalansanalise, genetiese diversiteitbeoordeling, selektiewe sweep-analise, verwantskapsanalise, PCA, populasiestruktuuranalise, ens.
-
Hi-C-gebaseerde genoomsamestelling
Hi-C is 'n metode wat ontwerp is om chromosoomkonfigurasie vas te vang deur ondersoekende nabyheid-gebaseerde interaksies en hoë-deurset-volgordebepaling te kombineer.Daar word geglo dat die intensiteit van hierdie interaksies negatief gekorreleer is met fisiese afstand op chromosome.Daarom kan Hi-C-data die groepering, ordening en oriëntering van saamgestelde reekse in 'n konsepgenoom lei en dit op 'n sekere aantal chromosome veranker.Hierdie tegnologie bemagtig 'n genoomsamestelling op chromosoomvlak in die afwesigheid van bevolkingsgebaseerde genetiese kaart.Elke enkele genoom het 'n Hi-C nodig.
Platform: Illumina NovaSeq Platform / DNBSEQ
-
Plant/dier De Novo-genoomvolgordebepaling
De novovolgordebepaling verwys na die konstruksie van 'n spesie se hele genoom deur gebruik te maak van volgordebepalingtegnologieë, bv. PacBio, Nanopore, NGS, ens., in afwesigheid van 'n verwysingsgenoom.Die merkwaardige verbetering in leeslengte van derdegenerasie-volgordebepalingtegnologieë het nuwe geleenthede gebring in die samestelling van komplekse genome, soos dié met hoë heterosigositeit, hoë verhouding van herhalende streke, poliploïede, ens. Met leeslengte op tientalle kilobasisse vlak, maak hierdie volgordebepalinglesings dit moontlik. oplos van herhalende elemente, streke met abnormale GC-inhoud en ander hoogs komplekse streke.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq Platform
-
Menslike hele eksoom-volgordebepaling
Heeleksoomvolgordebepaling (WES) word beskou as 'n koste-effektiewe volgordebepalingstrategie vir die identifisering van siekteveroorsakende mutasies.Alhoewel eksons slegs ongeveer 1,7% van die hele genoom opneem, verteenwoordig dit die profiel van totale proteïenfunksies direk.In menslike genoom is daar gerapporteer dat meer as 85% van siekteverwante mutasies in proteïenkoderende gebied voorkom.
BMKGENE bied omvattende en buigsame menslike hele eksoom-volgordebepalingsdienste met verskillende eksonvasleggingstrategieë beskikbaar om verskeie navorsingsdoelwitte te bereik.
Platform: Illumina NovaSeq-platform
-
Spesifieke-lokus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
Hoë-deurset genotipering, veral op grootskaalse bevolking, is 'n fundamentele stap in genetiese assosiasie studies, wat genetiese basis verskaf vir funksionele geen ontdekking, evolusionêre analise, ens. In plaas van diep heelgenoom hervolgordebepaling, verminderde verteenwoordiging genoomvolgordebepaling (RRGS ) word ingestel om volgordebepalingskoste per monster te verminder, terwyl redelike doeltreffendheid op die ontdekking van genetiese merker gehandhaaf word.Dit word gewoonlik bereik deur die onttrekking van beperkingsfragmente binne 'n gegewe grootte reeks, wat genoem word verminderde verteenwoordiging biblioteek (RRL).Spesifieke-lokus geamplifiseerde fragment volgordebepaling (SLAF-Seq) is 'n self-ontwikkelde strategie vir SNP genotipering met of sonder 'n verwysingsgenoom.
Platform: Illumina NovaSeq-platform -
Illumina en BGI
Illumina-volgordebepalingtegnologie, gebaseer op Sequencing by Synthesis (SBS), is 'n wêreldwye omhelsde NGS-innovasie, verantwoordelik vir die generering van meer as 90% van die wêreld se volgordebepalingdata.Die beginsel van SBS behels die beeldvorming van fluorescent-gemerkte omkeerbare terminators soos elke dNTP bygevoeg word, en daarna gesplits word om die inkorporering van die volgende basis moontlik te maak.Met al vier omkeerbare terminatorgebonde dNTP's teenwoordig in elke volgordesiklus, verminder natuurlike mededinging inkorporasie-vooroordeel.Hierdie veelsydige tegnologie ondersteun beide enkellees- en gepaardgaande biblioteke, wat voorsiening maak vir 'n reeks genomiese toepassings.Illumina-volgordebepaling se hoë-deursetvermoë en presisie posisioneer dit as 'n hoeksteen in genomika-navorsing, wat wetenskaplikes bemagtig om die ingewikkeldhede van genome met ongeëwenaarde detail en doeltreffendheid te ontrafel.
DNBSEQ, ontwikkel deur BGI, is nog 'n innoverende NGS-tegnologie wat daarin geslaag het om die volgordekoste verder te verlaag en deurset te verhoog.Voorbereiding van DNBSEQ biblioteke behels DNA fragmentasie, voorbereiding van ssDNA en rollende sirkel amplifikasie om die DNA nanoballe (DNB) te verkry.Dit word dan op 'n soliede oppervlak gelaai en daarna deur kombinatoriese sonde-anker-sintese (cPAS) gerangskik.
Ons voorafgemaakte biblioteekvolgordebepalingsdiens vergemaklik kliënte om hul volgordebepalingsbiblioteke van uiteenlopende bronne (mRNA, heelgenoom, amplicon, onder andere) voor te berei.Vervolgens kan hierdie biblioteke na ons volgordebepalingsentrums gestuur word vir gehaltebeheer en volgordebepaling in Illumina- of BGI-platforms.
