-
BSA
Платформата Bulked Segregant Analysis се состои од стандардна анализа во еден чекор и напредна анализа со приспособено поставување на параметри.BSA е техника употребена за брзо идентификување на генетските маркери поврзани со фенотипот.Главниот тек на работа на BSA содржи: 1. избор на две групи на поединци со крајно спротивставени фенотипови;2. здружување на ДНК, РНК или SLAF-seq (развиено од Биомаркер) на сите индивидуи за да се формираат два најголеми ДНК;3. идентификување на диференцијални секвенци во однос на референтниот геном или помеѓу нив, 4. предвидување на кандидатски поврзани региони со алгоритам за ED и SNP-индекс;5. Функционална анализа и збогатување на гените во регионите кандидати, итн. Достапни се и понапредно ископување на податоци, вклучувајќи скрининг на генетски маркери и дизајн на прајмери.
-
Ампликон (16S/18S/ITS)
Платформата Amplicon (16S/18S/ITS) е развиена со долгогодишно искуство во анализа на проекти за микробиолошка разновидност, која содржи стандардизирана основна анализа и персонализирана анализа: основната анализа ја покрива содржината на мејнстрим анализа на тековните микробиолошки истражувања, содржината на анализата е богата и сеопфатна, а резултатите од анализата се претставени во форма на проектни извештаи;Содржината на персонализираната анализа е разновидна.Може да се изберат примероци и параметрите може да се постават флексибилно во согласност со основниот извештај за анализа и целта на истражувањето, за да се реализираат персонализираните барања.Оперативен систем Windows, едноставен и брз.
-
Еволутивна генетика
Еволутивната генетика е спакувана услуга за секвенционирање дизајнирана да обезбеди сеопфатна интерпретација на еволутивните информации на дадените материјали врз основа на генетски варијации, вклучувајќи SNP, InDels, SV и CNV.Таа ги обезбедува сите фундаментални анализи потребни за опишување на еволутивните промени и генетските карактеристики на популациите, како што се структурата на популацијата, генетската разновидност, филогенските односи итн. Исто така, содржи студии за протокот на гените, што ја поттикнува проценката на ефективната големина на популацијата, времето на дивергенција.
-
Компаративна геномика
Компаративна геномика буквално значи споредување на целосните геномски секвенци и структури на различни видови.Оваа дисциплина има за цел да ја открие еволуцијата на видовите, функцијата на генот, механизмот за регулирање на генот на ниво на геном преку идентификување на структурите и елементите на секвенцата кои се конзервирани или диференцирани кај различни видови.Типична студија за компаративна геномика вклучува анализи во семејството на гени, еволутивен развој, дуплирање на целиот геном, селективен притисок итн.
-
Еволутивна генетика
Платформата за популација и еволутивна генетска анализа е основана врз основа на огромното искуство акумулирано во тимот за истражување и развој на BMK со години.Тоа е алатка погодна за корисниците, особено за истражувачи кои не се занимаваат со биоинформатика.Оваа платформа овозможува основна анализа поврзана со еволутивната генетика, вклучително конструкција на филогенетско дрво, анализа на нерамнотежа на поврзаноста, проценка на генетската разновидност, селективна анализа на мета, анализа на сродство, PCA, анализа на структурата на населението итн.
-
Геном базиран на Hi-C
Hi-C е метод дизајниран да ја долови конфигурацијата на хромозомот со комбинирање на интеракции засновани на блискост и секвенционирање со висок пропус.Се верува дека интензитетот на овие интеракции е негативно корелиран со физичкото растојание на хромозомите.Затоа, податоците од Hi-C би можеле да го водат групирањето, подредувањето и ориентирањето на собраните секвенци во нацрт геномот и прицврстувањето на тие на одреден број хромозоми.Оваа технологија го зајакнува геномот на ниво на хромозом во отсуство на генетска карта заснована на популација.На секој геном му треба Hi-C.
Платформа: Illumina NovaSeq платформа / DNBSEQ
-
Секвенционирање на геномот на растенија/животински де Ново
Де Новосеквенционирањето се однесува на изградбата на целиот геном на еден вид со користење на технологии за секвенционирање, на пр. PacBio, Nanopore, NGS, итн., во отсуство на референтен геном.Извонредното подобрување во должината на читањето на технологиите за секвенционирање од третата генерација донесе нови можности за составување сложени геноми, како што се оние со висока хетерозиготност, висок сооднос на репетитивни региони, полиплоиди итн. разрешување на повторувачки елементи, региони со абнормални GC содржини и други многу сложени региони.
Платформа: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq Platform
-
Секвенционирање на човечка целина егзом
Секвенционирањето на цели егзоми (WES) се смета за рентабилна стратегија за секвенционирање за идентификување на мутации кои предизвикуваат болест.Иако егзоните заземаат само приближно 1,7% од целиот геном, тој директно го претставува профилот на вкупните протеински функции.Во човечкиот геном, објавено е дека повеќе од 85% од мутациите поврзани со болеста се јавуваат во протеинскиот кодирање на регионот.
BMKGENE нуди сеопфатни и флексибилни услуги за секвенционирање на човечки цели егзоми со различни стратегии за снимање на егзони достапни за исполнување на различни истражувачки цели.
Платформа: Illumina NovaSeq платформа
-
Секвенционирање на фрагменти засилени со специфичен локус (SLAF-Seq)
Генотипизацијата со висок пропуст, особено кај популацијата од големи размери, е фундаментален чекор во студиите за генетско здружување, што обезбедува генетска основа за откривање на функционални гени, еволутивна анализа, итн. ) се воведува за да се минимизираат трошоците за секвенционирање по примерок, додека се одржува разумна ефикасност при откривање на генетски маркери.Ова обично се постигнува со извлекување на фрагмент за ограничување во дадениот опсег на големина, кој се нарекува библиотека со намалена застапеност (RRL).Секвенционирање на фрагменти засилени со специфичен локус (SLAF-Seq) е самостојно развиена стратегија за генотипирање на SNP со или без референтен геном.
Платформа: Illumina NovaSeq платформа -
Илумина и БГИ
Технологијата за секвенционирање на Illumina, базирана на Sequencing by Synthesis (SBS), е глобално прифатена NGS иновација, одговорна за генерирање на над 90% од податоците за секвенционирање во светот.Принципот на SBS вклучува сликање на флуоресцентно означени реверзибилни терминатори како што се додава секој dNTP и последователно се расцепува за да се овозможи инкорпорирање на следната база.Со сите четири реверзибилни dNTP поврзани со терминатор присутни во секој циклус на секвенционирање, природната конкуренција ја минимизира пристрасноста на инкорпорацијата.Оваа разновидна технологија поддржува библиотеки за едночитање и спарени библиотеки, кои се грижат за низа геномски апликации.Способностите и прецизноста на секвенционирањето на Illumina го позиционираат како камен-темелник во геномското истражување, давајќи им можност на научниците да ги откријат сложеноста на геномите со неспоредливи детали и ефикасност.
DNBSEQ, развиен од BGI, е уште една иновативна NGS технологија која успеа дополнително да ги намали трошоците за секвенционирање и да ја зголеми пропусната моќ.Подготовката на библиотеките DNBSEQ вклучува фрагментација на ДНК, подготовка на ssDNA и засилување на тркалачкиот круг за да се добијат нанотопките на ДНК (DNB).Тие потоа се ставаат на цврста површина и последователно се секвенционираат со комбинаторна синтеза на сонда-сидро (cPAS).
Нашата претходно направена услуга за секвенционирање на библиотеки им помага на клиентите да ги подготват нивните библиотеки за секвенционирање од различни извори (мРНК, цел геном, ампликон, меѓу другото).Последователно, овие библиотеки може да се испорачаат во нашите центри за секвенционирање за контрола на квалитетот и секвенционирање во платформите Illumina или BGI.
