-
বিএসএ
বাল্কড সেগ্রিগ্যান্ট অ্যানালাইসিস প্ল্যাটফর্মে এক-ধাপে স্ট্যান্ডার্ড বিশ্লেষণ এবং কাস্টমাইজড প্যারামিটার সেটিং সহ উন্নত বিশ্লেষণ রয়েছে।BSA হল একটি কৌশল যা ফিনোটাইপ সম্পর্কিত জেনেটিক মার্কারগুলিকে দ্রুত সনাক্ত করার জন্য নিযুক্ত করা হয়।BSA এর প্রধান কর্মপ্রবাহে রয়েছে: 1. অত্যন্ত বিরোধী ফেনোটাইপ সহ ব্যক্তিদের দুটি গ্রুপ নির্বাচন করা;2. সমস্ত ব্যক্তির DNA, RNA বা SLAF-seq (Biomarker দ্বারা বিকাশিত) একত্রিত করে দুই বাল্ক DNA তৈরি করা;3. রেফারেন্স জিনোমের বিপরীতে বা এর মধ্যে ডিফারেনশিয়াল সিকোয়েন্স সনাক্ত করা, 4. ED এবং SNP-সূচক অ্যালগরিদম দ্বারা প্রার্থী লিঙ্কযুক্ত অঞ্চলগুলির পূর্বাভাস দেওয়া;5. প্রার্থী অঞ্চলে জিনের উপর কার্যকরী বিশ্লেষণ এবং সমৃদ্ধকরণ, ইত্যাদি। জেনেটিক মার্কার স্ক্রীনিং এবং প্রাইমার ডিজাইন সহ ডেটাতে আরও উন্নত খনিরও উপলব্ধ।
-
অ্যামপ্লিকন (16S/18S/ITS)
অ্যামপ্লিকন (16S/18S/ITS) প্ল্যাটফর্মটি মাইক্রোবায়াল বৈচিত্র্যের প্রকল্প বিশ্লেষণে বছরের অভিজ্ঞতার সাথে তৈরি করা হয়েছে, যাতে রয়েছে প্রমিত মৌলিক বিশ্লেষণ এবং ব্যক্তিগতকৃত বিশ্লেষণ: মৌলিক বিশ্লেষণ বর্তমান মাইক্রোবিয়াল গবেষণার মূলধারার বিশ্লেষণ সামগ্রীকে কভার করে, বিশ্লেষণের বিষয়বস্তু সমৃদ্ধ এবং ব্যাপক, এবং বিশ্লেষণ ফলাফল প্রকল্প রিপোর্ট আকারে উপস্থাপন করা হয়;ব্যক্তিগতকৃত বিশ্লেষণের বিষয়বস্তু বৈচিত্র্যময়।নমুনা নির্বাচন করা যেতে পারে এবং মৌলিক বিশ্লেষণ রিপোর্ট এবং গবেষণা উদ্দেশ্য অনুযায়ী প্যারামিটার নমনীয়ভাবে সেট করা যেতে পারে, ব্যক্তিগতকৃত প্রয়োজনীয়তা উপলব্ধি করতে।উইন্ডোজ অপারেটিং সিস্টেম, সহজ এবং দ্রুত।
-
বিবর্তনীয় জেনেটিক্স
বিবর্তনীয় জেনেটিক্স হল একটি প্যাকড সিকোয়েন্সিং পরিষেবা যা SNPs, InDels, SVs এবং CNVs সহ জেনেটিক বৈচিত্রের উপর ভিত্তি করে প্রদত্ত উপাদানগুলির বিবর্তনীয় তথ্যের একটি ব্যাপক ব্যাখ্যা প্রদানের জন্য ডিজাইন করা হয়েছে।এটি বিবর্তনীয় পরিবর্তন এবং জনসংখ্যার জিনগত বৈশিষ্ট্য যেমন জনসংখ্যার গঠন, জিনগত বৈচিত্র্য, ফাইলোজেনি সম্পর্ক ইত্যাদি বর্ণনা করার জন্য প্রয়োজনীয় সমস্ত মৌলিক বিশ্লেষণ প্রদান করে। এতে জিন প্রবাহের উপর অধ্যয়নও রয়েছে, যা কার্যকর জনসংখ্যার আকার, অপসারণের সময় অনুমানকে শক্তিশালী করে।
-
তুলনামূলক জিনোমিক্স
তুলনামূলক জিনোমিক্সের আক্ষরিক অর্থ হল বিভিন্ন প্রজাতির সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্স এবং কাঠামোর তুলনা করা।এই শৃঙ্খলার লক্ষ্য হল প্রজাতির বিবর্তন, জিনের কার্যকারিতা, জিনোম স্তরে জিন নিয়ন্ত্রক প্রক্রিয়া প্রকাশ করা এবং বিভিন্ন প্রজাতির মধ্যে সংরক্ষিত বা পার্থক্যকারী ক্রম কাঠামো এবং উপাদানগুলি সনাক্ত করা।সাধারণ তুলনামূলক জিনোমিক্স অধ্যয়নের মধ্যে রয়েছে জিন পরিবারের বিশ্লেষণ, বিবর্তনীয় বিকাশ, সম্পূর্ণ জিনোমের অনুলিপি, নির্বাচনী চাপ ইত্যাদি।
-
বিবর্তনীয় জেনেটিক্স
জনসংখ্যা এবং বিবর্তনীয় জেনেটিক বিশ্লেষণ প্ল্যাটফর্মটি বছরের পর বছর ধরে BMK R&D টিমের মধ্যে সঞ্চিত বিশাল অভিজ্ঞতার ভিত্তিতে প্রতিষ্ঠিত হয়েছে।এটি একটি ব্যবহারকারী বান্ধব টুল বিশেষ করে গবেষকদের জন্য যারা বায়োইনফরমেটিক্সে প্রধান নন।এই প্ল্যাটফর্মটি মৌলিক বিবর্তনীয় জেনেটিক্স সম্পর্কিত মৌলিক বিশ্লেষণকে সক্ষম করে যার মধ্যে রয়েছে ফাইলোজেনেটিক ট্রি নির্মাণ, সংযোগের ভারসাম্য বিশ্লেষণ, জেনেটিক বৈচিত্র্য মূল্যায়ন, নির্বাচনী সুইপ বিশ্লেষণ, আত্মীয়তা বিশ্লেষণ, পিসিএ, জনসংখ্যা গঠন বিশ্লেষণ ইত্যাদি।
-
হাই-সি ভিত্তিক জিনোম সমাবেশ
হাই-সি হল প্রোবিং প্রক্সিমিটি-ভিত্তিক মিথস্ক্রিয়া এবং উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিংকে একত্রিত করে ক্রোমোজোম কনফিগারেশন ক্যাপচার করার জন্য ডিজাইন করা একটি পদ্ধতি।এই মিথস্ক্রিয়াগুলির তীব্রতা ক্রোমোজোমের শারীরিক দূরত্বের সাথে নেতিবাচকভাবে সম্পর্কযুক্ত বলে মনে করা হয়।তাই, হাই-সি ডেটা একটি খসড়া জিনোমে একত্রিত সিকোয়েন্সের ক্লাস্টারিং, অর্ডারিং এবং ওরিয়েন্টিং এবং নির্দিষ্ট সংখ্যক ক্রোমোজোমের উপর নোঙ্গর করার জন্য গাইড করতে পারে।এই প্রযুক্তি জনসংখ্যা-ভিত্তিক জেনেটিক মানচিত্রের অনুপস্থিতিতে একটি ক্রোমোজোম-স্তরের জিনোম সমাবেশকে শক্তিশালী করে।প্রতিটি জিনোমের একটি হাই-সি প্রয়োজন।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্ম / ডিএনবিএসইকিউ
-
উদ্ভিদ/প্রাণী ডি নভো জিনোম সিকোয়েন্সিং
ডি নভোসিকোয়েন্সিং বলতে একটি রেফারেন্স জিনোমের অনুপস্থিতিতে সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি, যেমন PacBio, Nanopore, NGS ইত্যাদি ব্যবহার করে একটি প্রজাতির সম্পূর্ণ জিনোম নির্মাণকে বোঝায়।তৃতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তির পঠন দৈর্ঘ্যের উল্লেখযোগ্য উন্নতি জটিল জিনোমগুলিকে একত্রিত করার নতুন সুযোগ এনেছে, যেমন উচ্চ হেটেরোজাইগোসিটি, উচ্চ পুনরাবৃত্ত অঞ্চলের অনুপাত, পলিপ্লয়েড ইত্যাদি। পুনরাবৃত্তিমূলক উপাদান, অস্বাভাবিক GC বিষয়বস্তু সহ অঞ্চল এবং অন্যান্য অত্যন্ত জটিল অঞ্চলগুলির সমাধান করা।
প্ল্যাটফর্ম: PacBio সিক্যুয়েল II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq প্ল্যাটফর্ম
-
হিউম্যান হোল এক্সোম সিকোয়েন্সিং
সম্পূর্ণ এক্সোম সিকোয়েন্সিং (ডব্লিউইএস) রোগ-সৃষ্টিকারী মিউটেশন সনাক্তকরণের জন্য একটি ব্যয়-কার্যকর সিকোয়েন্সিং কৌশল হিসাবে বিবেচিত হয়।যদিও এক্সনগুলি সমগ্র জিনোমের প্রায় 1.7% গ্রহণ করে, এটি সরাসরি মোট প্রোটিন ফাংশনের প্রোফাইলকে প্রতিনিধিত্ব করে।মানব জিনোমে, এটি রিপোর্ট করা হয়েছে যে 85% এর বেশি রোগ সম্পর্কিত মিউটেশন প্রোটিন কোডিং অঞ্চলে ঘটে।
BMKGENE বিভিন্ন গবেষণা লক্ষ্য পূরণের জন্য উপলব্ধ বিভিন্ন এক্সন ক্যাপচারিং কৌশল সহ ব্যাপক এবং নমনীয় মানব সমগ্র এক্সোম সিকোয়েন্সিং পরিষেবা সরবরাহ করে।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্ম
-
স্পেসিফিক-লোকাস এমপ্লিফাইড ফ্র্যাগমেন্ট সিকোয়েন্সিং (SLAF-Seq)
উচ্চ-থ্রুপুট জিনোটাইপিং, বিশেষ করে বড় আকারের জনসংখ্যার ক্ষেত্রে, জেনেটিক অ্যাসোসিয়েশন অধ্যয়নের একটি মৌলিক পদক্ষেপ, যা কার্যকরী জিন আবিষ্কার, বিবর্তনীয় বিশ্লেষণ ইত্যাদির জন্য জেনেটিক ভিত্তি প্রদান করে। গভীর সমগ্র জিনোম পুনঃক্রমের পরিবর্তে, কম প্রতিনিধিত্ব জিনোম সিকোয়েন্সিং (RGS)। জেনেটিক মার্কার আবিষ্কারে যুক্তিসঙ্গত দক্ষতা বজায় রাখার সময় নমুনা প্রতি সিকোয়েন্সিং খরচ কমানোর জন্য ) চালু করা হয়েছে।এটি সাধারণত প্রদত্ত আকারের সীমার মধ্যে সীমাবদ্ধতা খণ্ড নিষ্কাশন করে অর্জন করা হয়, যার নামকরণ করা হয় হ্রাসকৃত প্রতিনিধিত্ব লাইব্রেরি (RRL)।স্পেসিফিক-লোকাস এমপ্লিফাইড ফ্র্যাগমেন্ট সিকোয়েন্সিং (SLAF-Seq) হল একটি রেফারেন্স জিনোম সহ বা ছাড়া SNP জিনোটাইপিংয়ের জন্য একটি স্ব-উন্নত কৌশল।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্ম -
ইলুমিনা এবং বিজিআই
ইলুমিনা সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি, সিকোয়েন্সিং বাই সিন্থেসিস (এসবিএস) এর উপর ভিত্তি করে, একটি বিশ্বব্যাপী এনজিএস উদ্ভাবন, যা বিশ্বের 90% এর বেশি সিকোয়েন্সিং ডেটা তৈরি করার জন্য দায়ী।এসবিএস-এর নীতির মধ্যে রয়েছে ইমেজিং ফ্লুরোসেন্টলি লেবেলযুক্ত রিভার্সিবল টার্মিনেটর প্রতিটি dNTP যোগ করা হলে, এবং পরবর্তী বেসকে অন্তর্ভুক্ত করার অনুমতি দেওয়ার জন্য ক্লিভ করা হয়।প্রতিটি সিকোয়েন্সিং চক্রে চারটি বিপরীতমুখী টার্মিনেটর-বাউন্ড ডিএনটিপি উপস্থিত থাকায়, প্রাকৃতিক প্রতিযোগিতা অন্তর্ভুক্তির পক্ষপাত কমিয়ে দেয়।এই বহুমুখী প্রযুক্তি জিনোমিক অ্যাপ্লিকেশনগুলির একটি পরিসরে ক্যাটারিং করে একক-পঠিত এবং জোড়া-শেষ লাইব্রেরি উভয়কেই সমর্থন করে।ইলুমিনা সিকোয়েন্সিংয়ের উচ্চ-থ্রুপুট ক্ষমতা এবং নির্ভুলতা এটিকে জিনোমিক্স গবেষণায় একটি ভিত্তিপ্রস্তর হিসাবে অবস্থান করে, যা বিজ্ঞানীদের অতুলনীয় বিশদ এবং দক্ষতার সাথে জিনোমের জটিলতাগুলি উন্মোচন করতে সক্ষম করে।
ডিএনবিএসইকিউ, বিজিআই দ্বারা তৈরি, আরেকটি উদ্ভাবনী এনজিএস প্রযুক্তি যা সিকোয়েন্সিং খরচ আরও কমাতে এবং থ্রুপুট বাড়াতে সক্ষম হয়েছে।DNBSEQ লাইব্রেরির প্রস্তুতিতে DNA ফ্র্যাগমেন্টেশন, ssDNA এর প্রস্তুতি এবং DNA ন্যানোবল (DNB) পাওয়ার জন্য ঘূর্ণায়মান বৃত্ত পরিবর্ধন জড়িত।এইগুলি তারপর একটি কঠিন পৃষ্ঠের উপর লোড করা হয় এবং পরবর্তীতে কম্বিনেটরিয়াল প্রোব-অ্যাঙ্কর সিন্থেসিস (cPAS) দ্বারা অনুক্রম করা হয়।
আমাদের পূর্ব-তৈরি লাইব্রেরি সিকোয়েন্সিং পরিষেবা গ্রাহকদের বিভিন্ন উৎস থেকে তাদের সিকোয়েন্সিং লাইব্রেরি প্রস্তুত করতে সহায়তা করে (mRNA, পুরো জিনোম, amplicon, অন্যদের মধ্যে)।পরবর্তীকালে, ইলুমিনা বা বিজিআই প্ল্যাটফর্মগুলিতে মান নিয়ন্ত্রণ এবং সিকোয়েন্সিংয়ের জন্য এই লাইব্রেরিগুলি আমাদের সিকোয়েন্সিং কেন্দ্রগুলিতে পাঠানো যেতে পারে।
