-
BSA
Bulked Segregant Analysis-plattformen består av standardanalys i ett steg och avancerad analys med anpassad parameterinställning.BSA är en teknik som används för att snabbt identifiera fenotypassocierade genetiska markörer.Huvudarbetsflödet för BSA innehåller: 1. välja två grupper av individer med extremt motsatta fenotyper;2. sammanslagning av DNA, RNA eller SLAF-seq (utvecklad av Biomarker) från alla individer för att bilda två bulk av DNA;3. identifiera differentiella sekvenser mot referensgenom eller däremellan, 4. förutsäga kandidatlänkade regioner genom ED och SNP-indexalgoritm;5. Funktionsanalys och anrikning av gener i kandidatregioner, etc. Mer avancerad brytning av data inklusive genetisk markörscreening och primerdesign finns också tillgängliga.
-
Amplikon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) plattform är utvecklad med många års erfarenhet av mikrobiell mångfaldsprojektanalys, som innehåller standardiserad grundläggande analys och personlig analys: grundläggande analys täcker det vanliga analysinnehållet i aktuell mikrobiell forskning, analysinnehållet är rikt och omfattande, och analysresultat presenteras i form av projektrapporter;Innehållet i personlig analys är mångsidigt.Prover kan väljas och parametrar kan ställas in flexibelt i enlighet med den grundläggande analysrapporten och forskningssyfte, för att realisera personliga krav.Windows operativsystem, enkelt och snabbt.
-
Evolutionär genetik
Evolutionär genetik är en packad sekvenseringstjänst designad för att tillhandahålla en heltäckande tolkning av evolutionär information för givet material baserat på genetiska variationer, inklusive SNP, InDels, SVs och CNVs.Den tillhandahåller all grundläggande analys som krävs för att beskriva evolutionära förändringar och genetiska egenskaper hos populationer, såsom populationsstruktur, genetisk mångfald, fylogeniförhållanden, etc. Den innehåller också studier om genflöde, vilket möjliggör uppskattning av effektiv populationsstorlek, divergenstid.
-
Jämförande genomik
Jämförande genomik betyder bokstavligen att jämföra de fullständiga genomsekvenserna och strukturerna för olika arter.Denna disciplin syftar till att avslöja artutveckling, genfunktion, genreglerande mekanism på genomnivå genom att identifiera sekvensstrukturer och element som konserverat eller differentierat mellan olika arter.Typisk jämförande genomikstudie inkluderar analyser i genfamilj, evolutionär utveckling, helgenomduplicering, selektivt tryck, etc.
-
Evolutionär genetik
Populations- och evolutionär genetisk analysplattform är etablerad på basen av enorm erfarenhet som samlats inom BMK FoU-team i åratal.Det är ett användarvänligt verktyg speciellt för forskare som inte har bioinformatik som huvudämne.Denna plattform möjliggör grundläggande evolutionär genetikrelaterad basanalys inklusive fylogenetisk trädkonstruktion, länkojämviktsanalys, genetisk mångfaldsbedömning, selektiv svepanalys, släktskapsanalys, PCA, populationsstrukturanalys, etc.
-
Hi-C-baserad Genome Assembly
Hi-C är en metod utformad för att fånga kromosomkonfigurationer genom att kombinera sonderande närhetsbaserade interaktioner och sekvensering med hög genomströmning.Intensiteten av dessa interaktioner tros vara negativt korrelerad med fysiskt avstånd på kromosomerna.Därför kan Hi-C-data vägleda klustringen, ordningen och orienteringen av sammansatta sekvenser i ett utkast till genom och förankra dem på ett visst antal kromosomer.Denna teknik möjliggör en genomsamling på kromosomnivå i frånvaro av populationsbaserad genetisk karta.Varje enskilt genom behöver ett Hi-C.
Plattform: Illumina NovaSeq Plattform / DNBSEQ
-
Plant/Animal De Novo Genome Sequencing
De Novosekvensering hänvisar till konstruktion av en arts hela genom med hjälp av sekvenseringsteknologier, t.ex. PacBio, Nanopore, NGS, etc., i frånvaro av ett referensgenom.Den anmärkningsvärda förbättringen av läslängden för tredje generationens sekvenseringsteknologier har medfört nya möjligheter när det gäller att sammanställa komplexa genom, såsom de med hög heterozygositet, hög kvot av repetitiva regioner, polyploider, etc. Med läslängd på tiotals kilobaser möjliggör dessa sekvenseringsläsningar upplösning av repetitiva element, regioner med onormalt GC-innehåll och andra mycket komplexa regioner.
Plattform: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq-plattform
-
Människans hela exomsekvensering
Hel exome-sekvensering (WES) betraktas som en kostnadseffektiv sekvenseringsstrategi för att identifiera sjukdomsorsakande mutationer.Även om exoner bara tar upp cirka 1,7% av hela genomet, representerar det profilen för totala proteinfunktioner direkt.I mänskligt genom har det rapporterats att mer än 85 % av sjukdomsrelaterade mutationer förekommer i proteinkodande region.
BMKGENE erbjuder heltäckande och flexibla mänskliga hela exome-sekvenseringstjänster med olika exonfångststrategier tillgängliga för att möta olika forskningsmål.
Plattform: Illumina NovaSeq Plattform
-
Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
Genotypning med hög genomströmning, särskilt på storskalig population, är ett grundläggande steg i genetiska associationsstudier, vilket ger genetisk grund för funktionell genupptäckt, evolutionär analys, etc. Istället för djupgående omsekvensering av hela genomet, reducerad representationsgenomsekvensering (RRGS) ) introduceras för att minimera sekvenseringskostnaden per prov, samtidigt som rimlig effektivitet vid upptäckt av genetisk markör upprätthålls.Detta uppnås vanligtvis genom att extrahera restriktionsfragment inom ett givet storleksintervall, vilket kallas reducerat representationsbibliotek (RRL).Specifik-locus amplifierad fragmentsekvensering (SLAF-Seq) är en egenutvecklad strategi för SNP-genotypning med eller utan ett referensgenom.
Plattform: Illumina NovaSeq Plattform -
Illumina och BGI
Illumina sekvenseringsteknologi, baserad på Sequencing by Synthesis (SBS), är en globalt anammad NGS-innovation, ansvarig för att generera över 90 % av världens sekvenseringsdata.Principen för SBS involverar avbildning av fluorescensmärkta reversibla terminatorer när varje dNTP tillsätts och därefter klyvs för att möjliggöra inkorporering av nästa bas.Med alla fyra reversibla terminatorbundna dNTP: er närvarande i varje sekvenseringscykel, minimerar naturlig konkurrens inkorporeringsbias.Denna mångsidiga teknologi stöder både enkellästa och parade bibliotek, vilket tillgodoser en rad genomiska applikationer.Illumina-sekvenseringens förmåga och precision med hög genomströmning positionerar den som en hörnsten i genomikforskning, vilket ger forskare möjlighet att reda ut genomens krångligheter med oöverträffad detalj och effektivitet.
DNBSEQ, utvecklat av BGI, är en annan innovativ NGS-teknologi som har lyckats minska ytterligare ned sekvenseringskostnaderna och öka genomströmningen.Beredning av DNBSEQ-bibliotek involverar DNA-fragmentering, beredning av ssDNA och rullande cirkelamplifiering för att erhålla DNA-nanobollarna (DNB).Dessa laddas sedan på en fast yta och sekvenseras därefter genom kombinatorisk Probe-Anchor Synthesis (cPAS).
Vår förtillverkade bibliotekssekvenseringstjänst underlättar för kunder att förbereda sina sekvenseringsbibliotek från olika källor (mRNA, helgenom, amplikon, bland annat).Därefter kan dessa bibliotek skickas till våra sekvenseringscenter för kvalitetskontroll och sekvensering i Illumina- eller BGI-plattformar.
