lncRNR
Ilgos nekoduojančios RNR (lncRNR) yra RNR, ilgesnės nei 200 nukleotidų, pasižyminčios mažu kodavimo potencialu, bet atliekančios svarbias reguliavimo funkcijas. BMKCloud lncRNR kanalas skirtas analizuoti rRNR neturinčias bibliotekas su aukštos kokybės, gerai anotuotu etaloniniu genomu, kartu analizuojant lncRNR ir mRNR raišką. Po nuskaitymų apkarpymo ir kokybės kontrolės nuskaitymai sulygiuojami su etaloniniu genomu, kad būtų surinkti transkriptai, o vėlesnė genų struktūros analizė atskleidžia alternatyvų splaisingą ir naujus genus. Transkriptai identifikuojami kaip mRNR arba lncRNR, o diferencinės raiškos analizė nustato skirtingai ekspresuojamas lncRNR, jų taikinius ir skirtingai ekspresuojamus genus (DEGS). Tiek DEG, tiek skirtingai ekspresuojami lncRNR taikiniai yra funkciškai anotuojami, kad būtų rastos praturtintos funkcinės kategorijos.
Bioinformatika
