lncrna

Долгите некодирачки РНК (lncRNA) се РНК подолги од 200 нуклеотиди со низок потенцијал за кодирање, но со критични регулаторни функции. Протокот на BMKCloud lncRNA е дизајниран да анализира библиотеки со осиромашена rRNA со висококвалитетен, добро анотиран референтен геном, со анализа на lncRNA и mRNA експресија заедно. По скратувањето на читањето и контролата на квалитетот, читањата се усогласуваат со референтниот геном за да се состават транскриптите, а последователната анализа на структурата на гените открива алтернативно спојување и нови гени. Транскриптите се идентификуваат како mRNA или lncRNA, а анализата на диференцијалната експресија ги идентификува диференцијално експресираните lncRNA, нивните цели и диференцијално експресираните гени (DEGS). И DEG и диференцијално експресираните lncRNA цели се функционално анотирани за да се пронајдат збогатени функционални категории.