Секвенционирање на метатранскриптоми
Карактеристики на услугата
● намалување на rRNA проследено со насочена подготовка на библиотеката на mRNA.
● Секвенционирање на Illumina NovaSeq.
Предности на услугата
●Проучете ги промените на сложените микробни заедници:Ова се случува на транскрипционо ниво и истражува потенцијални нови гени.
●Објаснување на интеракциите на микробната заедница со домаќинот или околината.
●Сеопфатна биоинформатичка анализаОва дава увид во таксономските и функционалните состави на заедницата, како и анализа на диференцијалната генска експресија.
●Обемна генска анотација:Користење на ажурирани бази на податоци за генската функција за информативни информации за генската експресија на микробните заедници.
●Поддршка по продажбата:Нашата посветеност се протега и по завршувањето на проектот со 3-месечен постпродажен период на услуга. Во овој период, нудиме следење на проектот, помош при решавање проблеми и сесии со прашања и одговори за да одговориме на сите прашања поврзани со резултатите.
Спецификации за услугата
| Платформа за секвенционирање | Стратегија за секвенционирање | Препорачани податоци | Контрола на квалитетот на податоците |
| Илумина НоваСек | PE150 | 12GB | Q30≥85% |
Примерни барања
| Концентрација (ng/µL) | Вкупна количина (µg) | Волумен (µL) | OD260/280 | OD260/230 | РИН |
| ≥50 | ≥1,0 | ≥20 | 1,8-2,0 | 1,0-2,5 | ≥6,5 |
Тек на работа на услугата
Достава на примероци
Изградба на библиотека
Секвенционирање
Анализа на податоци
Постпродажни услуги
Вклучува следнава анализа:
● Контрола на квалитетот на податоците за секвенционирање
● Собирање на транскрипт
● Таксономска анотација и изобилство
● Функционална анотација и изобилство
● Квантификација на изрази и диференцијална анализа
Таксономска дистрибуција на секој примерок:
Анализа на бета разновидност: UPGMA
Функционална анотација – изобилство на GO
Диференцијална таксономија на изобилство – LEFSE
Истражете ги напредоците овозможени од услугите за секвенционирање метатранскриптомика на BMKGene преку курирана колекција на публикации.
Лу, З. и др. (2023) „Толеранцијата на киселина кај бактериите од редот Bacteroidales кои користат лактат придонесува за спречување на ацидоза на руменот кај кози адаптирани на исхрана со висок концентрат“,Исхрана на животните, 14, стр. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Сонг, З. и др. (2017) „Разоткривање на основната функционална микробиота во традиционална ферментација во цврста состојба со ампликони со висок проток и метатранскриптомично секвенционирање“,Граници во микробиологијата, 8 (ЈУЛ). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Ванг, В. и др. (2022) „Нови миковируси откриени од метатранскриптомско истражување на фитопатогената габа Алтернарија“,Вируси, 14(11), стр. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Веи, Ј. и др. (2022) „Паралелната анализа на метатранскриптомите открива деградација на секундарните метаболити на растенијата од страна на бубачките и нивните цревни симбионти“,Молекуларна Екологија, 31 (15), стр. 3999-4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
