Метатранскриптомско секвенционирање
Карактеристики на услугата
● осиромашување на rRNA проследено со насочена подготовка на библиотека на mRNA.
● Секвенционирање на Illumina NovaSeq.
Предности на услугата
●Проучете ги промените на сложените микробиолошки заедници:Ова се случува на ниво на транскрипција и се истражуваат потенцијални нови гени.
●Објаснување на интеракциите на микробната заедница со домаќинот или околината.
●Сеопфатна биоинформатска анализа: Ова дава увид за таксономските и функционалните состави на заедницата, како и анализа на диференцијалната генска експресија.
●Опширна генска прибелешка:Користење на ажурирани бази на податоци за генски функции за информативни информации за генската експресија на микробните заедници.
●Пост-продажна поддршка:Нашата посветеност се протега надвор од завршувањето на проектот со 3-месечен период на услуга по продажбата. Во ова време, нудиме следење на проектот, помош за решавање проблеми и сесии за прашања и одговори за да одговориме на какви било прашања поврзани со резултатите.
Спецификации за услуги
| Платформа за секвенционирање | Стратегија за секвенционирање | Препорачани податоци | Контрола на квалитетот на податоците |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12 GB | Q30≥85% |
Примерок барања
| Концентрација (ng/µL) | Вкупна количина (μg) | Волумен (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1,0 | ≥20 | 1,8-2,0 | 1,0-2,5 | ≥6,5 |
Тек на услужна работа
Испорака на примерок
Изградба на библиотека
Секвенционирање
Анализа на податоци
Услуги по продажба
Ја вклучува следната анализа:
● Контрола на квалитетот на податоците за секвенционирање
● Собрание на препис
● Таксономска прибелешка и изобилство
● Функционална прибелешка и изобилство
● Квантификација на изразување и диференцијална анализа
Таксономска дистрибуција на секој примерок:
Анализа на бета разновидност: UPGMA
Функционална прибелешка - GO изобилство
Диференцијална таксономија изобилство – LEFSE
Истражете ги достигнувањата олеснети од услугите за секвенционирање на мета транскриптомика на BMKGene преку курирана колекција на публикации.
Лу, З. и сор. (2023) „Толеранцијата на киселина на бактериите кои користат лактат од редот Bacteroidales придонесува за спречување на руминална ацидоза кај козите прилагодени на диета со висок концентрат“,Исхрана на животните, 14, стр. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) „Откривање на јадрото на функционалната микробиота во традиционалната ферментација во цврста состојба со ампликони со висок пропуст и метатранскриптомичко секвенционирање“,Граници во микробиологијата, 8 (ЈУЛИ). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Ванг, В. и сор. (2022) „Нови миковируси откриени од метатранскриптомичко истражување на фитопатогената алтернарија габа“,Вируси, 14 (11), стр. 2552. дои: 10.3390/V14112552/S1.
Веи, Ј. и сор. (2022) „Паралелната метатранскриптомска анализа открива деградација на секундарните метаболити на растенијата од бубачки и нивните цревни симбиони“,Молекуларна Екологија, 31 (15), стр. 3999-4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
