Секвенционирање на бисулфит со намалена застапеност (RRBS)
Спецификации за услуги
Платформа: NovaSeq платформа, PE150
Тип на библиотека: 200-400bp ДНК библиотека обработена со бисулфит
Стратегија за секвенционирање: Paired-End 150 bp
Препорачај излез на податоци: 10 Gb необработени податоци/примерок
Примерок барања
Количина на ДНК: ≥ 2ug
Концентрација на ДНК:≥ 20ng/μl.
Чистота: OD260/280 = 1,8 до 2,0 без деградација или контаминација со РНК
Биоинформатичка анализа
Тек на услужна работа
Испорака на примероци
Изградба на библиотека
Секвенционирање
Анализа на податоци
Услуги по продажба
a.Референтна статистика за усогласување на геномот
Статистика на мапирање чита
Sстатистички податоци за длабочината на секвенционирањето и покриеноста на местото C
Aакумулирана покриеност
Dефикасност на варење на секој примерок
b.Откривање на место за метилација
Список на нивоа на метилација на местото C
BS конверзија
Mетилиран цитозин
Дистрибуција на нивото на метилација
c.Карта на метилација
Gширум еном
Gеном елемент
d.Споредба на нивоата на метилација помеѓу примероците
Pairwise Корелација на CG метилација
PCA-CG метилација
Cлустерирање на CG метилација
d.Диференцијална метилација анализа
Sстатистика на DMR
Дистрибуција на должина на DMR
Hјади карта
DДистрибуција на МР во целниот регион
