Метагеномика (NGS)

Брзата метагеномика со Illumina е популарна алатка за проучување на микробиомите со директно секвенционирање на ДНК од комплексни примероци, овозможувајќи проучување и на таксономската и на функционалната разновидност. Протокот на метагеномот (NGS) на BMKCloud започнува со контрола на квалитетот и склопување на метагеномот, од каде што гените се предвидуваат и групираат во нередундантни бази на податоци кои се анотирани за функција и таксономија користејќи повеќе бази на податоци. Овие информации се користат за анализа на таксономската разновидност во рамките на примерокот (алфа разновидност) и разновидноста помеѓу примероците (бета разновидност). Диференцијалната анализа помеѓу групите ги наоѓа OTU и биолошките функции што се разликуваат помеѓу двете групи користејќи и параметарски и непараметарски тестови, додека корелациската анализа ги поврзува овие разлики со факторите на животната средина.