အပူမြေပုံ
Matrix ဒေတာဖိုင်ကို မက်ထရစ်ဒေတာကို စစ်ထုတ်ရန်၊ ပုံမှန်ဖြစ်စေရန်နှင့် အစုအဝေးပြုလုပ်နိုင်သည့် အပူမြေပုံရေးဆွဲရန်အတွက် အသုံးပြုသည်။မတူညီသောနမူနာများကြားရှိ မျိုးရိုးဗီဇဖော်ပြမှုအဆင့်၏အစုလိုက်အပြုံလိုက်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုအတွက် ၎င်းကို အများအားဖြင့်အသုံးပြုသည်။
ဗီဇ မှတ်ချက်
Gene Function မှတ်ချက်သည် ဒေတာဘေ့စ်အမျိုးမျိုးနှင့် FASTA ဖိုင်တွင် အတွဲလိုက်များကို ပုံဖော်ခြင်းဖြင့် လုပ်ဆောင်သည်။
ဗီဇ မှတ်ချက်
အခြေခံ Local Alignment Search Tool
CDS_UTR_ခန့်မှန်းချက်
ဤကိရိယာသည် လူသိများသော ပရိုတိန်းဒေတာဘေ့စ်နှင့် ORF ခန့်မှန်းချက်များကို ဆန့်ကျင်သော ပေါက်ကွဲအားကို အခြေခံ၍ ပေးထားသော စာသားမှတ်တမ်းအစီအမံများတွင် ကုဒ်နံပါတ်များ (CDS) နှင့် မဟုတ်သော ဒေသများ (UTR) ကို ခန့်မှန်းရန် ဒီဇိုင်းထုတ်ထားသည်။
Manhattan Plot
Manhattan plot သည် data point အများအပြားဖြင့် data များကိုပြသနိုင်သည်။ဂျီနိုမ်ကျယ်ပြန့်သောအသင်းအဖွဲ့လေ့လာမှုများ (GWAS) တွင် အများအားဖြင့် အသုံးပြုသည်။
Circos
CIRCOS ပုံကြမ်းသည် ဂျီနိုမ်ပေါ်တွင် SNP, InDeL, SV, CNV ဖြန့်ဝေမှုများကို တိုက်ရိုက်တင်ပြနိုင်စေပါသည်။
GO_ကြွယ်ဝမှု
TopGO သည် လုပ်ငန်းဆောင်တာများ ကြွယ်ဝစေရန်အတွက် ဒီဇိုင်းထုတ်ထားသော ကိရိယာတစ်ခုဖြစ်သည်။TopGO-Bioconductor ပက်ကေ့ဂျ်တွင် ကွဲပြားသောအသုံးအနှုန်းခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု၊ GO ကြွယ်ဝမှုခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုနှင့် ရလဒ်များကို မြင်ယောင်မှုတို့ ပါဝင်သည်။၎င်းသည် topGO_BP၊ topGO_CC နှင့် topGO_MF အတွက် ရလဒ်များပါရှိသော "Graph" ဟူသော အထွက်ပါရှိသော ဖိုင်တွဲကို ထုတ်ပေးမည်ဖြစ်သည်။
WGCNA
WGCNA သည် gene co-expression modules များကို ရှာဖွေတွေ့ရှိရန်အတွက် အသုံးများသော ဒေတာတူးဖော်ရေးနည်းလမ်းတစ်ခုဖြစ်သည်။microarray data နှင့် gene expression data အပါအဝင် အမျိုးမျိုးသော expression dataset နှင့် သက်ဆိုင်ပါသည်။
InterProScan
InterPro ပရိုတိန်းအစီအစဥ်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာနှင့်အမျိုးအစားခွဲခြား
GO_KEGG_ ကြွယ်ဝမှု
ဤကိရိယာသည် ပံ့ပိုးပေးထားသည့် ဗီဇအစုံနှင့် သက်ဆိုင်သောမှတ်ချက်များအပေါ် အခြေခံ၍ GO ကြွယ်ဝမှုဟစ်စတိုဂရမ်၊ KEGG ကြွယ်ဝမှုဟစ်စတိုဂရမ်နှင့် KEGG ကြွယ်ဝမှုလမ်းကြောင်းကို ဖန်တီးရန် ဒီဇိုင်းထုတ်ထားသည်။