BMKCloud Log in
条形banner-၀၃

ထုတ်ကုန်များ

Illumina နှင့် BGI

Illumina sequencing နည်းပညာသည် Sequencing by Synthesis (SBS) ကိုအခြေခံ၍ ကမ္ဘာတစ်ဝှမ်းလုံးလက်ခံထားသော NGS ဆန်းသစ်တီထွင်မှုဖြစ်ပြီး၊ ကမ္ဘာ့ sequencing data ၏ 90% ကျော်ကိုထုတ်ပေးရန်တာဝန်ရှိသည်။SBS ၏ နိယာမတွင် dNTP တစ်ခုစီကို ပေါင်းထည့်ထားသောကြောင့် နောက်ပြန်အုတ်မြစ်ကို ပေါင်းစပ်ထည့်သွင်းထားသောကြောင့် အလင်းတန်းဖြင့် ပြောင်းပြန်လှန်နိုင်သော terminator များကို ဓါတ်ပုံရိုက်ခြင်းတွင် ပါဝင်ပြီး နောက်အခြေခံတစ်ခု၏ပေါင်းစပ်မှုကို ခွင့်ပြုရန် နောက်ပိုင်းတွင် ပိုင်းခြားထားသည်။နောက်ပြန်လှည့်နိုင်သော terminator-bound dNTP လေးခုလုံးသည် ဆက်တိုက်လည်ပတ်သည့်စက်ဝန်းတစ်ခုစီတွင် ရှိနေသဖြင့်၊ သဘာဝပြိုင်ဆိုင်မှုသည် ပေါင်းစည်းခြင်းဆိုင်ရာ ဘက်လိုက်မှုကို လျော့နည်းစေသည်။ဤစွယ်စုံရနည်းပညာသည် တစ်ခုတည်း-ဖတ်ပြီး တွဲစပ်ပြီးသည့် စာကြည့်တိုက်များကို ပံ့ပိုးပေးကာ မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ အပလီကေးရှင်းများစွာကို ပံ့ပိုးပေးသည်။Illumina sequencing ၏ high-throughput စွမ်းရည်များနှင့် တိကျမှုတို့က ၎င်းအား မျိုးရိုးဗီဇသုတေသနတွင် အုတ်မြစ်တစ်ခုအဖြစ် သတ်မှတ်ပေးကာ သိပ္ပံပညာရှင်များအား ဂျီနိုမ်များ၏ ရှုပ်ထွေးနက်နဲမှုများကို လိုက်လျောညီထွေမရှိသော အသေးစိတ်နှင့် ထိရောက်မှုတို့ဖြင့် ဖော်ထုတ်နိုင်စေရန် စွမ်းဆောင်ပေးပါသည်။

BGI မှတီထွင်ထုတ်လုပ်ထားသော DNBSEQ သည် စီတန်းခြင်းကုန်ကျစရိတ်များကိုပိုမိုလျှော့ချရန်နှင့် ဖြတ်သန်းမှုတိုးမြှင့်ရန် စီမံထားသော ဆန်းသစ်သော NGS နည်းပညာဖြစ်သည်။DNBSEQ စာကြည့်တိုက်များ ပြင်ဆင်ခြင်းတွင် DNA နာနိုဘောများ (DNB) ရရှိရန် ssDNA ပြင်ဆင်မှုနှင့် စက်ဝိုင်းချဲ့ခြင်း ပါဝင်သည်။ထို့နောက် ၎င်းတို့ကို အစိုင်အခဲ မျက်နှာပြင်ပေါ်သို့ တင်ဆောင်ကာ ပေါင်းစပ်မှုဆိုင်ရာ Probe-Anchor Synthesis (cPAS) ဖြင့် နောက်ဆက်တွဲ လုပ်ဆောင်သည်။

ကျွန်ုပ်တို့၏ကြိုတင်ပြုလုပ်ထားသော စာကြည့်တိုက် စီစစ်ခြင်းဝန်ဆောင်မှုသည် မတူကွဲပြားသောရင်းမြစ်များ (mRNA၊ ဂျီနိုမ်၊ အမ်ပလီကွန်၊ အခြားအရာများ) မှ ၎င်းတို့၏ sequencing စာကြည့်တိုက်များကို ပြင်ဆင်ရာတွင် သုံးစွဲသူများကို လွယ်ကူချောမွေ့စေသည်။နောက်ပိုင်းတွင်၊ ဤစာကြည့်တိုက်များကို Illumina သို့မဟုတ် BGI ပလပ်ဖောင်းများတွင် အရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှုနှင့် စီတန်းခြင်းအတွက် ကျွန်ုပ်တို့၏ sequencing စင်တာများသို့ ပေးပို့နိုင်ပါသည်။


ဝန်ဆောင်မှုအသေးစိတ်

သရုပ်ပြရလဒ်

အင်္ဂါရပ်များ

ပလပ်ဖောင်းများ-Illumina NovaSeq 6000၊ NovaSeq၊ HiSeq X Ten နှင့် BGI-DNB-T7

ဆက်တိုက်မုဒ်များ-PE50, PE100, PE150, PE250

အတွဲလိုက်မလုပ်မီ စာကြည့်တိုက်များ၏ အရည်အသွေးကို ထိန်းချုပ်ပါ။

ဒေတာပေးပို့ခြင်းနှင့် QC စီခြင်း-QC အစီရင်ခံစာနှင့် ကုန်ကြမ်းဒေတာကို demultiplexing နှင့် filtering Q30 ဖတ်ပြီးနောက် fastq ဖော်မတ်ဖြင့် ပေးပို့ခြင်း။

 

ဝန်ဆောင်မှု အားသာချက်များ

Sequencing ဝန်ဆောင်မှုများ၏ ဘက်စုံသုံးနိုင်မှု-သုံးစွဲသူသည် လမ်းကြော၊ စီးဆင်းမှုဆဲလ် သို့မဟုတ် ဒေတာပမာဏအလိုက် စီရန်ရွေးချယ်နိုင်သည်။

ပလပ်ဖောင်းများ၏ ဘက်စုံအသုံးပြုနိုင်မှု-DNB စာကြည့်တိုက်များကို Illumina ပလပ်ဖောင်းများသို့လွှဲပြောင်းနိုင်သည်။

Illumina sequencing platform တွင် ကျယ်ပြန့်သော အတွေ့အကြုံ။မျိုးစိတ်အမျိုးမျိုးဖြင့် ပိတ်ထားသော ပရောဂျက်ပေါင်း ထောင်နှင့်ချီ၍ 

ဆက်တိုက် QC အစီရင်ခံစာပေးပို့ခြင်း-အရည်အသွေးတိုင်းတာမှုများ၊ ဒေတာတိကျမှုနှင့် စီစစ်ခြင်းပရောဂျက်၏ အလုံးစုံစွမ်းဆောင်ရည်တို့နှင့်အတူ။

အရွယ်ရောက်ပြီးသော စီတန်းခြင်းလုပ်ငန်းစဉ်-အလှည့်ကျအချိန်တိုဖြင့်။

တင်းကျပ်သောအရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှု: ကျွန်ုပ်တို့သည် အရည်အသွေးမြင့်မားသောရလဒ်များကို တစ်သမတ်တည်းပေးဆောင်ရန် အာမခံရန် တင်းကျပ်သော QC လိုအပ်ချက်များကို အကောင်အထည်ဖော်ပါသည်။

နမူနာလိုအပ်ချက်များ*

Partial Lane Sequencing

ဒေတာပမာဏ (X)

အာရုံစူးစိုက်မှု (qPCR/nM)

အတွဲ

X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 20 μl

50 Gb ≤ X < 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 20 μl

X ≥ 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 20 μl

တစ်လမ်းသွား (Illumina)

ပလပ်ဖောင်း

အာရုံစူးစိုက်မှု (qPCR/nM)

အတွဲ

HiSeq X Ten

≥ 2 nM

≥ 20 μl

NovaSeq 6000 SP

≥ 1 nM

≥ 25 μl

NovaSeq 6000 S4

≥ 1.5 nM

≥ 25 μl

NovaSeq X

≥ 1.5 nM

≥ 25 μl

BGI-DNBSEQ-T7

≥ 1.5 nM

≥ 25 μl

 အာရုံစူးစိုက်မှုနှင့် စုစုပေါင်းပမာဏအပြင် သင့်လျော်သော အမြင့်ဆုံးပုံစံတစ်ခုလည်း လိုအပ်ပါသည်။

 

သင်၏နမူနာများသည် စတင်သည့်ပစ္စည်းလိုအပ်ချက်များနှင့် မကိုက်ညီပါက ကျွန်ုပ်တို့ထံ ဆက်သွယ်ပါ။

ဝန်ဆောင်မှုလုပ်ငန်းအသွားအလာ

နမူနာပြင်ဆင်မှု

စာကြည့်တိုက်အရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှု

Sequencing

Sequencing

ဒေတာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ

ဒေတာအရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှု

နမူနာ QC

စီမံကိန်းပေးပို့ခြင်း။


  • ယခင်-
  • နောက်တစ်ခု:

  • စာကြည့်တိုက် QC အစီရင်ခံစာ

    အတွဲလိုက်၊ စာကြည့်တိုက် ပမာဏကို အကဲဖြတ်ခြင်းနှင့် အပိုင်းပိုင်းခွဲခြင်းမပြုမီ စာကြည့်တိုက်၏ အရည်အသွေးဆိုင်ရာ အစီရင်ခံစာကို ပံ့ပိုးပေးပါသည်။

     

    QC အစီရင်ခံစာကို စီစစ်ခြင်း။

     

    ဇယား 1. ကိန်းဂဏာန်းများ စီစစ်ခြင်းဆိုင်ရာ ကိန်းဂဏန်းများ။

    နမူနာ ID

    BMKID

    အကြမ်းဖတ်တယ်။

    ဒေတာအကြမ်း (bp)

    သန့်ရှင်းစွာဖတ်ခြင်း (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    ၂၂,၈၇၀,၁၂၀

    ၆,၈၆၁,၀၃၆,၀၀၀

    ၉၆.၄၈

    ၉၉.၁၄

    ၉၄.၈၅

    ၃၆.၆၇

    C_02

    BMK_02

    ၁၄၊၇၁၇၊၈၆၇

    ၄၊၄၁၅၊၃၆၀၊၁၀၀

    ၉၆.၀၀

    ၉၈.၉၅

    ၉၃.၈၉

    ၃၇.၀၈

    ပုံ 1။ နမူနာတစ်ခုစီတွင် ဖတ်ရှုထားသော အရည်အသွေးများ ဖြန့်ဝေခြင်း။

    A9

    ပုံ 2။ အခြေခံအကြောင်းအရာ ဖြန့်ဖြူးခြင်း။

    A10

    ပုံ 3။ အချက်အလက် စီတန်းခြင်းတွင် ဖတ်ထားသော အကြောင်းအရာများကို ဖြန့်ဝေခြင်း။

    A11

     

    ကိုးကားရယူပါ။

    သင့်စာကို ဤနေရာတွင် ရေးပြီး ကျွန်ုပ်တို့ထံ ပေးပို့ပါ။

    သင့်ထံ မက်ဆေ့ချ်ပို့ပါ-