ဂျီနိုမ်တစ်ခုလုံးဆိုင်ရာ ဆက်စပ်မှု ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်း
လုပ်ငန်းလည်ပတ်မှု
ဝန်ဆောင်မှုအားသာချက်များ
●ကျယ်ပြန့်သောကျွမ်းကျင်မှုနှင့် ထုတ်ဝေမှုမှတ်တမ်းများGWAS တွင် စုဆောင်းရရှိထားသော အတွေ့အကြုံများဖြင့် BMKGene သည် လူဦးရေ GWAS သုတေသနတွင် မျိုးစိတ်စီမံကိန်း ရာပေါင်းများစွာကို ပြီးမြောက်အောင် လုပ်ဆောင်ခဲ့ပြီး သုတေသီများအား ဆောင်းပါး ၁၀၀ ကျော် ထုတ်ဝေရန် ကူညီပေးခဲ့ပြီး စုစုပေါင်း သက်ရောက်မှုအချက် ၅၀၀ အထိ ရောက်ရှိခဲ့သည်။
● ပြည့်စုံသော ဇီဝသတင်းအချက်အလက်ဆိုင်ရာ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု: လုပ်ငန်းစဉ်တွင် SNP-trait association analysis ပါဝင်ပြီး candidate gene အစုံနှင့် ၎င်းတို့၏ သက်ဆိုင်ရာ functional annotation ကို ပေးပို့သည်။
●အရည်အချင်းပြည့်ဝသော ဇီဝသတင်းအချက်အလက်အဖွဲ့နှင့် ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုစက်ဝန်းတိုတောင်းခြင်းအဆင့်မြင့် မျိုးရိုးဗီဇ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတွင် အတွေ့အကြုံကောင်းများဖြင့် BMKGene ၏အဖွဲ့သည် လျင်မြန်သော အချိန်ဖြင့် ပြည့်စုံသော ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုများကို ပေးဆောင်ပါသည်။
●ရောင်းချပြီးနောက် ပံ့ပိုးမှု-ကျွန်ုပ်တို့၏ ကတိကဝတ်သည် ရောင်းချပြီးနောက် ၃ လ ဝန်ဆောင်မှုကာလဖြင့် ပရောဂျက်ပြီးစီးမှုထက် ကျော်လွန်ပါသည်။ ဤအချိန်အတောအတွင်း၊ ပရောဂျက်နောက်ဆက်တွဲလုပ်ဆောင်မှု၊ ပြဿနာရှာဖွေဖြေရှင်းခြင်းအကူအညီနှင့် ရလဒ်များနှင့်သက်ဆိုင်သည့် မည်သည့်မေးမြန်းချက်များကိုမဆို ဖြေရှင်းရန် မေးခွန်းများနှင့် အဖြေများကဏ္ဍများကို ကျွန်ုပ်တို့ ပေးဆောင်ပါသည်။
ဝန်ဆောင်မှုသတ်မှတ်ချက်များနှင့် လိုအပ်ချက်များ
| အစီအစဉ်ချခြင်း အမျိုးအစား | အကြံပြုထားသော လူဦးရေ စကေး | အစီအစဉ်ချခြင်း ဗျူဟာ | နျူကလီယိုတိုက် လိုအပ်ချက်များ |
| ဂျီနိုမ်တစ်ခုလုံး အစီအစဉ်ချခြင်း | နမူနာ ၂၀၀ | ၁၀ ဆ | ပါဝင်မှု: ≥ 1 ng/ µL စုစုပေါင်းပမာဏ ≥ 30ng ယိုယွင်းပျက်စီးခြင်း သို့မဟုတ် ညစ်ညမ်းမှု အကန့်အသတ်ရှိသည် သို့မဟုတ် မရှိပါ |
| Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF) | တဂ်အနက်: ၁၀ ဆ တဂ်အရေအတွက်: < ၄၀၀ Mb: WGS ကို အကြံပြုထားသည် < 1Gb: တဂ် ၁၀၀,၀၀၀ ၁ ဂစ်ဂါဘိုက် > 2Gb: တဂ် ၃၀၀,၀၀၀ အများဆုံး ၅၀၀၀၀၀ တဂ်များ | ပါဝင်မှု ≥ 5 ng/µL စုစုပေါင်းပမာဏ ≥ 80 ng နာနိုဒရော့ပ် OD260/280=1.6-2.5 အာဂါရို့စ်ဂျယ်- ယိုယွင်းပျက်စီးခြင်း သို့မဟုတ် ညစ်ညမ်းခြင်း မရှိ သို့မဟုတ် အကန့်အသတ်ရှိသည်
|
ပစ္စည်းရွေးချယ်မှု
မတူညီသော မျိုးကွဲများ၊ မျိုးစိတ်ခွဲများ၊ ကုန်းနေမျိုးစိတ်များ/မျိုးရိုးဗီဇဘဏ်များ/ရောနှောမျိုးရင်းများ/တောရိုင်းအရင်းအမြစ်များ
မတူညီသော မျိုးကွဲများ၊ မျိုးစိတ်ခွဲများ၊ ကုန်းနေမျိုးစိတ်များ
မောင်နှမတစ်ဝက် မိသားစု/မောင်နှမအပြည့် မိသားစု/တောရိုင်းအရင်းအမြစ်များ
ဝန်ဆောင်မှုလုပ်ငန်းစီးဆင်းမှု
စမ်းသပ်ချက်ဒီဇိုင်း
နမူနာပို့ဆောင်ခြင်း
RNA ထုတ်ယူခြင်း
စာကြည့်တိုက်တည်ဆောက်ခြင်း
အစီအစဉ်ချခြင်း
ဒေတာ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်း
ရောင်းချပြီးနောက်ဝန်ဆောင်မှုများ
အောက်ပါ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု ပါဝင်သည်-
- ဂျီနိုမ်တစ်ခုလုံးဆိုင်ရာ ဆက်စပ်မှု ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု- LM၊ LMM၊ EMMAX၊ FASTLMM မော်ဒယ်
- ကိုယ်စားလှယ်လောင်း မျိုးဗီဇများ၏ လုပ်ဆောင်ချက်ဆိုင်ရာ မှတ်ချက်ပေးခြင်း
SNP-လက္ခဏာဆက်စပ်မှု ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်း – မန်ဟက်တန်ကွက်
SNP-လက္ခဏာဆက်စပ်မှု ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်း – QQ ကွက်
BMKGene ၏ de GWAS ဝန်ဆောင်မှုများမှ ပံ့ပိုးပေးသော တိုးတက်မှုများကို စုစည်းထားသော စာစောင်များမှတစ်ဆင့် လေ့လာပါ-
Lv, L. et al. (၂၀၂၃) 'မျိုးရိုးဗီဇကျယ်ပြန့်သော ဆက်စပ်လေ့လာမှုမှတစ်ဆင့် razor clam Sinonovacula constricta ရှိ အမိုးနီးယားခံနိုင်ရည်ရှိမှု၏ မျိုးရိုးဗီဇအခြေခံကို ထိုးထွင်းသိမြင်ခြင်း'၊ရေနေသတ္တဝါမွေးမြူရေး, ၅၆၉၊ စာ- ၇၃၉၃၅၁။ doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351။
Li, X. et al. (၂၀၂၂) 'မြေခွေးအမြီး millet မျိုးကွဲ ၃၉၈ မျိုး၏ Multi-omics ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုများသည် အိမ်မွေးတိရစ္ဆာန်အဖြစ် မွေးမြူခြင်း၊ ဇီဝဖြစ်စဉ်ဆိုင်ရာ လက္ခဏာများနှင့် ရောင်ရမ်းမှုကို ဆန့်ကျင်သည့် အာနိသင်များနှင့် ဆက်စပ်နေသော genomic ဒေသများကို ဖော်ထုတ်ပေးသည်'၊မော်လီကျူးစက်ရုံ၊ 15(8)၊ စ၊ ၁၃၆၇–၁၃၈၃။ doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003။
Li, J. et al. (၂၀၂၂) 'မိုးခေါင်ရေရှားပတ်ဝန်းကျင်တွင် Hulless Barely Phenotypes များ၏ Genome-Wide Association Mapping'၊အပင်သိပ္ပံတွင် နယ်နိမိတ်များ, ၁၃၊ စာ- ၉၂၄၈၉၂။ doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX။
Zhao၊ X. et al. (၂၀၂၁) 'ဆာလ်ဖိုထရန်စဖာရေ့စ်ကို အကုဒ်လုပ်ထားသော GmST1 သည် ပဲပိစပ်မိုဇိုင်းဗိုင်းရပ်စ်မျိုးကွဲ G2 နှင့် G3 ကို ခံနိုင်ရည်ရှိစေသည်'၊အပင်၊ ဆဲလ်နှင့် ပတ်ဝန်းကျင်၊ ၄၄(၈)၊ စ၊ ၂၇၇၇–၂၇၉၂။ doi- 10.1111/PCE.14066။
