Metagenomics (NGS)

Illumina နှင့် Shotgun Metagenomics သည် ရှုပ်ထွေးသောနမူနာများမှ DNA များကို တိုက်ရိုက် စီစစ်ခြင်းဖြင့် အဏုဇီဝဇီဝရုပ်များကို လေ့လာရန် ရေပန်းစားသော ကိရိယာတစ်ခုဖြစ်ပြီး အခွန်စည်းကြပ်မှုနှင့် လုပ်ငန်းဆိုင်ရာ ကွဲပြားမှုကို လေ့လာနိုင်စေပါသည်။ BMKCloud metagenomic (NGS) ပိုက်လိုင်းသည် အရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှုနှင့် metagenome စုစည်းမှုဖြင့် စတင်သည်၊ ၎င်းမှ မျိုးဗီဇများကို ခန့်မှန်းပြီး ဒေတာဘေ့စ်များစွာကို အသုံးပြု၍ လုပ်ဆောင်ချက်နှင့် စည်းကြပ်မှုများအတွက် မှတ်ကျောက်တင်ထားသည့် ထပ်မတွတ်မဖြစ်သောဒေတာအတွဲများအဖြစ် အစုလိုက်အပြုံလိုက် ပေါင်းစပ်ထားသည်။ ဤအချက်အလက်ကို နမူနာအခွန်စည်းကြပ်ကွဲပြားမှု (alpha diversity) နှင့်-နမူနာမတူကွဲပြားမှု (beta diversity) အကြားပိုင်းခြားစိတ်ဖြာရန်အသုံးပြုသည်။ အုပ်စုများအကြား ကွဲပြားသော ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတွင် ပါရာမက်ထရစ်နှင့် ပါရာမက်ထရစ်စစ်ဆေးမှုနှစ်ခုစလုံးကို အသုံးပြု၍ အုပ်စုနှစ်ခုကြားတွင် ကွဲပြားသော OTUs နှင့် ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာလုပ်ဆောင်ချက်များကို တွေ့ရှိပြီး ဆက်စပ်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတွင် အဆိုပါကွဲပြားမှုများကို ပတ်ဝန်းကျင်ဆိုင်ရာအချက်များနှင့် ဆက်စပ်နေပါသည်။