ရည်ညွှန်းဂျီနိုမ်ပါသည့် mRNA-seq (NGS)

RNA-seq သည် သက်ရှိနှင့် သီးနှံသိပ္ပံများတွင် စံသတ်မှတ်ထားသောကိရိယာတစ်ခုဖြစ်ပြီး ဂျီနိုမ်များနှင့် ပရိုတီယိုမ်များအကြား ကွာဟချက်ကို ပေါင်းကူးပေးသည်။ ၎င်း၏အားသာချက်မှာ မှတ်တမ်းအသစ်များကို ရှာဖွေတွေ့ရှိခြင်းနှင့် ၎င်းတို့၏ဖော်ပြချက်ကို တစ်ခုတည်းသော assay တွင် ပမာဏသတ်မှတ်ခြင်းတွင် တည်ရှိသည်။ ၎င်းကို နှိုင်းယှဉ်မှတ်တမ်းလေ့လာမှုများအတွက် ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့်အသုံးပြုကြပြီး မျိုးဗီဇပြောင်းလဲမှုများကို wild-types များနှင့် နှိုင်းယှဉ်ခြင်း သို့မဟုတ် သတ်မှတ်ထားသောအခြေအနေများအောက်တွင် မျိုးဗီဇဖော်ပြချက်ကို ဖော်ပြခြင်းကဲ့သို့သော ကွဲပြားသော ဝိသေသလက္ခဏာများ သို့မဟုတ် phenotypes များနှင့် ဆက်စပ်နေသော မျိုးဗီဇများကို အလင်းပြပေးသည်။ BMKCloud mRNA(Reference) APP သည် ဖော်ပြချက်ပမာဏ၊ differential expression analysis(DEG) နှင့် sequence structure analysis များကို mRNA-seq(NGS) ဇီဝသတင်းအချက်အလက်ဆိုင်ရာ pipeline ထဲသို့ ပေါင်းစပ်ပြီး အလားတူဆော့ဖ်ဝဲလ်၏ အားသာချက်များကို ပေါင်းစပ်ထားသောကြောင့် အဆင်ပြေမှုနှင့် အသုံးပြုရလွယ်ကူမှုကို သေချာစေသည်။ အသုံးပြုသူများသည် ၎င်းတို့၏ RNA-seq data ကို cloud သို့ upload လုပ်နိုင်ပြီး App သည် ပြည့်စုံသော၊ တစ်နေရာတည်းတွင် ဇီဝသတင်းအချက်အလက်ဆိုင်ရာ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုဖြေရှင်းချက်ကို ပေးဆောင်သည်။ ထို့အပြင်၊ ၎င်းသည် သုံးစွဲသူအတွေ့အကြုံကို ဦးစားပေးပြီး အသုံးပြုသူများ၏ သီးခြားလိုအပ်ချက်များအတွက် စိတ်ကြိုက်ပြုလုပ်ထားသော စိတ်ကြိုက်လုပ်ဆောင်မှုများကို ပေးဆောင်သည်။ အသုံးပြုသူများသည် parameter များကို သတ်မှတ်နိုင်ပြီး pipeline mission ကို ၎င်းတို့ကိုယ်တိုင် တင်သွင်းနိုင်သည်၊ interactive report ကို စစ်ဆေးနိုင်သည်၊ data/diagram များကို ကြည့်ရှုနိုင်ပြီး target gene selection၊ functional clustering၊ diagramming စသည်တို့ကဲ့သို့သော data mining ကို အပြီးသတ်နိုင်သည်။