ارتقايي جینیات
د خدماتو ګټې
تاکاګي او نور،د نباتاتو ژورنال، ۲۰۱۳
●جامع بایو انفارماتیک تحلیل:د جینیاتي تنوع اټکل فعالول، کوم چې د ډولونو د تکامل وړتیا منعکس کوي، او د ډولونو ترمنځ د باور وړ فایلوجینیټیک اړیکه څرګندوي چې د متقابل ارتقا او موازي ارتقا لږترلږه نفوذ لري.
●اختیاري دودیز تحلیل: لکه د نیوکلیوټایډ او امینو اسیدونو په کچه د تغیراتو پر بنسټ د انحراف وخت او سرعت اټکل.
●پراخه تخصص او د خپرولو ریکارډونه: BMKGene د ۱۵ کلونو څخه زیات د نفوس او ارتقايي جینیات په پروژو کې پراخه تجربه راټوله کړې، چې زرګونه ډولونه یې پوښلي، او نور یې پوښلي او د نیچر کمیونیکیشنز، مالیکولر نباتاتو، د نباتاتو بایو ټیکنالوژۍ ژورنال، او نورو کې خپاره شوي له ۱۰۰۰ څخه زیاتو لوړ پوړو پروژو کې یې مرسته کړې.
● د بایو انفارمیټکس لوړ مهارت لرونکی ټیم او لنډ تحلیلي دوره: د پرمختللي جینومیک تحلیل کې د عالي تجربې سره، د BMKGene ټیم په ګړندي بدلون وخت کې جامع تحلیلونه وړاندې کوي.
● د خرڅلاو وروسته ملاتړ:زموږ ژمنه د پروژې له بشپړېدو هاخوا د خرڅلاو وروسته د درې میاشتو خدمت دورې سره غځېږي. پدې موده کې، موږ د پروژې تعقیب، د ستونزو حل کولو مرستې، او د پایلو پورې اړوند هرې پوښتنې ته د ځواب ویلو لپاره د پوښتنو او ځوابونو غونډې وړاندې کوو.
د خدماتو مشخصات او اړتیاوې
| د ترتیب ډول | د نفوسو سپارښتنه شوې کچه | د ترتیب کولو ستراتیژي | د نیوکلیوټایډ اړتیاوې |
| د ټول جینوم ترتیب | ≥ 30 کسان، د هر فرعي ګروپ څخه ≥ 10 کسان
| ۱۰x | غلظت: ≥ ۱ ننګ/ µL ټول مقدار≥ 30 ګرامه محدود یا هیڅ تخریب یا ککړتیا نشته |
| د ځانګړي ځای پراخ شوی ټوټه (SLAF) | د ټاګ ژوروالی: ۱۰x د ټګونو شمېر: <400 Mb: WGS سپارښتنه کیږي <1 جي بي: ۱۰۰ زره ټګونه ۱ جي بي >۲ جي بي: ۳۰۰ زره ټګونه اعظمي ۵۰۰ زره ټګونه | غلظت ≥ 5 ng/µL ټول مقدار ≥ ۸۰ نانو ګرامه نانوډراپ OD260/280=1.6-2.5 د اګاروز جیل: هیڅ یا محدود تخریب یا ککړتیا نشته
|
د خدماتو کاري جریان
د تجربې ډیزاین
د نمونې تحویلي
د کتابتون جوړول
د ترتیب ترتیب
د معلوماتو تحلیل
د خرڅلاو وروسته خدمتونه
په دې خدمت کې د نفوسو د جوړښت تحلیل (د فایلوجینیټیک ونې، PCA، د نفوسو د طبقه بندي چارټ)، د نفوس تنوع، او د نفوسو انتخاب (د اړیکو نا انډولتیا، د ګټورو ځایونو انتخابي سویپ انتخاب) شامل دي. په دې خدمت کې دودیز تحلیل هم شامل کیدی شي (د بیلګې په توګه د انحراف وخت، د جین جریان).
*دلته ښودل شوي ډیمو پایلې ټول د BMKGENE سره خپاره شوي جینومونو څخه دي.
۱. د ارتقا تحلیل د جینیاتي تغیراتو پر بنسټ د فایلوجینیټیک ونې جوړښت، د نفوس جوړښت او PCA شامل دي.
د فایلوجینیټیک ونې د هغو نوعو ترمنځ چې ګډ نیکه لري د ټیکسونومیک او ارتقايي اړیکو استازیتوب کوي.
د PCA موخه دا ده چې د فرعي نفوسو ترمنځ نږدېوالی تصور کړي.
د نفوسو جوړښت د ایلیل فریکونسیو له مخې د جینیاتي پلوه جلا فرعي نفوس شتون ښیي.
چن، او نور،د PNAS، ۲۰۲۰
۲. انتخابي سویپ
انتخابي سویپ هغه پروسې ته اشاره کوي چې له مخې یې یو ګټور سایټ غوره کیږي او د تړلو بې طرفه سایټونو فریکونسۍ زیاتیږي او د غیر تړلو سایټونو فریکونسۍ کمیږي، چې په پایله کې یې سیمه ایز کمښت راځي.
په انتخابي سویپ سیمو کې د جینوم پراخه کشف د ټولو SNPs د نفوس جینیاتي شاخص (π، Fst، تاجیما D) محاسبه کولو سره پروسس کیږي چې د سلایډینګ کړکۍ (100 Kb) دننه په یو ټاکلي ګام (10 Kb) کې وي.
د نیوکلیوټایډ تنوع (π)
د تاجیما ډي
د فکسشن شاخص (Fst)
وو، او نور،مالیکولي نبات، ۲۰۱۸
۳. د جین جریان
وو، او نور،مالیکولي نبات، ۲۰۱۸
۴. د نفوسو تاریخ
ژانګ، او نور،د طبیعت ایکولوژي او ارتقا، ۲۰۲۱
۵. د انحراف وخت
ژانګ، او نور،د طبیعت ایکولوژي او ارتقا، ۲۰۲۱
د BMKGene د ارتقايي جینیاتي خدماتو لخوا د خپرونو د یوې جوړې شوې ټولګې له لارې اسانتیاوې وپلټئ:
حسن یار، اې کې او نور (۲۰۲۳) 'د بشپړ جینوم ریزیکنسنګ لخوا په اپیس سیرانا سیرانا لاروا کې د ساکبروډ ویروس مقاومت سره تړلي د SNP مالیکولر مارکرونو او نوماند جینونو کشف'،د مالیکولي علومو نړیوال ژورنال, 24(7). doi: 10.3390/IJMS24076238.
چای، جي. او نور (۲۰۲۲) 'د یو وحشي، جینیاتي پلوه خالص چینایي لوی سالامانډر کشف د ساتنې نوي فرصتونه رامینځته کوي'،ژوبڼ څېړنه، ۲۰۲۲، ټوک ۴۳، ګڼه ۳، مخونه: ۴۶۹-۴۸۰، ۴۳(۳)، مخونه ۴۶۹–۴۸۰. doi: ۱۰.۲۴۲۷۲/J.ISSN.۲۰۹۵-۸۱۳۷.۲۰۲۲.۱۰۱.
هان، ایم. او نور (۲۰۲۲) 'د چنګهای-تبتی پلیټو په اړه د اصلي ایلیموس سیبیریکس ایل. فیلوجیوګرافیکي نمونه او د نفوس ارتقا تاریخ'،د نباتاتو په ساینس کې سرحدونه، ۱۳، مخ ۸۸۲۶۰۱. doi: ۱۰.۳۳۸۹/FPLS.۲۰۲۲.۸۸۲۶۰۱/BIBTEX.
وانګ، جي. او نور (۲۰۲۲) 'د کروموزوم کچې جینوم اسمبلۍ څخه د لونګان ارتقا په اړه جینومیک بصیرتونه او د لونګان اکسیژنونو نفوس جینومیک'،د باغدارۍ څیړنه، ۹. doi: ۱۰.۱۰۹۳/HR/UHAC021.
