-
پروټومکس
پروټومکس په پروټینونو تمرکز کوي - د ژوند فعالیتونو اجرا کونکي چې د ارګانیزم د لیږد تنظیم کې مهم رول لوبوي. دا په نسجونو یا حجرو کې د ټولو متحرک بدلیدونکي پروټینونو ترکیب، د بیان کچه، او د تعدیل حالتونه تحلیل کوي، د ژوند په مختلفو پروسو باندې د پروټوم کثرت متحرکاتو د پام وړ اغیزې په ګوته کوي. په طب، کرنه او څارویو پالنه کې په پراخه کچه کارول کیږي. کیفیتي پروټومکس د HPLC-MS/MS پروټین پیژندنې ټیکنالوژۍ څخه کار اخلي ترڅو نمونې وپیژني پشمول د جیل سټریپونه، IP، او CO-IP/Pull down نمونې. کمیتي پروټومکس د جینوم یا په پیچلي مخلوط سیسټم کې څرګند شوي ټولو پروټینونو دقیق مقدار او پیژندنه ترلاسه کوي. اوسني کمیتي پروټومکس ټیکنالوژي په عمده توګه په لیبل شوي (TMT) او لیبل څخه پاک (لیبل څخه پاک، DIA، PRM) طریقو کې طبقه بندي شوي. BMKGENE څو پلیټ فارم او څو ټیکنالوژۍ پروټومکس حلونه چمتو کوي.
-
میټابولومیکونه
میټابولومکس، د جینومیک یوه ښکته برخه، په عمده توګه کوچني مالیکولي مواد په نښه کوي چې د 1500 Da څخه کم مالیکولي وزن لري. دا میټابولیتونو ته وړتیا ورکوي چې د بهرني محرکاتو او فزیولوژیکي / رنځپوهنیز بدلونونو په وړاندې د ژوندیو موجوداتو غبرګونونه په ډیر حساس ډول منعکس کړي. د جینیاتي بدلونونو له امله رامینځته شوي میټابولایټ کچه بدلونونه هم د دې څیړنې په ساحه کې دي، چې د څیړنې یو نوی لید چمتو کوي.
BMKGENE د میټابولومیک خدماتو بشپړ لړۍ وړاندې کوي، پشمول د غیر هدف لرونکي میټابولومیکونو، په پراخه کچه هدف لرونکي میټابولومیکونو، او هدف لرونکي میټابولومیکونو. د مایع کروماتګرافي-ماس سپیکٹرومیټري (LC-MS) یا ګاز کروماتګرافي-ماس سپیکٹرومیټري (GC-MS) په کارولو سره، د بهرني محرک څخه دمخه او وروسته په ژوندیو موجوداتو کې د ډیری کوچني مالیکول میټابولیتونو متحرک بدلونونه کشف کیدی شي. د دې خدماتو اصلي موخه د تجربوي او کنټرول ګروپونو ترمنځ د پام وړ توپیرونو سره میټابولیتونه پیژندل او د فزیولوژیکي / رنځپوهنیز بدلونونو او اصلي میکانیزمونو سره د دوی اړیکې نوره سپړنه ده.
-
د خارجي زوجي mRNA/LncRNA/CircRNA تسلسل-الومینا
اکسوزومونه کوچني رګونه دي چې د حجرو لخوا پټیږي، معمولا د 30 څخه تر 100 نانومیټرو پورې قطر لري. دا رګونه مختلف RNA لري. باور کیږي چې اکسوزومونه د حجرو ترمنځ اړیکو، معافیت غبرګونونو، او د ناروغیو پراختیا کې مهم رول لوبوي، او د بدن نورو برخو ته د بدن د مایعاتو لکه پلازما، لعاب او پیشاب له لارې لیږدول کیدی شي. دوی د ترلاسه کونکي حجرو د دندو تنظیم کولو لپاره ځانګړي بایو مالیکولونه لري، د حجرو فیزیولوژیکي حالتونو اغیزه کوي. اکسوزومونه د ناروغیو په پراختیا کې کلیدي رول لوبولو لپاره هم ګڼل کیږي، پشمول د سرطان، عصبي ناروغیو، او التهابي شرایطو. د اکسوزومونو څیړنه د ناروغیو تشخیص، درملنې او مخنیوي لپاره نوي بصیرتونه او میتودونه وړاندې کوي.
-
د کوچنيو خارجي زوجي RNA تسلسل-الومینا
Exosomes کوچني vesicles دي چې د حجرو لخوا پټیږي، معمولا د 30 څخه تر 100 نانومیټرو پورې قطر لري. دا vesicles مختلف RNA لري. په exosomes کې د RNA ډولونو په منځ کې، ترټولو عام او په پراخه کچه مطالعه شوی مایکرو آر این اے (miRNA) دی. miRNA د غیر کوډ کولو کوچني RNAs یوه ټولګه ده چې شاوخوا 18-25 نیوکلیوټایډونه اوږدوالی لري. دوی د هدف mRNAs د 3′ غیر ژباړل شوي سیمې (3′ UTR) سره تړلو سره د لیږد وروسته جین خاموش کولو منځګړیتوب کوي، په دې توګه د جین څرګندونه تنظیموي. د مثال په توګه، د ځینو تومور حجرو لخوا پټ شوي exosomes ځانګړي miRNAs لري، لکه miR-126 او miR-92a. دا miRNAs کولی شي د ترلاسه کونکي حجرو کې د جین څرګندونه اغیزمنه کړي او د تومور انجیوجینیسیس ته وده ورکړي (توموهیرو اومیزو، او نور، آنکوجین، 2012).
-
د BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
فضايي ټرانسکرپټومکس یوه تخنیک ده چې موږ ته اجازه راکوي چې د نسجونو دننه د جین څرګندونې ونیسو او تصور یې کړو. دا د دې لپاره خورا مهم کیدی شي چې پوه شي چې حجرې څنګه تعامل کوي.
د دې طریقې لپاره مختلف پلیټ فارمونه شتون لري. پدې مسله کې، BMKGene د BMKManu 3000 Spatial transcriptome Chip رامینځته کړی، یو پلیټ فارم چې د تخنیک فعالیت لوړوي، فرعي حجروي ریزولوشن ته رسیږي او د څو کچې ریزولوشن ترتیب فعالوي.
دا چپ د مایکرو ویلونو د پیټینټ شوي ټیکنالوژۍ په کارولو سره 4.2 ملیون ځایونه پوښي چې د ځایي بارکوډ شوي پروبونو سره بار شوي مڼو سره پرت شوي دي. د دې طریقې سره، د نیولو او پراخولو وروسته، موږ د بارکوډ شوي نمونو سره بډایه شوي cDNA کتابتون ترلاسه کوو چې دا د ایلومینا سره مطابقت لري.
په معلوماتو کې، د ځایي بارکوډ او UMIs ترکیب د تولید شوي معلوماتو دقت او ځانګړتیا ډاډمن کوي. د پورته ټولو سره یوځای کولو سره، BMKManu یو خورا څو اړخیزه ډیټا ترتیب چمتو کوي.
-
د DNBSEQ مخکې جوړ شوي کتابتونونه
DNBSEQ، چې د MGI لخوا رامینځته شوی، د NGS یوه نوښتګره ټیکنالوژي ده چې د ترتیب لګښتونه نور هم کم کړي او د تروپټ زیات کړي. د DNBSEQ کتابتونونو چمتو کول د DNA ټوټې کول، د ssDNA چمتو کول، او د DNA نانوبالونو (DNB) ترلاسه کولو لپاره د حلقې رولینګ امپلیفیکیشن شامل دي. دا بیا په جامد سطحه بار کیږي او وروسته د ګډ پروب-انکر ترکیب (cPAS) لخوا ترتیب کیږي. د DNBSEQ ټیکنالوژي د نانوبالونو سره د لوړ کثافت غلطی نمونو کارولو سره د ټیټ امپلیفیکیشن غلطی نرخ درلودلو ګټې سره یوځای کوي، چې پایله یې د لوړ تروپټ او دقت سره ترتیب کول دي.
زموږ د مخکې جوړ شوي کتابتون ترتیب خدمت پیرودونکو ته دا توان ورکوي چې د مختلفو سرچینو (mRNA، ټول جینوم، امپلیکون، 10x کتابتونونو، او نورو) څخه د ایلومینا ترتیب کتابتونونه چمتو کړي، کوم چې زموږ په لابراتوارونو کې د MGI کتابتونونو ته بدلیږي ترڅو په DNBSEQ-T7 کې ترتیب شي، چې په ټیټ لګښتونو کې د لوړ معلوماتو مقدار فعالوي.
-
د های-سي پر بنسټ د کروماتین تعامل
های-سي یوه طریقه ده چې د جینومیک ترتیب د نیولو لپاره ډیزاین شوې ده چې د نږدېوالي پر بنسټ تعاملاتو او لوړ-تروپوټ ترتیب سره یوځای کیږي. دا طریقه د کروماتین کراس لینکینګ سره د فارملډایډ سره ولاړه ده، وروسته هضم او بیا لیګیشن په داسې ډول چې یوازې هغه ټوټې چې په همغږۍ سره تړلي وي د لیګیشن محصولات جوړوي. د دې لیګیشن محصولاتو ترتیب کولو سره، دا ممکنه ده چې د جینوم درې بعدي تنظیم مطالعه شي. های-سي د جینوم د هغو برخو ویش مطالعه کولو ته اجازه ورکوي چې په سپک ډول بسته شوي دي (A برخې، یوکروماتین) او ډیر احتمال لري چې د نقل کولو له پلوه فعال وي، او هغه سیمې چې ډیرې ټینګې بسته شوي دي (B برخې، هیټروکروماتین). های-سي د ټوپولوژیکي پلوه اړونده ډومینونو (TADs)، د جینوم هغه سیمې چې پوښل شوي جوړښتونه لري او احتمال لري چې ورته څرګندونې نمونې ولري، او د کروماتین لوپونو، DNA سیمې پیژندلو لپاره هم کارول کیدی شي چې د پروټینونو لخوا یوځای شوي او ډیری وختونه په تنظیمي عناصرو کې بډایه کیږي. د BMKGene د Hi-C ترتیب خدمت څیړونکو ته دا توان ورکوي چې د جینومیکونو فضايي ابعاد وپلټي، د جینوم تنظیم او په روغتیا او ناروغۍ کې د هغې اغیزې پوهیدو لپاره نوې لارې پرانیزي.
-
د PacBio 2+3 بشپړ اوږدوالی mRNA حل
که څه هم د NGS پر بنسټ د mRNA ترتیب د جین د څرګندولو د اندازه کولو لپاره یو څو اړخیزه وسیله ده، په لنډو لوستلو باندې تکیه کول د پیچلو ټرانسکرپټومیک تحلیلونو کې د هغې اغیزمنتوب محدودوي. له بلې خوا، د PacBio ترتیب (Iso-Seq) د اوږد لوستلو ټیکنالوژي کاروي، چې د بشپړ اوږدوالي mRNA لیږدونو ترتیب فعالوي. دا طریقه د بدیل سپلیسینګ، جین فیوژن، او پولی-اډینیلیشن جامع سپړنه اسانه کوي، که څه هم دا د جین د څرګندولو د اندازه کولو لپاره لومړنی انتخاب نه دی. د 2+3 ترکیب د Illumina او PacBio ترمنځ تشه د PacBio HiFi لوستلو باندې تکیه کولو سره پل کوي ترڅو د ټرانسکرپټ isoforms او NGS ترتیب بشپړ سیټ وپیژني ترڅو ورته isoforms اندازه کړي.
پلیټ فارمونه: PacBio Revio او Illumina NovaSeq
-
د جینوم په کچه د ټولنې تحلیل
د جینوم-وایډ ایسوسی ایشن مطالعاتو (GWAS) موخه د جینیاتي ډولونو (جینوټایپونو) پیژندل دي چې د ځانګړو ځانګړتیاو (فینوټایپونو) سره تړاو لري. د ډیری اشخاصو په ټول جینوم کې د جینیاتي نښه کونکو په څیړلو سره، GWAS د نفوس کچې احصایوي تحلیلونو له لارې د جینټایپ-فینوټایپ اتحادیې پراخوي. دا میتودولوژي د انسانانو ناروغیو په څیړنه او په څارویو یا نباتاتو کې د پیچلو ځانګړتیاو پورې اړوند فعال جینونو سپړلو کې پراخه غوښتنلیکونه موندلي.
په BMKGENE کې، موږ په لویو نفوسو کې د GWAS ترسره کولو لپاره دوه لارې وړاندې کوو: د بشپړ جینوم ترتیب (WGS) کارول یا د کم استازیتوب جینوم ترتیب میتود غوره کول، د کور دننه رامینځته شوی سپیکیفیکل لوکس امپلیفایډ فریګمینټ (SLAF). پداسې حال کې چې WGS د کوچنیو جینومونو سره مناسب دی، SLAF د اوږد جینومونو سره د لویو نفوسو مطالعې لپاره د لګښت مؤثره بدیل په توګه راڅرګندیږي، په مؤثره توګه د ترتیب لګښتونه کموي، پداسې حال کې چې د لوړ جینیاتي مارکر کشف موثریت تضمینوي.
-
د واحدې هستې د RNA تسلسل
د واحد حجروي نیول او د دودیز کتابتون جوړولو تخنیکونو پراختیا، د لوړ تروپټ ترتیب سره یوځای، د حجرو په کچه د جین د څرګندولو مطالعاتو کې انقلاب راوستی دی. دا پرمختګ د پیچلو حجروي نفوس ژور او ډیر جامع تحلیل ته اجازه ورکوي، د ټولو حجرو په اړه د جین د څرګندولو اوسط سره تړلي محدودیتونه لرې کوي او پدې نفوسو کې ریښتیني متفاوتیت ساتي. پداسې حال کې چې د واحد حجروي RNA ترتیب (scRNA-seq) د نه منلو وړ ګټې لري، دا په ځینو نسجونو کې ننګونو سره مخ کیږي چیرې چې د واحد حجروي تعلیق رامینځته کول ستونزمن ثابت کیږي او تازه نمونو ته اړتیا لري. په BMKGene کې، موږ د عصري 10X جینومکس کرومیم ټیکنالوژۍ په کارولو سره د واحد نیوکلیوس RNA ترتیب (snRNA-seq) وړاندې کولو سره دا خنډ حل کوو. دا طریقه د واحد حجروي کچې کې د ټرانسکرپټوم تحلیل لپاره د منلو وړ نمونو سپیکٹرم پراخوي.
د هستې جلا کول د نوښتګر 10X جینومکس کرومیم چپ له لارې ترسره کیږي، چې د دوه ګوني کراسنګ سره د اتو چینل مایکرو فلوایډکس سیسټم لري. پدې سیسټم کې، د جیل مڼې چې بارکوډونه، پرائمرونه، انزایمونه، او یو واحد نیوکلیوس پکې شامل دي د نانو لیټر په اندازه د تیلو څاڅکو کې پوښل شوي، د جیل مڼې-ان-ایمولشن (GEM) جوړوي. د GEM د جوړښت وروسته، د حجرو لیسیس او د بارکوډ خوشې کول په هر GEM کې واقع کیږي. وروسته، د mRNA مالیکولونه په cDNAs کې د ریورس ټرانسکرپشن څخه تیریږي، چې 10X بارکوډونه او ځانګړي مالیکولر پیژندونکي (UMIs) پکې شامل دي. دا cDNAs بیا د معیاري ترتیب کتابتون جوړونې تابع کیږي، چې د واحد حجرو په کچه د جین د څرګندولو پروفایلونو قوي او جامع سپړنه اسانه کوي.
پلیټ فارم: ۱۰× جینومکس کرومیم او ایلومینا نووا سیک پلیټ فارم
-
د نباتاتو/حیواناتو د بشپړ جینوم ترتیب
د بشپړ جینوم ترتیب (WGS) هغه تخنیک دی چې د یو ژوندي موجود د جینوم بشپړ DNA ترتیب په یو وخت کې ټاکلو لپاره کارول کیږي.
معمولا، خدمت د حوالې جینوم شتون پورې اړه لري په دوو مختلفو ډلو ویشل کیږي:
- نوید جینوم بشپړ ترتیب.په دې حالت کې، هغه جینوم چې ترتیب کیږي د حوالې جینوم شتون نلري، او د همدې دلیل لپاره، د دې ترتیب هدف دا دی چې دا تولید کړي (یا د موجوده یو ښه کول). دا تخنیک باید د لوستلو ترمنځ د اوورلیپ رامینځته کولو سره د جینوم اسمبلۍ ته وده ورکولو لپاره، د ایلومینا ډیټا او اوږد لوستلو ترتیب دواړه وکاروي.
- بیا ترتیب کول.دا د مختلفو ډولونو د جینومونو بشپړ ترتیب ته اشاره کوي چې د پیژندل شوي حوالې جینومونو سره دي. په دې اساس، د افرادو یا نفوسو جینومیک توپیرونه نور هم پیژندل کیدی شي.
-
د بشپړ اوږدوالي mRNA تسلسل - نانوپور
که څه هم د NGS پر بنسټ د mRNA ترتیب د جین د څرګندولو د اندازه کولو لپاره یو څو اړخیزه وسیله ده، په لنډو لوستلو باندې تکیه کول د پیچلو ټرانسکرپټومیک تحلیلونو کې د هغې اغیزمنتوب محدودوي. له بلې خوا، نانوپور ترتیب د اوږد لوستلو ټیکنالوژۍ کاروي، چې د بشپړ اوږدوالي mRNA ټرانسکرپټونو ترتیب فعالوي. دا طریقه د بدیل سپلیسینګ، جین فیوژن، پولی اډینیلیشن، او د mRNA ایزوفارمونو اندازه کولو جامع سپړنه اسانه کوي.
د نانوپور ترتیب، یوه طریقه چې د نانوپور واحد مالیکول ریښتیني وخت بریښنایی سیګنالونو باندې تکیه کوي، په ریښتیني وخت کې پایلې چمتو کوي. د موټرو پروټینونو لخوا لارښود شوی، دوه ګونی ډنډ شوی DNA د بایوفیلم کې ځای پرځای شوي نانوپور پروټینونو سره تړل کیږي، کله چې دا د ولټاژ توپیر لاندې د نانوپور چینل څخه تیریږي خلاصیږي. د DNA سټرینډ کې د مختلفو اساساتو لخوا رامینځته شوي ځانګړي بریښنایی سیګنالونه په ریښتیني وخت کې کشف او طبقه بندي کیږي، دقیق او دوامداره نیوکلیوټایډ ترتیب اسانه کوي. دا نوښتګر چلند د لنډ لوستلو محدودیتونو څخه تیریږي او د پیچلي جینومیک تحلیل لپاره متحرک پلیټ فارم چمتو کوي، پشمول د پیچلي ټرانسکرپټومیک مطالعاتو سره، د سمدستي پایلو سره.
پلیټ فارم: نانوپور پرومیتیون ۴۸
-
د بشپړ اوږدوالي mRNA ترتیب - PacBio
پداسې حال کې چې د NGS پر بنسټ د mRNA ترتیب د جین د څرګندولو د اندازه کولو لپاره یو څو اړخیز وسیله ده، په لنډو لوستلو باندې تکیه کول په پیچلو ټرانسکرپټومیک تحلیلونو کې د هغې کارول محدودوي. له بلې خوا، PacBio ترتیب (Iso-Seq) د اوږد لوستلو ټیکنالوژي کاروي، د بشپړ اوږدوالي mRNA لیږدونو ترتیب فعالوي. دا طریقه د بدیل سپلیسینګ، جین فیوژن، او پولی اډینیلیشن جامع سپړنه اسانه کوي. په هرصورت، د اړتیا وړ ډیټا لوړ مقدار له امله د جین د څرګندولو اندازه کولو لپاره نور انتخابونه شتون لري. د PacBio ترتیب ټیکنالوژي په واحد مالیکول، ریښتیني وخت (SMRT) ترتیب تکیه کوي، د بشپړ اوږدوالي mRNA لیږدونو په نیولو کې یو ځانګړی ګټه چمتو کوي. پدې نوښتګر چلند کې د صفر موډ ویو ګایډونو (ZMWs) او مایکرو فابریکیټ شوي څاګانو کارول شامل دي چې د ترتیب کولو پرمهال د DNA پولیمریز فعالیت ریښتیني وخت مشاهده فعالوي. د دې ZMWs دننه، د PacBio DNA پولیمریز د DNA یو بشپړونکی سټرینډ ترکیب کوي، اوږد لوستل تولیدوي چې د mRNA لیږدونو ټول پوښښ لري. د سرکلر کنسینسس سیکوینسنګ (CCS) حالت کې د پیک بایو عملیات د ورته مالیکول په مکرر ترتیب کولو سره دقت لوړوي. تولید شوي های فای لوستل د NGS سره پرتله کیدونکي دقت لري، چې د پیچلو ټرانسکرپټومیک ځانګړتیاو جامع او باوري تحلیل کې نور هم مرسته کوي.
پلیټ فارم: PacBio Sequel II؛ PacBio Revio
