Metagenomic Sequencing-نانوپور
د خدماتو ګټې
Øد لوړ کیفیت مجلس - د ډولونو پیژندنې او فنکشني جین وړاندوینې دقت لوړول
Øد باکتریا جینوم جلا کول تړل
Øپه مختلفو برخو کې ډیر پیاوړی او د باور وړ غوښتنلیک، د بیلګې په توګه د رنځجنیک مایکروجنیزمونو یا د انټي بیوټیک مقاومت اړوند جینونو کشف
Øمقایسه میټاجینوم تحلیل
د خدماتو مشخصات
| ترتیب کولپلیټ فارم | کتابتون | وړاندیز شوي ډاټا حاصلات | اټکل شوی د بدلون وخت |
| Illumina NovaSeq 6000 | PE250 | 50K/100K/300K ټاګونه | 30 ورځې |
بایو انفارماتیک تحلیلونه
üد خام معلوماتو کیفیت کنټرول
üد میټاګینوم مجلس
üغیر بې ځایه جین سیټ او تشریح
üد ډولونو تنوع تحلیل
üد جنیټیک فعالیت تنوع تحلیل
üد ګروپ بین الافغاني تحلیل
üد تجربوي فکتورونو په وړاندې د اتحادیې تحلیل
د نمونې اړتیاوې او تحویلي
د نمونې اړتیاوې او تحویلي
د نمونې اړتیاوې:
لپارهد DNA استخراج:
| د نمونې ډول | مقدار | تمرکز | پاکوالی |
| د DNA استخراج | ＞ 30 ng | ＞ 1 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
د چاپیریال نمونې لپاره:
| د نمونې ډول | د نمونې اخیستلو وړاندیز شوی طرزالعمل |
| خاوره | د نمونې اندازه: نږدې5 g;پاتې وچ شوي مادې باید له سطحې لرې شي؛لوی ټوټې ټوټې کړئ او د 2 ملي میتر فلټر څخه تیر کړئ؛د ریزرویشن لپاره په جراثیمي EP-tube یا cyrotube کې د Aliquot نمونې. |
| ملا | د نمونې اندازه: نږدې5 g;د ذخیره کولو لپاره په جراثیمي EP-ټیوب یا کریوټیوب کې د الیکوټ نمونې راټول او راټول کړئ. |
| د کولمو منځپانګه | نمونې باید د اسپټیک حالت لاندې پروسس شي.راټول شوي نسجونه د PBS سره مینځل؛PBS سنټرفیوژ کړئ او په EP-ټیوبونو کې پریپیټینټ راټول کړئ. |
| سلج | د نمونې اندازه: نږدې5 g;د ریزرویشن لپاره په جراثیمي EP-ټیوب یا کریوټیوب کې د الیکوټ سلج نمونه راټول کړئ |
| د اوبو بدن | د محدود مقدار مایکروبیل نمونې لپاره، لکه د نل اوبه، د څاه اوبه، او داسې نور، لږ تر لږه 1 لیټره اوبه راټول کړئ او د 0.22 μm فلټر څخه تیر شئ ترڅو په غشا کې مایکروبیل غني کړي.جھلی په جراثیمی ټیوب کې ذخیره کړئ. |
| پوستکی | د پوټکي سطح په احتیاط سره د کاټن سویب یا جراحي تیغ سره وخورئ او په جراثیمي ټیوب کې یې ځای په ځای کړئ. |
وړاندیز شوی نمونه تحویلي
نمونې په مایع نایتروجن کې د 3-4 ساعتونو لپاره کنګل کړئ او په مایع نایټروجن یا -80 درجې کې د اوږدې مودې لپاره ذخیره کړئ.د وچې یخ سره د نمونې لیږد اړین دی.
د خدمت کاري جریان
د نمونې سپارل
د کتابتون جوړول
ترتیب کول
د معلوماتو تحلیل
د پلور وروسته خدمتونه
1. Heatmap: د ډولونو بډایه کلستر کول
2. فعلي جینونه د KEGG میټابولیک لارو ته تشریح شوي
3. د نسلونو د اړیکو شبکه
4. د کارډ د انټي بیوټیک مقاومت جینونو سرکوس
د BMK قضیه
نانوپور میټاګینومکس د باکتریا ټیټ تنفسي انفیکشن ګړندي کلینیکي تشخیص وړوي
خپور شوی:د طبیعت بایو ټیکنالوژي، 2019
تخنيکي ټکي
ترتیب کول: نانوپور منین
کلینیکي میټاګینومکس بایو انفارمیټکس: کوربه د DNA تخریب ، WIMP او ARMA تحلیل
چټک کشف: 6 ساعته
لوړ حساسیت: 96.6٪
کلیدي پایلې
په 2006 کې، د ټیټ تنفسي انتان (LR) په ټوله نړۍ کې د 3 ملیون انسانانو د مړینې لامل شو.د LR1 رنځجن کشف لپاره ځانګړی میتود کرنه ده، کوم چې ضعیف حساسیت لري، د اوږدې مودې په اوږدو کې او د انټي بیوټیک درملنې په لومړیو کې د لارښوونې نشتوالی دی.ګړندی او دقیق مایکروبیل تشخیص له اوږدې مودې راهیسې بیړنۍ اړتیا وه.د ختیځ انګلیا پوهنتون ډاکټر جسټین او د هغه ملګرو په بریالیتوب سره د نانوپور میشته میټاجینومیک میتود د رنځجن کشف لپاره رامینځته کړ.د دوی د کاري فلو له مخې، د کوربه DNA 99.99٪ له مینځه وړل کیدی شي.د ناروغیو او انټي بیوټیک مقاومت لرونکي جینونو کشف په 6 ساعتونو کې بشپړ کیدی شي.
حواله
چارالامپوس، ټي، کی، جی ایل، ریچارډسن، ایچ، آیډین، اې، او او ګریډي، جې.(۲۰۱۹).د نانوپور میټاګینومکس د باکتریا ټیټ تنفسي انفیکشن ګړندي کلینیکي تشخیص وړوي.د طبیعت بایو ټیکنالوژي، 37(7)، 1.
