میټاجینومیک تسلسل - TGS
میټاجینوم د ژوندیو موجوداتو د مخلوط ټولنې، لکه چاپیریالي او انساني میټاجینومونو د جینیاتي موادو ټولګه ده. دا د کښت وړ او غیر کښت وړ مایکرو ارګانیزمونو جینومونه لري. میټاجینومیک ترتیب د دې پیچلي جینومیک منظرو مطالعې ته اجازه ورکوي چې په ایکولوژیکي نمونو کې ځای پرځای شوي د ټیکسونومیک پروفایل کولو څخه ډیر څه چمتو کوي. دا د کوډ شوي جینونو او په چاپیریالي پروسو کې د دوی احتمالي رولونو سپړلو سره د فعال جینومیک لید هم وړاندې کوي. پداسې حال کې چې د ایلومینا ترتیب سره دودیز شاټګن طریقې په میټاجینومیک مطالعاتو کې په پراخه کچه کارول شوي، د نانوپور او پیک بایو اوږد لوستل شوي ترتیب راتګ ساحه بدله کړې. نانوپور او پیک بایو ټیکنالوژي د ښکته جریان بایو انفارمیټیک تحلیلونو ته وده ورکوي، په ځانګړي توګه د میټاجینوم اسمبلۍ، د ډیرو دوامداره اسمبلۍ ډاډ ورکوي. راپورونه ښیي چې نانوپور میشته او پیک بایو میشته میټاجینومیکونه په بریالیتوب سره د پیچلو مایکرو بایومونو څخه بشپړ او تړل شوي باکتریا جینومونه تولید کړي دي (ماس، ای ایل، او نور، نیچر بایوټیک، 2020). د نانوپور لوستونو سره د ایلومینا لوستونو یوځای کول د غلطۍ سمولو لپاره یو ستراتیژیک چلند چمتو کوي، د نانوپور د اصلي ټیټ دقت کموي. دا همغږي ترکیب د هر ترتیب پلیټ فارم ځواک څخه ګټه پورته کوي، د احتمالي محدودیتونو د لرې کولو لپاره یو قوي حل وړاندې کوي او د میټاجینومیک تحلیلونو دقت او اعتبار ته وده ورکوي.
پلیټ فارم: نانوپور پرومیتیون ۴۸، ایلومیا او پیک بایو ریویو
د خدماتو ځانګړتیاوې
● په نانوپور P48 (10Kb کتابتون) کې د اوږدې لوستلو ترتیب؛ د PacBio Revio (8Kb کتابتون)
● د تېروتنې اصلاح: په ایلومینا نووا سیک (PE150 کتابتون) کې ترتیب کول
د خدماتو ګټې
●د لوړ کیفیت میټاجینوم اسمبلۍ:د لږو کانټیګونو سره چې لوړ دوام لري.
●لوړ دقت:د ډولونو پیژندنه او د فعال جین وړاندوینه.
●ښه شوی مجلس: د باکتریا جینوم جلا کول او د میټاجینوم پرتله کولو تحلیل اسانه کول.
●د بایو انفارمیټکس جامع تحلیل:زموږ تحلیل نه یوازې د ټیکسونومیک تنوع باندې متمرکز دی بلکه د ټولنې په فعال تنوع هم متمرکز دی.
●پراخه تجربه: زموږ ټیم هرې پروژې ته د تجربې شتمني راوړي، د مختلفو څیړنیزو برخو کې د ډیری میټاجینومکس پروژو په بریالیتوب سره تړلو او له 200,000 څخه زیاتو نمونو پروسس کولو ریکارډ سره، زموږ ټیم هرې پروژې ته د تجربې شتمني راوړي.
د خدماتو مشخصات
| د ترتیب کولو پلیټ فارم | د ترتیب کولو ستراتیژي | سپارښتنه شوې معلومات |
| ایلومینا نووا سیک | PE150 د محصول ځانګړتیاوې | ۶ جي بي |
| نانوپور P48 | ۱۰ کیلو بایټه | ۶/۱۰ جي بي |
| د پیک بایو ریویو | ۸ کیلو بایټه | ۱۰ / ۲۰ جي بي |
د نمونې اړتیاوې
| غلظت (ng/µL) | ټول مقدار (µg) | حجم (µL) | |
| د ایلومینا PE150 کتابتون | ≥۱ | ≥0.03 | ≥۲۰ |
| نانوپور ۱۰ کیلو بایټه کتابتون | ≥۴۰ | ≥۲ | ≥۲۰ |
| د پیک بایو ۸ کیلو بایټه کتابتون | ≥۵۰ | ۱۰ µg/حجره | ≥۲۰ |
د خدماتو کاري جریان
د نمونې تحویلي
د کتابتون جوړول
د ترتیب ترتیب
د معلوماتو تحلیل
د خرڅلاو وروسته خدمتونه
لاندې تحلیلونه پکې شامل دي:
● د معلوماتو د کیفیت کنټرول ترتیبول
● د میټاجینوم اسمبلۍ او د جین وړاندوینه
● د جین تشریح
● د الفا د تنوع تحلیل
● د ټولنې فعال تحلیل: بیولوژیکي فعالیت، میټابولیک، د انټي بیوټیک مقاومت
● د فعالیت او ټیکسونومیک تنوع په اړه تحلیل:
د بیټا تنوع تحلیل
د ګروپونو ترمنځ تحلیل
د اړیکو تحلیل: د چاپیریالي عواملو او OUT جوړښت او تنوع ترمنځ
د غیر اضافي جین سیټ ویش:
د جین تشریح: د KEGG لاره
د جین تشریح: eggNOG
د جین تشریح: لیونی کاربوهایډریټ
د ډولونو د اړیکو شبکه:
د دې ځانګړې خپرونې سره د نانوپور + ایلومینا سره د BMKGene د میټاجینومکس ترتیب کولو خدمت لخوا اسانه شوي پرمختګونه وپلټئ:
جین، ایچ. او نور (۲۰۲۳) 'د داخلي منګولیایانو د انسان د کولمو مایکروبیوم د لوړ کیفیت جینوم مجموعه'، نیچر مایکروبیولوژي ۲۰۲۳ ۸:۱، ۸(۱)، مخونه ۱۵۰–۱۶۱. doi: ۱۰.۱۰۳۸/s۴۱۵۶۴-۰۲۲-۰۱۲۷۰-۱.
