-
د جینوم پراخه اتحادیه تحلیل
د جینوم پراخه انجمن مطالعه (GWAS) موخه د جینیاتي ډولونو (جینوټایپ) پیژندل دي چې د ځانګړي ځانګړتیاو (فینوټایپ) سره تړاو لري.د GWAS مطالعه د جنیټیک مارکرونو پلټنه کوي د لوی شمیر اشخاصو ټول جینوم څخه تیریږي او د نفوس په کچه د احصایوي تحلیلونو له لارې د جینټایپ - فینوټایپ اتحادیې وړاندوینه کوي.دا په پراخه کچه د انساني ناروغیو په څیړنه کې او د حیواناتو یا نباتاتو په پیچلو ځانګړتیاو کې د فعال جین کان کیندنې په برخه کې کارول شوی.
-
د نباتاتو/حیواناتو ټول جینوم ترتیب کول
د بشپړ جینوم بیا ترتیب کول، چې د WGS په نوم هم پیژندل کیږي، په ټول جینوم کې د دواړو عام او نادر بدلونونو افشا کولو توان ورکوي پشمول د واحد نیوکلیوټایډ پولیمورفیزم (SNP)، داخلولو حذف (InDel)، د جوړښت توپیر (SV)، او د کاپي شمیره توپیر (CNV) ).SVs د SNPs په پرتله د تغیر اساس لویه برخه جوړوي او په جینوم باندې خورا اغیزه لري، کوم چې په ژوندیو موجوداتو باندې د پام وړ اغیزه لري.د اوږده لوستلو بیاکتنه د لویو ټوټو او پیچلو تغیراتو ډیر دقیق پیژندلو ته اجازه ورکوي ځکه چې اوږده لوستل په پیچلو سیمو لکه ټنډم تکرار، GC/AT- بډایه سیمې، او هایپر متغیر سیمو کې د کروموسومل کراس کول خورا اسانه کوي.
پلیټ فارم: Illumina، PacBio، نانوپور
-
ارتقايي جینیات
تکامل جینیکیک یو بسته شوی ترتیب خدمت دی چې د جینیاتي تغیراتو پراساس د ورکړل شوي موادو د تکامل معلوماتو هراړخیز تشریح چمتو کولو لپاره ډیزاین شوی ، پشمول د SNPs, InDels, SVs او CNVs.دا ټول هغه بنسټیز تحلیلونه وړاندې کوي چې د نفوسو د ارتقايي بدلونونو او د جینیاتي ځانګړتیاوو د تشریح کولو لپاره اړین دي، لکه د نفوس جوړښت، جینیاتي تنوع، فیلوجیني اړیکې، او داسې نور. دا د جین جریان په اړه مطالعات هم لري، کوم چې د اغیزمن نفوس اندازې، د توپیر وخت اټکل کوي.
-
مقایسه جینومکس
مقایسه جینومیک په لفظي معنی د مختلف ډولونو بشپړ جینوم ترتیب او جوړښت پرتله کول دي.د دې ډسپلین موخه د جینوم په کچه د نسلونو تکامل، د جین فعالیت، د جین تنظیمي میکانیزم څرګندول د ترتیب جوړښتونو او عناصرو په ګوته کولو سره چې په مختلفو ډولونو کې ساتل شوي یا توپیر لري.د جینومیک نسبتا پرتله کولو مطالعې کې د جین کورنۍ تحلیلونه شامل دي، ارتقاء پرمختګ، د بشپړ جینوم نقل کول، انتخابي فشار، او نور.
-
Hi-C پر بنسټ د جینوم مجلس
Hi-C یو میتود دی چې د کروموزوم ترتیب کولو لپاره ډیزاین شوی ترڅو د نږدې پراساس تعاملاتو او د لوړې کچې ترتیب ترتیب سره یوځای کړي.داسې انګیرل کیږي چې د دې تعاملاتو شدت په کروموزومونو کې د فزیکي واټن سره په منفي توګه تړاو لري.له همدې امله، د Hi-C ډیټا کولی شي په مسوده جینوم کې د راټول شوي ترتیبونو کلستر کولو، ترتیب کولو او سمت کولو لارښوونه وکړي او په یو ټاکلي شمیر کروموزومونو کې یې لنگر کړي.دا ټیکنالوژي د نفوس پراساس جنیټیک نقشې په نشتوالي کې د کروموزوم کچې جینوم اسمبلۍ ته ځواک ورکوي.هر یو جینوم Hi-C ته اړتیا لري.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq پلیټ فارم / DNBSEQ
-
نبات/حیوانات د نوو جینوم ترتیب کول
De Novoترتیب کول د سیکوینسینګ ټیکنالوژیو په کارولو سره د یو ډول ټول جینوم جوړولو ته راجع کیږي، د بیلګې په توګه PacBio، Nanopore، NGS، او نور، د حوالې جینوم په نشتوالي کې.د دریم نسل د ترتیب کولو ټیکنالوژیو د لوستلو اوږدوالي کې د پام وړ پرمختګ د پیچلو جینومونو په راټولولو کې نوي فرصتونه راوړي دي، لکه د لوړ هیټروزایګوسیت، د تکراري سیمو لوړ تناسب، پولیپلویډز او نور. د لسګونو کیلوبیسونو په کچه د لوستلو اوږدوالی سره، دا ترتیب لوستل فعالوي. د تکراري عناصرو حل کول، د غیر معمولي GC مینځپانګې سره سیمې او نورې خورا پیچلې سیمې.
پلیټ فارم: د PacBio سیکویل II / نانوپور پرومیتیون P48 / Illumina NovaSeq پلیټ فارم
-
د انسان ټول Exome ترتیب
د بشپړ exome ترتیب (WES) د ناروغۍ رامینځته کونکي بدلونونو پیژندلو لپاره د لګښت مؤثره ترتیب کولو ستراتیژۍ په توګه ګڼل کیږي.که څه هم exons یوازې د ټول جینوم نږدې 1.7٪ برخه اخلي، دا په مستقیم ډول د ټول پروټین د فعالیتونو پروفایل استازیتوب کوي.د انسان په جینوم کې، دا راپور شوي چې د ناروغیو پورې اړوند 85٪ څخه ډیر بدلونونه د پروټین کوډ کولو سیمه کې واقع کیږي.
BMKGENE هراړخیز او انعطاف منونکی انساني ټول Exome ترتیب خدمتونه وړاندې کوي د مختلف exon captureing ستراتیژیو سره چې د مختلف څیړنې اهدافو پوره کولو لپاره شتون لري.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq پلیټ فارم
-
د ځانګړي-لوکس پراخ شوي ټوټې ترتیب (SLAF-Seq)
د لوړې کچې جینو ټایپ کول، په ځانګړې توګه د لوی پیمانه نفوس لپاره، د جینیاتي اتحادیې مطالعاتو کې یو بنسټیز ګام دی، کوم چې د فعال جین کشف، ارتقاء تحلیل، او نور لپاره جنیټیک اساس چمتو کوي. ) د هر نمونې د ترتیب کولو لګښت کمولو لپاره معرفي شوی، پداسې حال کې چې د جینیاتي مارکر کشف کې مناسب موثریت ساتل کیږي.دا عموما د ټاکل شوي اندازې حد کې د محدودیت ټوټې استخراج له لارې ترلاسه کیږي، کوم چې د کم شوي نمایش کتابتون (RRL) نومیږي.Specific-locus amplified fragment sequencing (SLAF-Seq) د ریفرنس جینوم سره یا پرته د SNP جینټایپ کولو لپاره پخپله پرمختللې ستراتیژي ده.
پلیټ فارم: Illumina NovaSeq پلیټ فارم
