-
د جینوم پراخه اتحادیه تحلیل
د جینوم - پراخه انجمن مطالعاتو (GWAS) هدف د جینیاتي ډولونو (جینوټایپونو) پیژندل دي چې د ځانګړي ځانګړتیاو (فینوټایپونو) سره تړاو لري. په ډیری اشخاصو کې په ټول جینوم کې د جینیاتي مارکرونو په څیړلو سره، GWAS د نفوس په کچه د احصایوي تحلیلونو له لارې د جینټایپ-فینوټایپ اتحادیې پراخوي. دا میتودولوژي د انساني ناروغیو په څیړنه او په څارویو یا نباتاتو کې د پیچلو ځانګړتیاو پورې اړوند فعال جینونو سپړلو کې پراخه غوښتنلیکونه لټوي.
په BMKGENE کې، موږ په لوی نفوس کې د GWAS ترسره کولو لپاره دوه لارې وړاندیز کوو: د بشپړ جینوم ترتیب (WGS) ګمارل یا د کم نمایندګۍ جینوم ترتیب کولو میتود غوره کول ، په کور کې رامینځته شوي ځانګړي-لوکس امپلیفایډ ټوټه (SLAF). پداسې حال کې چې WGS د کوچني جینومونو سره سمون لري، SLAF د اوږد جینومونو سره د لوی نفوس مطالعې لپاره د ارزانه بدیل په توګه راڅرګندیږي، په مؤثره توګه د ترتیب لګښتونه کموي، پداسې حال کې چې د لوړ جینیکیک مارکر کشف موثریت تضمینوي.
-
د نباتاتو/حیواناتو ټول جینوم ترتیب کول
د بشپړ جینوم ترتیب (WGS)، چې د resequencing په نوم هم پیژندل کیږي، د پیژندل شوي حوالې جینومونو سره د مختلف ډولونو مختلف اشخاصو بشپړ جینوم ترتیب ته اشاره کوي. په دې اساس، د افرادو یا نفوس جینومیک توپیرونه نور هم پیژندل کیدی شي. WGS د واحد نیوکلیوټایډ پولیمورفیزم (SNP) ، د داخلولو حذف (InDel) ، د جوړښت تغیر (SV) ، او د کاپي شمیرې تغیر (CNV) پیژندنه وړوي. SVs د SNPs په پرتله د تغیر اساس لویه برخه جوړوي او په جینوم باندې خورا لوی تاثیر لري ، د پام وړ ژوندی موجودات اغیزه کوي. پداسې حال کې چې د لنډ لوستلو بیاکتنه د SNPs او InDels په پیژندلو کې اغیزمنه ده، د اوږد لوستلو بیاکتنه د لویو برخو او پیچلو تغیراتو دقیق پیژندلو ته اجازه ورکوي.
-
ارتقايي جینیات
تکامل جینیتیک یو هراړخیز ترتیب خدمت دی چې د افرادو په لوی ګروپ کې د تکامل بصیرت تشریح وړاندې کولو لپاره ډیزاین شوی ، د جینیاتي تغیراتو پراساس ، پشمول د SNPs ، InDels ، SVs ، او CNVs. دا خدمت ټول اړین تحلیلونه لري چې د نفوسو د ارتقاء بدلونونو او جینیاتي ځانګړتیاو روښانه کولو لپاره اړین دي، پشمول د نفوس جوړښت ارزونه، جینیاتي تنوع، او فیلوجینیک اړیکو. سربیره پردې، دا د جین جریان په اړه مطالعاتو ته وده ورکوي، د اغیزمن نفوس اندازې او د توپیر وخت اټکل کولو توان لري. د تکامل جینیکیک مطالعات د ډولونو د اصل او موافقت په اړه ارزښتناکه لیدونه وړاندې کوي.
په BMKGENE کې، موږ په لوی نفوس کې د تکامل جینیکیک مطالعاتو ترسره کولو لپاره دوه لارې وړاندې کوو: د بشپړ جینوم ترتیب (WGS) ګمارل یا د کم نمایش جینوم ترتیب کولو میتود غوره کول ، په کور کې پرمختللي ځانګړي-لوکس امپلیفایډ فریګمینټ (SLAF). پداسې حال کې چې WGS د کوچنیو جینومونو سره سمون لري، SLAF د اوږد جینومونو سره د لوی نفوس مطالعې لپاره د لګښت اغیزمن بدیل په توګه راڅرګندیږي، په مؤثره توګه د ترتیب لګښتونه کموي.
-
مقایسه جینومکس
مقایسه جینومیک د مختلفو ډولونو ترمنځ د ټول جینوم ترتیبونو او جوړښتونو ازموینه او پرتله کول شامل دي. دا ساحه هڅه کوي چې د ډولونو تکامل افشا کړي، د جین افعال ډیکوډ کړي، او د مختلف ژوندی موجوداتو په اوږدو کې د محافظت شوي یا متنوع ترتیب جوړښتونو او عناصرو په پیژندلو سره د جینیاتي تنظیمي میکانیزمونو روښانه کول. د جینومیک یوه پراخه مقایسه مطالعه تحلیلونه لري لکه د جین کورنۍ، تکامل پرمختګ، د بشپړ جینوم نقل پیښې، او د انتخابي فشارونو اغیزې.
-
د های-C پراساس جینوم مجلس
Hi-C یو میتود دی چې د کروموزوم ترتیب کولو لپاره ډیزاین شوی ترڅو د نږدې پراساس تعاملات او د لوړې کچې ترتیب ترتیب سره یوځای کړي. داسې انګیرل کیږي چې د دې تعاملاتو شدت په کروموزومونو کې د فزیکي واټن سره په منفي توګه تړاو لري. له همدې امله، د Hi-C ډیټا په یوه مسوده جینوم کې د راټول شوي ترتیبونو د کلستر کولو، ترتیب کولو، او اورینټ کولو لارښود کولو لپاره کارول کیږي او د یو ټاکلي شمیر کروموزومونو سره نښلوي. دا ټیکنالوژي د نفوس پراساس جنیټیک نقشې په نشتوالي کې د کروموزوم کچې جینوم اسمبلۍ ځواک ورکوي. هر یو جینوم Hi-C ته اړتیا لري.
-
نبات/حیوانات د نوو جینوم ترتیب کول
De Novoترتیب کول د ریفرنس جینوم په نشتوالي کې د ترتیب کولو ټیکنالوژیو په کارولو سره د یو ډول ټول جینوم جوړولو ته اشاره کوي. د دریم نسل ترتیب معرفي کول او په پراخه کچه منل، د اوږد لوستلو ځانګړتیا، د لوستلو تر منځ د زیاتوالي په زیاتولو سره د جینوم مجلس د پام وړ وده کړې. دا وده په ځانګړې توګه هغه وخت اړینه ده کله چې د ننګونکي جینومونو سره معامله وشي، لکه د لوړ هیټروزایګوسیت، د تکراري سیمو لوړ تناسب، پولیپلایډونه، او هغه سیمې چې تکراري عناصر لري، غیر معمولي GC منځپانګې، یا لوړ پیچلتیا چې معمولا د لنډ لوستلو ترتیب په کارولو سره په کمزوري توګه راټول شوي وي. یوازې
زموږ یو تمځای حل مدغم ترتیب خدمات او بایو انفارمیټیک تحلیل وړاندې کوي چې د لوړ کیفیت ډی نوو راټول شوي جینوم وړاندې کوي. د ایلومینا سره د جینوم لومړنۍ سروې د جینوم اندازې او پیچلتیا اټکلونه وړاندې کوي، او دا معلومات د PacBio HiFi سره د اوږد لوستلو ترتیب کولو بل ګام لارښود کولو لپاره کارول کیږي، چې تعقیب کیږي.د نوود کانتیګونو مجلس. د HiC اسمبلۍ وروستنۍ کارول جینوم ته د کانټیګونو لنگر کولو توان ورکوي ، د کروموزوم کچې مجلس ترلاسه کوي. په نهایت کې ، جینوم د جین وړاندوینې او د څرګند شوي جینونو ترتیب کولو سره تشریح شوی ، د لنډ او اوږد لوستلو سره ټرانسکریټومونو ته لاره هواروي.
-
د انسان ټول Exome ترتیب
د انسان بشپړ ایکسوم ترتیب (hWES) په پراخه کچه د ناروغۍ رامینځته کونکي بدلونونو په ګوته کولو لپاره د ارزانه او قوي ترتیب کولو طریقې په توګه پیژندل شوی. سره له دې چې یوازې د ټول جینوم شاوخوا 1.7٪ جوړوي، exons د ټول پروټین د فعالیتونو پروفایل په مستقیم ډول منعکس کولو سره مهم رول لوبوي. د پام وړ، د انسان په جینوم کې، د ناروغیو پورې اړوند د 85٪ څخه ډیر بدلونونه د پروټین کوډ کولو سیمو کې څرګندیږي. BMKGENE یو هراړخیز او انعطاف منونکی انساني ټول Exome ترتیب خدمت وړاندې کوي د دوه مختلف Exon نیول ستراتیژیو سره د مختلف څیړنې اهدافو پوره کولو لپاره شتون لري.
-
د ځانګړي-لوکس پراخ شوي ټوټې ترتیب (SLAF-Seq)
د لوړې کچې جین ټایپ کول، په ځانګړې توګه په لویه پیمانه نفوس کې، د جینیاتي اتحادیې مطالعاتو کې بنسټیز ګام دی او د فعال جین کشف، ارتقاء تحلیل، او نور لپاره د جینیاتي اساس چمتو کوي.د نمایندګۍ کم شوی جینوم ترتیب (RRGS)ډیری وختونه په دې مطالعاتو کې ګمارل کیږي ترڅو د هر نمونې د ترتیب لګښت کم کړي پداسې حال کې چې د جینیاتي مارکر کشف کې مناسب موثریت ساتل کیږي. RRGS دا د محدودیت انزایمونو سره د DNA هضمولو او د ځانګړي ټوټې اندازې اندازې تمرکز کولو سره ترلاسه کوي ، پدې توګه د جینوم یوازې یوه برخه ترتیبوي. د مختلفو RRGS میتودونو په منځ کې، د ځانګړي-لوکس امپلیفایډ فریګمینټ ترتیب (SLAF) د دودیز او لوړ کیفیت طریقه ده. دا طریقه، چې د BMKGene لخوا په خپلواکه توګه رامینځته شوې، د هرې پروژې لپاره د محدودیت انزایم ټاکلو ته وده ورکوي. دا د پام وړ شمیر SLAF ټاګونو تولید یقیني کوي (د جینوم 400-500 bps سیمې په ترتیب سره) چې په جینوم کې په مساوي ډول توزیع شوي پداسې حال کې چې په مؤثره توګه د تکراري سیمو څخه مخنیوی کوي ، پدې توګه د غوره جینیتیک مارکر کشف یقیني کوي.
