د تودوخې نقشه
د هیټ میپ وسیله د میټریکس ډیټا فایل د ان پټ په توګه مني او کاروونکو ته اجازه ورکوي چې ډیټا فلټر، نورمال او کلستر کړي. د هیټ میپ لپاره د کارولو لومړنی قضیه د مختلفو نمونو ترمنځ د جین د څرګندولو کچې کلستر تحلیل دی.
د جین تشریح
د جین تشریح وسیله د مختلفو ډیټابیسونو په وړاندې د FASTA فایلونو د ان پټ ترتیب پر بنسټ د جین تشریح ترسره کوي.
د سیمه ییز سمون د لټون اساسي وسیله (BLAST)
د BLAST وسیله د NCBI BLAST یوه BMKCloud مدغم نسخه ده او د BMKCloud حساب ته د اپلوډ شوي معلوماتو په کارولو سره د ورته دندو ترسره کولو لپاره کارول کیدی شي.
د CDS_UTR وړاندوینه
د CDS_UTR وړاندوینې وسیله د پیژندل شوي پروټین ډیټابیسونو او ORF وړاندوینې پایلو په وړاندې د BLAST پایلو پراساس په ورکړل شوي ټرانسکرپټ ترتیبونو کې د کوډ کولو سیمو (CDS) او غیر کوډ کولو سیمو (UTR) وړاندوینې لپاره ډیزاین شوې.
د مانهاټن پلاټ
د مین هټن پلاټ وسیله د لوړ نمونو تجربو ښودلو ته اجازه ورکوي او معمولا د جینوم پراخه اتحادیې مطالعاتو (GWAS) کې کارول کیږي.
د سرکوس ډیاګرام
د CIRCOS ډیاګرام وسیله د جینومیک ځانګړتیاوو د ویشلو څرنګوالي اغیزمن لید وړاندې کوي. عام ځانګړتیاوې عبارت دي له کمیتي ځای، SNPs، InDels، ساختماني او د کاپي شمیرې ډولونه.
د جین اونټولوژي (GO) غني کول
د GO غني کولو وسیله د فعال غني کولو تحلیل چمتو کوي. پدې وسیله کې لومړنی سافټویر د TopGO-Bioconductor کڅوړه ده، چې پکې د توپیري څرګندونې تحلیل، د GO غني کولو تحلیل او د پایلو لید شامل دي.
د وزن لرونکي جین شریک اظهار شبکې تحلیل (WGCNA)
WGCNA د جین شریک اظهار ماډلونو کشفولو لپاره د معلوماتو کان کیندنې یوه پراخه کارول شوې طریقه ده. دا د مایکرو اری او NGS جین اظهار ډیټا په شمول د مختلف اظهار ډیټاسیټ لپاره پلي کیږي.
انټرپرو سکین
د انټرپرو سکین وسیله د انټرپرو پروټین ترتیب تحلیل او طبقه بندي چمتو کوي.
د GO KEGG غني کول
د GO KEGG غني کولو وسیله د GO غني کولو هسټوګرام، KEGG غني کولو هسټوګرام او KEGG غني کولو لاره د چمتو شوي جین سیټ او اړونده تشریح پراساس رامینځته کولو لپاره ډیزاین شوې ده.
