د یوکاریوټیک mRNA تحلیل (د حوالې پر بنسټ او د نوي کولو اختیارونه شتون لري)
دا پایپ لاین د NGS RNA-Seq ډیټا د ان پټ په توګه کاروي او د ډیری ښکته تحلیلونو څخه پایلې تولیدوي، پشمول د: ترتیب کولو ډیټا کیفیت ارزونه،نوید نقل کولو سایټ تشریح، د متغیر جلا کولو تحلیل، د توپیر بیان تحلیل، د فعالیت تشریح او بډایه کولو تحلیل.
د RNA اوږد غیر کوډنګ تحلیل
اوږد غیر کوډ شوي RNAs (lncRNA) غیر کوډ شوي ټرانسکرپټونه دي چې اوږدوالی یې له 200 nt څخه ډیر دی او د کروماتین تنظیم او تنظیم کې رول لوبولو لپاره پیژندل کیږي. د لوړ تروپټ ترتیب کولو ټیکنالوژیو او بایو انفارمیټیک زموږ د lncRNA ترتیبونو او موقعیت معلوماتو پوهیدو ته ځواک ورکړی ترڅو د مهمو تنظیمي دندو سره lncRNAs وپیژنو. دا پایپ لاین د یوکاریوټیک mRNA تحلیل پایپ لاین کې ذکر شوي تحلیلونو سربیره د lncRNA تحلیل چمتو کوي.
۱۶S/۱۸S/ITS امپلیکون ترتیب
د امپلیکون سیکوینسیسنګ مایکروبیل تنوع تحلیل پایپ لاین د مایکروبیل تنوع پروژې تحلیل کې د کلونو تجربې پراساس رامینځته شوی. پایپ لاین معیاري اساسي تحلیل لري، کوم چې د اوسني مایکروبیل څیړنې او شخصي تحلیل اصلي تحلیل مینځپانګه پوښي. د تحلیل راپور بډایه او جامع دی، د متنوع شخصي تحلیل ترسره کولو اختیار سره. سربیره پردې، نمونې او ډلې د اضافي دودیز کولو او کنټرول لپاره په الوتنه کې تعدیل کیدی شي.
د شاټګن میټاجینومکس تحلیل
د شاټګن میټاجینومیک تحلیل پایپ لاین د چاپیریالي نمونو څخه استخراج شوي مخلوط جینومیک موادو څخه د NGS ډیټا کاروي. شامل شوي تحلیلونه د ډولونو تنوع او کثرت، د نفوس جوړښت، فایلوجینیک اړیکو، فعال جینونو، او د چاپیریالي عواملو سره د اړیکو شبکو په اړه مفصل معلومات چمتو کوي.
د NGS-WGS ډول تحلیل
د NGS-WGS د متغیر تحلیل یو مدغم متغیر کشف پایپ لاین دی چې د معلوماتو کیفیت کنټرول، د ترتیب سمون، تشریح، او د جین بدلون تحلیل ترسره کوي. پایپ لاین د SNP او InDel کشف لپاره د GATK غوره طریقې تعقیبوي او د ساختماني متغیر زنګ وهلو لپاره مانټا کاروي.
د جینوم پراخه ټولنې مطالعه (GWAS)
د GWAS پایپ لاین یو ښکته تحلیل دی چې د افرادو د یوې ډلې لپاره دمخه تولید شوي VCF فایلونه او اړونده فینوټایپ معلومات د معلوماتو په توګه اخلي. د ځانګړو احصایوي میتودونو په کارولو سره، GWAS موخه لري چې د جینوم پراخه نیوکلیوټایډ توپیرونه کشف کړي چې د فینوټایپیک توپیرونو سره تړاو لري. دا په نباتاتو او څارویو کې د پیچلو انساني ناروغیو او پیچلو ځانګړتیاو سره تړلي فعال جینونو سپړلو کې مهم رول لوبوي.
د ګڼې ګوڼې جلا کولو تحلیل (BSA)
د BSA تحلیل د هغو اشخاصو راټولول شامل دي چې د جلا شوي نفوس څخه خورا فینوټایپیک ځانګړتیاوې لري. د راټول شوي نمونو ترمنځ د توپیر ځای پرتله کولو سره، دا طریقه په چټکۍ سره د هدف جینونو سره تړلي نږدې تړلي مالیکولي مارکرونه پیژني. د نباتاتو او څارویو په جینیاتي نقشه کې په پراخه کچه کارول کیږي، دا د مارکر په مرسته نسل ورکولو لپاره یو ارزښتناک وسیله ده.
د ارتقايي جینیات تحلیل
د ارتقايي جینیات تحلیل کاري جریان د جینیاتي ارتقايي پروژو کې د BMKGENE پراخه تجربه کاروي او پکې د فایلوجینیټیک ونو جوړول، د اړیکې عدم توازن تحلیل، د جینیاتي تنوع ارزونه، انتخابي سویپ پیژندنه، د خپلوۍ تحلیل، د اصلي اجزاو تحلیل، او د نفوس جوړښت ځانګړتیا شامله ده.
