●Pokročilá bioinformatická analýza a komplexná anotácia:Používame viacero databáz na funkčnú anotáciu génov spojených s oblasťami väzby proteín-DNA, čo poskytuje pohľad na bunkové a molekulárne procesy, ktoré sú základom interakcie.
●Podpora po predaji:Náš záväzok presahuje rámec dokončenia projektu s 3-mesačným obdobím popredajného servisu. Počas tohto obdobia ponúkame sledovanie projektu, pomoc pri riešení problémov a stretnutia otázok a odpovedí na riešenie akýchkoľvek otázok súvisiacich s výsledkami.
●Rozsiahle skúsenosti:Vďaka úspešnosti dokončenia mnohých projektov ChIP-Seq naša spoločnosť prináša viac ako desaťročné skúsenosti. Náš vysoko kvalifikovaný analytický tím spolu s komplexným obsahom a podporou po predaji zaisťuje úspech vašich projektov.
● Prísna kontrola kvality: Implementujeme základné kontrolné body vo všetkých fázach, od prípravy vzorky a knižnice až po sekvenovanie a bioinformatiku. Toto starostlivé monitorovanie zaisťuje neustále vysokokvalitné výsledky.
Knižnica | Stratégia sekvenovania | Odporúčaný výstup údajov | Kontrola kvality |
Purifikovaná DNA po imunoprecipitácii | Illumina PE150 | 10 Gb | Q30 ≥ 85 % Konverzia bisulfitu > 99 % Účinnosť rezania MspI > 95 % |
Celkové množstvo: ≥10 ng
Distribúcia veľkosti fragmentov: 100-750 bps
Zahŕňa nasledujúcu analýzu:
● Kontrola kvality nespracovaných údajov
● Špičkové volanie založené na mapovaní na referenčný genóm
● Anotácia génov spojených s vrcholom
● Analýza motívu: identifikácia väzbových miest pre transkripčný faktor (TFBS)
● Diferenciálna analýza píku a anotácia
Hodnotenie obohatenia v blízkosti miest začiatku transkripcie (TSS)
Celogenómová distribúcia CHIP píkov
Klasifikácia oblastí píkov
Funkčné obohatenie génov súvisiacich s vrcholom (KEGG)