CircRNA

Kruhové RNA (circRNA) sú nekódujúce RNA, ktoré tvoria kruhové štruktúry a majú viacero regulačných úloh, vrátane súťaží s miRNA o cieľové gény a proteínovú väzbu. BMKCloud circRNA pipeline je navrhnutý na analýzu rRNA vyčerpaných knižníc s dobre anotovaným a vysoko kvalitným referenčným genómom. Analýza začína orezaním a kontrolou kvality, po ktorej nasleduje zarovnanie čítania s referenčným genómom a predikcia nových circRNA, spojená s identifikáciou známych circRNA z databáz. Následne sú identifikované zodpovedajúce miRNA ciele a circRNA hostitelia. Analýza diferenciálnej expresie odhaľuje rozdielne exprimované circRNA a zodpovedajúci hostitelia sú funkčne anotovaní, aby extrahovali obohatené biologické funkcie.