Malá RNA

Malé RNA sú krátke nekódujúce RNA s priemernou dĺžkou 18 – 30 nt, vrátane miRNA, siRNA a piRNA, ktoré hrajú dôležitú úlohu v regulačných procesoch. BMKCloud sRNA pipeline poskytuje štandardnú aj zákazkovú analýzu na identifikáciu miRNA. Po orezaní čítaní a kontrole kvality sú čítania porovnané s viacerými databázami, aby sa klasifikovali sRNA a vybrali miRNA a mapovali sa na referenčný genóm. miRNA sú identifikované na základe známych databáz miRNA, čo poskytuje informácie o sekundárnej štruktúre, rodine miRNA a cieľových génoch. Analýza diferenciálnej expresie identifikuje diferencovane exprimované miRNA a zodpovedajúce cieľové gény sú funkčne anotované, aby sa našli obohatené kategórie.