-
Jednojadrové sekvenovanie RNA
Pokrok v zachytávaní jednotlivých buniek a technike konštrukcie jednotlivých knižníc v kombinácii s vysokovýkonným sekvenovaním umožňuje štúdie génovej expresie na báze bunky po bunke.Umožňuje hlbšiu a kompletnú systémovú analýzu komplexných bunkových populácií, v ktorej sa do značnej miery vyhýba maskovaniu ich heterogenity priemerovaním všetkých buniek.
Niektoré bunky však nie sú vhodné na výrobu jednobunkovej suspenzie, preto sú potrebné iné metódy prípravy vzoriek – extrakcia jadra z tkanív, to znamená, že jadro sa priamo extrahuje z tkanív alebo bunky a pripraví sa na suspenziu s jedným jadrom pre jednobunkové sekvenovanie buniek.
BMK poskytuje službu sekvenovania jednobunkovej RNA na báze 10× Genomics ChromiumTM.Táto služba bola široko používaná v štúdiách štúdií súvisiacich s chorobami, ako je diferenciácia imunitných buniek, heterogenita nádorov, vývoj tkaniva atď.
Priestorový transkriptómový čip: 10× Genomics
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
-
Priestorový prepis BMKMANU S1000
Priestorová transkriptomika stojí v popredí vedeckých inovácií a umožňuje výskumníkom ponoriť sa do zložitých vzorcov génovej expresie v tkanivách pri zachovaní ich priestorového kontextu.Uprostred rôznych platforiem spoločnosť BMKGene vyvinula čip BMKManu S1000 Spatial Transscriptome Chip, ktorý sa môže pochváliťvylepšené rozlíšenie5 uM, dosahujúci subcelulárny rozsah a umožňujúciviacúrovňové nastavenia rozlíšenia.Čip S1000 s približne 2 miliónmi škvŕn využíva mikrojamky navrstvené guľôčkami naplnenými priestorovými zachytávacími sondami s čiarovým kódom.Z čipu S1000 je pripravená knižnica cDNA obohatená o priestorové čiarové kódy a následne sekvenovaná na platforme Illumina NovaSeq.Kombinácia priestorovo kódovaných vzoriek a UMI zaisťuje presnosť a špecifickosť generovaných údajov.Jedinečná vlastnosť čipu BMKManu S1000 spočíva v jeho všestrannosti, ktorá ponúka viacúrovňové nastavenia rozlíšenia, ktoré možno jemne vyladiť pre rôzne tkanivá a úrovne detailov.Táto prispôsobivosť predstavuje čip ako vynikajúcu voľbu pre rôzne štúdie priestorovej transkriptomiky, čím sa zabezpečuje presné priestorové zoskupovanie s minimálnym šumom.
Pomocou čipu BMKManu S1000 a ďalších technológií priestorovej transkriptomiky môžu výskumníci lepšie porozumieť priestorovej organizácii buniek a zložitým molekulárnym interakciám, ktoré sa vyskytujú v tkanivách, a poskytnúť neoceniteľný pohľad na mechanizmy, ktoré sú základom biologických procesov v širokom spektre oblastí vrátane onkológia, neuroveda, vývojová biológia, imunológia a botanické štúdie.
Platforma: čip BMKManu S1000 a Illumina NovaSeq
-
10x priestorový transkriptóm Genomics Visium
Priestorová transkriptomika je špičková technológia, ktorá umožňuje výskumníkom skúmať vzory génovej expresie v tkanivách pri zachovaní ich priestorového kontextu.Jedna výkonná platforma v tejto doméne je 10x Genomics Visium spojená so sekvenovaním Illumina.Princíp 10X Visium spočíva na špecializovanom čipe s určenou záchytnou oblasťou, kde sa umiestňujú tkanivové rezy.Táto oblasť zachytávania obsahuje body s čiarovým kódom, z ktorých každý zodpovedá jedinečnému priestorovému umiestneniu v tkanive.Zachytené molekuly RNA z tkaniva sú potom počas procesu reverznej transkripcie označené jedinečnými molekulárnymi identifikátormi (UMI).Tieto čiarové kódy a UMI umožňujú presné priestorové mapovanie a kvantifikáciu génovej expresie v jednobunkovom rozlíšení.Kombinácia priestorovo kódovaných vzoriek a UMI zaisťuje presnosť a špecifickosť generovaných údajov.Pomocou tejto technológie priestorovej transkriptomiky môžu výskumníci získať hlbšie pochopenie priestorovej organizácie buniek a zložitých molekulárnych interakcií vyskytujúcich sa v tkanivách, čo ponúka neoceniteľný pohľad na mechanizmy, ktoré sú základom biologických procesov vo viacerých oblastiach, vrátane onkológie, neurovedy, vývojovej biológie, imunológie. a botanické štúdie.
Platforma: 10X Genomics Visium a Illumina NovaSeq
