Väikesed RNA-d on tüüpi lühikesed mittekodeerivad RNA-d, mille keskmine pikkus on 18–30 nt, sealhulgas miRNA, siRNA ja piRNA.On teatatud, et need väikesed RNA-d osalevad massiliselt erinevates bioloogilistes protsessides, nagu mRNA lagunemine, translatsiooni pärssimine, heterokromatiini moodustumine jne. Väikese RNA sekveneerimisanalüüsi on laialdaselt kasutatud loomade/taimede arengu, haiguste, viiruste jne uuringutes. Väike RNA sekveneerimisanalüüsi platvorm koosneb standardanalüüsist ja täiustatud andmete kaevandamisest.RNA-seq andmete põhjal võib standardanalüüsiga saavutada miRNA identifitseerimise ja ennustamise, miRNA sihtgeeni ennustamise, annotatsiooni ja ekspressioonianalüüsi.Täiustatud analüüs võimaldab kohandatud miRNA otsimist ja ekstraheerimist, Venni diagrammi genereerimist, miRNA ja sihtgeenivõrgu ülesehitamist.
