Male RNA su tip kratke nekodirajuće RNA s prosječnom duljinom od 18-30 nt, uključujući miRNA, siRNA i piRNA.Za ove male RNA se masovno izvještava da su uključene u razne biološke procese kao što su degradacija mRNA, inhibicija translacije, formiranje heterokromatina, itd. Mala RNA analiza sekvenciranja naširoko se primjenjuje u studijama o razvoju životinja/biljki, bolesti, virusa itd. Mala RNA platforma za analizu sekvenciranja sastoji se od standardne analize i naprednog rudarenja podataka.Na temelju RNA-seq podataka, standardna analiza može postići identifikaciju i predviđanje miRNA, predviđanje ciljnog gena miRNA, analizu anotacija i ekspresije.Napredna analiza omogućuje prilagođeno pretraživanje i ekstrakciju miRNA, generiranje Vennovog dijagrama, izgradnju miRNA i mreže ciljnih gena.
