ՄԻԿՐՈԲԱԿԱՆ
Բակտերիաների համատեղելիությունը և անշարժացումը բիոքարով բարելավում են տեբուկոնազոլի քայքայումը, հողի միկրոբիոմի կազմը և գործառույթը
Ամբողջական 16S ամպլիկոնի հաջորդականություն |PacBio HiFi |Ալֆա բազմազանություն |Բետա բազմազանություն
Այս ուսումնասիրության մեջ PacBio-ի կողմից 16S ամպլիկոնի ամբողջական հաջորդականությունը և բիոինֆորմատիկական վերլուծությունը տրամադրվել են Biomarker Technologies-ի կողմից:
Առանձնահատկություններ
Biochar անշարժացված տեբուկոնազոլը քայքայող բակտերիաները Alcaligenes faecalis WZ-2 ուսումնասիրվել են կենսաքայքայման արդյունավետության և ազդեցության վերաբերյալ տեբուկոնազոլով աղտոտված հողի վրա՝ համեմատած ազատ քայքայող շտամի WZ-2-ի հետ:
1. Բիոխարով անշարժացված WZ-2-ը ցույց է տվել տեբուկոնազոլի ավելի արդյունավետ դեգրադացիան՝ համեմատած ազատ WZ-2-ի հետ՝ նվազեցնելով տեբուկոնազոլի կիսամյակը հողում 18,7 օրից մինչև 13,3 օր:
2. Biochar-անշարժացված WZ-2-ը կարողացավ վերականգնել հողի բնածին մանրէաբանական ֆերմենտների ակտիվությունը, ներառյալ ուրեազը, դեհիդրոգենազը և ինվերտազը և այլն:
3. Մանրէաբանական պրոֆիլը բիոքարով անշարժացված WZ-2 մշակված հողում, որը որոշվել է ամբողջ երկարությամբ 16S հաջորդականությամբ, հաստատում է, որ այս համակարգը կարող է վերականգնել հողի առողջությունը՝ բարելավելով բակտերիալ համայնքի կառուցվածքը տեբուկոնազոլով աղտոտվածության պայմաններում:
Փորձ (կապված հաջորդականության հետ)
Խմբավորում. CK. Բնական հող;T. տեբուկոնազոլով պատված հող;S. Tebuconazole պարունակող հող ազատ շտամ WZ-2;մ.թ.ա. տեբուկոնազոլը պարունակում էր բիոքարով հող;BCS. Տեբուկոնազոլը պարունակում էր հող՝ անշարժացված բիոքարով WZ-2-ով:
Նմուշառում. հողի ԴՆԹ-ի ընդհանուր արդյունահանումը ուժեղացված է 16S rDNA պրայմերներով
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) և 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),վերաբերվում է ամբողջ երկարությամբ 16S rDNA
Հերթականության հարթակ՝ PacBio RS II
Հերթականության ռազմավարություն. CCS HIFI կարդում է
Տվյալների վերլուծություն:BMKCloudBioinformatic Platforming-ը ոսկե ձկնիկը դարձնում է հիանալի գենետիկ մոդելի համակարգ ձկների ֆիզիոլոգիայի և էվոլյուցիայի համար:
Արդյունք
Հողի մանրէաբանական համայնքի կառուցվածքը որոշվել է 16S rDNA հաջորդականությամբ:OTU հարստությունը և ալֆա բազմազանության ինդեքսը, ներառյալ Chao1, Ace, Shannon և Simpson ինդեքսները գնահատվել են յուրաքանչյուր համակարգում տեսակների բազմազանությունը բացահայտելու համար:60 օր ինկուբացիայից հետո բոլոր ցուցանիշները ցույց են տվել նմանատիպ միտում, այսինքն՝ տեբուկոնազոլը կարող է հանգեցնել հողի տեսակների հարստության և բազմազանության կրճատմանը:Այնուամենայնիվ, ավելացնելով WZ-2 շտամը, հողի բակտերիաների համայնքը մասամբ վերականգնվեց և՛ հարստության, և՛ բազմազանության առումով:Սահմանափակ տարբերություն է նկատվել BC-ի, BCS-ի և CK-ի միջև, ինչը ցույց է տալիս, որ բիոքարը և բիոքարով անշարժացված WZ-2-ը կարող են արդյունավետ կերպով վերականգնել հողի կենսաբանական առողջությունը:
Այս հետազոտության մեջ կիրառվել է չկշռված զույգ-խմբային մեթոդ՝ թվաբանական միջիններով (UPGMA)՝ խմբերի միջև բետա բազմազանությունը ցույց տալու համար:Ինչպես ցույց է տրված ստորև բերված նկարում, BC-ն, BSC-ն և CK-ը կիսում էին մանրէաբանական բաղադրության ավելի շատ օրինաչափություն՝ համեմատած T և S խմբի հետ, ինչը հետագայում ցույց տվեց, որ բիոկարի ներմուծումը տեբուկոնազոլով աղտոտված հողի կենսավերականգնման մեջ կարող է մեծապես նպաստել հողում մանրէաբանական համայնքի վերականգնմանը:
Նկար.UPGMA-ի բակտերիալ համայնքի խմբավորումը ցեղային մակարդակում տարբեր բուժման ներքո
Հղում
Sun, Tong, et al.«Բակտերիաների համատեղելիությունը և անշարժացումը բիոքարի հետ բարելավեցին տեբուկոնազոլի քայքայումը, հողի միկրոբիոմի կազմը և գործառույթը»:Վտանգավոր նյութերի ամսագիր398 (2020)՝ 122941։
Նորություններ և կարևոր իրադարձություններ նպատակն է կիսել վերջին հաջողված դեպքերը Biomarker Technologies-ի հետ՝ ֆիքսելով նոր գիտական ձեռքբերումները, ինչպես նաև ուսումնասիրության ընթացքում կիրառվող նշանավոր տեխնիկան:
Հրապարակման ժամանակը՝ Հունվար-08-2022