BMKCloud Log in
条形 banner-03

Ապրանքներ

Պրոկարիոտիկ ՌՆԹ-ի հաջորդականություն

Պրոկարիոտիկ ՌՆԹ-ի հաջորդականությունը օգտագործում է հաջորդ սերնդի հաջորդականությունը (NGS)՝ բացահայտելու ՌՆԹ-ի առկայությունը և քանակը տվյալ պահին՝ վերլուծելով փոփոխվող բջջային տրանսկրիպտոմը:Մեր ընկերության պրոկարիոտային ՌՆԹ-ի հաջորդականությունը, մասնավորապես, ուղղված է տեղեկատու գենոմներով պրոկարիոտներին՝ տրամադրելով ձեզ տրանսկրիպտոմի պրոֆիլավորում, գենային կառուցվածքի վերլուծություն և այլն: Այն լայնորեն կիրառվել է հիմնական գիտական ​​հետազոտությունների, դեղերի հետազոտության և մշակման և այլնի համար:

Պլատֆորմ՝ Illumina NovaSeq հարթակ


Ծառայության մանրամասները

Ծառայության բնութագրերը

Պլատֆորմ՝ Illumina NovaSeq հարթակ, PE150

Գրադարանի տեսակը՝ 350bp ներդիր cDNA գրադարան (կախված է առավելագույն բաշխումից)

Հերթականացման ռազմավարություն՝ Զուգակցված-End 150 bp

Առաջարկվող տվյալների քանակը՝ 2 Գբ հում տվյալներ/նմուշ

Կենսաինֆորմատիկա

(1) Տվյալների հաջորդականության որակի վերահսկում. նուկլեոտիդների բաշխում, բազային որակի բաշխում, rRNA հարաբերակցության գնահատում;

(2) Հերթականության հավասարեցման վերլուծություն. Հավասարեցման արդյունքների վիճակագրություն, հաջորդականության հագեցվածություն, հաջորդականության ծածկույթ;

(3) Հղման գենոմի անոտացիա (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) Արտահայտման վերլուծություն. արտահայտման բաշխում (երկու կամ ավելի նմուշներով), նմուշների միջև արտահայտության վերլուծություն (Վենի անալիզ, հարաբերակցական վերլուծություն, PCA վերլուծություն);

(5) Դիֆերենցիալ արտահայտությունների վերլուծություն (երկու կամ ավելի նմուշներով).

(6) Գենային հավաքածուի վերլուծություն. Վենի վերլուծություն, Կլաստերային վերլուծություն, Ֆունկցիոնալ անոտացիայի վերլուծություն (COG, GO, KEGG), Ֆունկցիայի հարստացման վերլուծություն (GO, KEGG), Ֆունկցիայի հարստացման ակորդային գրաֆիկ, Ipath վերլուծություն;

(7) sRNA վերլուծություն. sRNA կանխատեսում, sRNA անոտացիա (Blast, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), sRNA երկրորդական կառուցվածքի կանխատեսում, sRNA թիրախ գենի կանխատեսում;

(8) Տառագրի կառուցվածքի վերլուծություն. օպերոնի վերլուծություն, Տառադարձման սկզբի և ավարտի վայրերի կանխատեսում, UTR ծանոթագրություն և վերլուծություն, խթանողի հաջորդականության կանխատեսում, SNP/InDel վերլուծություն (SNP/InDel անոտացիա, SNP/InDel տարածաշրջանային բաշխում, SNP վիճակագրություն):

Ծառայությունների աշխատանքային հոսք

նմուշի առաքում

Նմուշի առաքում

Գրադարանի պատրաստում

Գրադարանի կառուցում

Հերթականություն

Հերթականություն

Տվյալների վերլուծություն

Տվյալների վերլուծություն

Հետո վաճառքի ծառայություններ

Վաճառքից հետո ծառայություններ


  • Նախորդը:
  • Հաջորդը:

  • ստանալ մեջբերում

    Գրեք ձեր հաղորդագրությունը այստեղ և ուղարկեք այն մեզ

    Ուղարկեք ձեր հաղորդագրությունը մեզ.