MICROBIAL
Ang bacterial compatibility at immobilization na may biochar ay nagpabuti ng pagkasira ng tebuconazole, komposisyon at paggana ng microbiome ng lupa
Full-length 16S amplicon sequencing |PacBio HiFi |Pagkakaiba-iba ng Alpha |Beta pagkakaiba-iba
Sa pag-aaral na ito, ang full-length na 16S amplicon sequencing ng PacBio at bioinformatic analysis ay ibinigay ng Biomarker Technologies.
Mga highlight
Ang biochar immobilized tebuconazole-degrading bacteria Alcaligenes faecalis WZ-2 ay pinag-aralan sa biodegradation efficiency at nakakaapekto sa tebuconazole na kontaminadong lupa kumpara sa libreng degrading strain WZ-2.
1. Ang biochar-immobilized na WZ-2 ay nagpakita ng mas mahusay na pagkasira sa tebuconazole kumpara sa libreng WZ-2 sa pamamagitan ng pagbabawas ng kalahating buhay ng tebuconazole sa lupa mula 18.7 araw hanggang 13.3 araw.
2. Nagawa ng biochar-immobilized na WZ-2 na ibalik ang mga aktibidad ng microbial enzyme ng katutubong lupa, kabilang ang urease, dehydrogenase at invertase, atbp.
3. Ang microbial profile sa biochar-immobilized WZ-2 treated soil na tinutukoy ng full-length 16S sequencing ay lubos na sinusuportahan na ang system na ito ay maaaring magpanumbalik ng kalusugan ng lupa sa pamamagitan ng pagpapabuti ng bacterial community structure sa ilalim ng tebuconazole contamination.
Karanasan (Kaugnay ng sequencing)
Pagpapangkat: CK: Likas na lupa;T: Lupa na may spiked na may tebuconazole;S: Ang Tebuconazole ay naglalaman ng lupa na may libreng strain WZ-2;BC: Ang Tebuconazole ay naglalaman ng lupa na may biochar;BCS: Ang Tebuconazole ay naglalaman ng lupa na may biochar immobilized WZ-2.
Pagsa-sample: Kabuuang pagkuha ng DNA ng lupa na pinalakas ng mga primer na 16S rDNA
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) at 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),repesenting full-length 16S rDNA
Sequencing platform: PacBio RS II
Diskarte sa sequencing: CCS HIFI reads
Pagsusuri sa datos:BMKCloudGinagawa ng Bioinformatic Platforming ang goldpis na isang mahusay na genetic model system para sa pisyolohiya at ebolusyon ng isda.
Resulta
Ang istraktura ng komunidad ng microbial ng lupa ay tinutukoy ng pagkakasunud-sunod ng 16S rDNA.Ang OTU richness at alpha diversity index, kasama ang Chao1, Ace, Shannon at Simpson index ay nasuri upang ipakita ang pagkakaiba-iba ng species sa bawat system.Pagkatapos ng 60 araw na pagpapapisa ng itlog, lahat ng mga indeks ay nagpakita ng magkatulad na kalakaran, ibig sabihin, ang tebuconazole ay maaaring magdulot ng pagbawas sa kayamanan ng mga species at pagkakaiba-iba sa lupa.Gayunpaman, sa pamamagitan ng pagdaragdag ng strain WZ-2, ang komunidad ng bakterya ng lupa ay bahagyang nabawi sa mga tuntunin ng parehong kayamanan at pagkakaiba-iba.Ang limitadong pagkakaiba ay naobserbahan sa BC, BCS at CK, na nagpapahiwatig na ang biochar at biochar-immobilized na WZ-2 ay maaaring epektibong maibalik ang biological na kalusugan ng lupa.
Ang Unweighted Pair-group Method na may Arithmetic Means (UPGMA) ay inilapat sa pag-aaral na ito upang ipakita ang pagkakaiba-iba ng beta sa mga grupo.Tulad ng ipinakita sa sumusunod na figure, ang BC, BSC at CK ay nagbahagi ng mas magkatulad na pattern ng komposisyon ng microbial kumpara sa pangkat T at S, na higit pang nagpahiwatig na ang pagpapakilala ng biochar sa tebuconazole-contaminated na bioremediation ng lupa ay maaaring higit na mapadali ang pagbawi ng microbial community sa lupa.
Pigura.UPGMA clustering ng bacterial community sa phylum level sa ilalim ng iba't ibang paggamot
Sanggunian
Sun, Tong, et al."Ang pagiging tugma ng bakterya at immobilization na may biochar ay nagpabuti ng pagkasira ng tebuconazole, komposisyon at paggana ng microbiome ng lupa."Journal ng Mapanganib na Materyal398 (2020): 122941.
Mga Balita at Highlight naglalayong ibahagi ang pinakabagong matagumpay na mga kaso sa Biomarker Technologies, pagkuha ng mga nobelang siyentipikong tagumpay pati na rin ang mga kilalang pamamaraan na inilapat sa panahon ng pag-aaral.
Oras ng post: Ene-08-2022