Երկար ոչ կոդավորող հաջորդականացում - Illumina
Ծառայության առավելությունները
●mRNA-ի և lncRNA-ի համատեղ վերլուծությունmRNA տրանսկրիպտների քանակական որոշումը լնկՌՆԹ-ի և դրանց թիրախների ուսումնասիրության հետ համատեղելով՝ հնարավոր է ստանալ բջջային պատասխանի հիմքում ընկած կարգավորիչ մեխանիզմի խորը պատկերացում։
●Լայնածավալ փորձագիտությունՄենք մշակել ենք ավելի քան 230,000 նմուշ, որոնք ընդգրկում են բազմազան նմուշներ և նախագծերի նպատակներ։ Մենք յուրաքանչյուր նախագծի մեջ ներդնում ենք մեր փորձագիտական հարստությունը։
●mRNA-ի և lncRNA-ի համատեղ վերլուծությունՄենք համատեղում ենք mRNA տրանսկրիպտների քանակական որոշումը լնկՌՆԹ-ի և դրանց թիրախների ուսումնասիրության հետ, ինչը հնարավորություն է տալիս ստանալ բջջային պատասխանի հիմքում ընկած կարգավորիչ մեխանիզմի խորը պատկերացում։
●Խիստ որակի վերահսկողությունՄենք ներդնում ենք հիմնական վերահսկման կետեր բոլոր փուլերում՝ նմուշների պատրաստումից մինչև գրադարանի պատրաստում, հաջորդականացում և կենսաինֆորմատիկա: Մեր մանրակրկիտ մոնիթորինգը ապահովում է մշտապես բարձրորակ արդյունքների ստացում:
●Համապարփակ ծանոթագրությունՄենք օգտագործում ենք բազմաթիվ տվյալների բազաներ՝ տարբերակված արտահայտված գեները (ԴԷԳ) ֆունկցիոնալ մեկնաբանելու և համապատասխան հարստացման վերլուծություններ կատարելու համար: Այս համապարփակ մոտեցումը հնարավորություն է տալիս պատկերացում կազմել տրանսկրիպտոմային արձագանքի հիմքում ընկած բջջային և մոլեկուլային գործընթացների մասին՝ ապահովելով, որ դուք ստանաք ձեր փորձի տվյալների վերաբերյալ հնարավոր ողջ տեղեկատվությունը:
●Հետվաճառքային աջակցությունՄենք հասկանում ենք, թե որքան կարևոր է ներկա լինելը, այդ իսկ պատճառով մեր պարտավորությունը տարածվում է նախագծի ավարտից հետո՝ 3 ամսվա վաճառքից հետո սպասարկման ժամանակահատվածով։ Այս ընթացքում մենք առաջարկում ենք նախագծի հետևողականություն, խնդիրների լուծման օգնություն և հարց ու պատասխանի հանդիպումներ՝ արդյունքների հետ կապված ցանկացած հարցի պատասխանելու համար։
Նմուշի պահանջներ և առաքում
| Գրադարան | Հարթակ | Առաջարկվող տվյալներ | Տվյալների որակի ստուգում |
| rRNA-ի սպառված ուղղորդված գրադարան | Իլյումինա PE150 | 10-16 Գբ | Q30≥85% |
Նուկլեոտիդներ՝
| Կոնցենտրացիա (նգ/մկլ) | Քանակը (մկգ) | Մաքրություն | Անկեղծություն |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Գելի վրա սպիտակուցային կամ ԴՆԹ աղտոտվածություն չկա կամ սահմանափակ է։ | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; սահմանափակ կամ բացակայում է սկզբնական բարձրությունը |
● Բույսեր։
Արմատ, ցողուն կամ թերթիկ՝ 450 մգ
Տերև կամ սերմ՝ 300 մգ
Մրգեր՝ 1.2 գ
● Կենդանի։
Սիրտ կամ աղիքներ՝ 450 մգ
Ներքին օրգաններ կամ ուղեղ՝ 240 մգ
Մկաններ՝ 600 մգ
Ոսկորներ, մազեր կամ մաշկ՝ 1.5 գ
● Հոդվածոտանիներ։
Միջատներ՝ 9 գ
Խեցգետնակերպեր՝ 450 մգ
● Ամբողջական արյուն։2 խողովակ
● Բջիջներ: 106 բջիջներ
● Շիճուկ և պլազմա: 6 մլ
Առաջարկվող նմուշի առաքում
Տարա՝ 2 մլ ցենտրիֆուգային խողովակ (անագ փայլաթիթեղը խորհուրդ չի տրվում օգտագործել)
Նմուշային պիտակավորում՝ Խմբավորել+կրկնօրինակել, օրինակ՝ A1, A2, A3; B1, B2, B3:
Առաքում:
1. Չոր սառույց. Նմուշները պետք է փաթեթավորվեն պարկերի մեջ և թաղվեն չոր սառույցի մեջ:
2. ՌՆԹ-կայուն խողովակներ. ՌՆԹ նմուշները կարող են չորացվել ՌՆԹ կայունացման խողովակում (օրինակ՝ RNAstable®) և ուղարկվել սենյակային ջերմաստիճանում:
Ծառայության աշխատանքային հոսք
Փորձի դիզայն
Նմուշի առաքում
ՌՆԹ-ի արդյունահանում
Գրադարանի կառուցում
Հաջորդականացում
Տվյալների վերլուծություն
Հետվաճառքային ծառայություններ
Կենսաինֆորմատիկա
- Հում տվյալներ
- Տվյալների որակի ստուգում
- Գենոմի դասավորություն
- Գեների կառուցվածք (այլընտրանքային սպլայսինգ, գեների կառուցվածքի օպտիմալացում և նոր գեների կանխատեսում)
- Գեների արտահայտման քանակական որոշում
- Դիֆերենցիալ արտահայտման վերլուծություն
- DEG անոտացիա և հարստացում + Դիֆերենցիալ արտահայտված lncRNA թիրախային գեներ
- Տառադարձման նույնականացում
- lncRNA-ի նույնականացում (lncRNA-ի պահպանում և հայտնի lncRNA)
- lncRNA թիրախային գեների կանխատեսում
- lncRNA արտահայտման քանակական որոշում
- mRNA տվյալների հետ համատեղ վերլուծություն
Գեների դիֆերենցիալ արտահայտման (ԳԵԽ) վերլուծություն
lncRNA արտահայտման քանակական որոշում՝ կլաստերացում
lncRNA թիրախային գեների հարստացում
mRNA-ի և lncRNA-ի համատեղ դիրքի վերլուծություն – Circos գրաֆիկ (միջին շրջանագիծը mRNA-ն է, իսկ ներքին շրջանագիծը՝ lncRNA-ն)
Ուսումնասիրեք BMKGene-ի lncRNA հավասարեցման ծառայությունների կողմից իրականացվող առաջընթացները՝ հրապարակումների ընտրված հավաքածուի միջոցով։
Ջի, Հ. և այլք (2020) «Առնետների լյարդում սառը սթրեսի հետ կապված լնկՌՆԹ-ների նույնականացում, ֆունկցիոնալ կանխատեսում և հիմնական լնկՌՆԹ-ների ստուգում»,Գիտական զեկույցներ2020 10:1, 10(1), էջեր 1–14։ doi: 10.1038/s41598-020-57451-7։
Ջիա, Զ. և այլք (2021) «Ինտեգրատիվ տրանսկրիպտոմիկ վերլուծությունը բացահայտում է CyHV-3-ռեզիստենտ սովորական կարպի շտամի իմունային մեխանիզմը»,Իմունոլոգիայի սահմանները, 12, էջ. 687151. doi՝ 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX:
Վանգ, Շ.Ջ. և այլք (2022) «Մուլտի-Օմիկների ինտեգրման վրա հիմնված մրցակցող էնդոգեն ՌՆԹ կարգավորման ցանցերի առաջնահերթությունը մանր բջջային թոքերի քաղցկեղում. մոլեկուլային բնութագրեր և դեղամիջոցների թեկնածուներ»,Ուռուցքաբանության սահմանները, 12, էջ. 904865. doi՝ 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX:
Սյաո, Լ. և այլք (2020) «Populus-ում ֆոտոսինթեզի հիմքում ընկած գեների համատեղ արտահայտման ցանցի գենետիկական դիսեկցիա»,Բույսերի կենսատեխնոլոգիայի հանդես, 18(4), էջեր 1015–1026։ doi: 10.1111/PBI.13270։
Չժենգ, Հ. և այլք (2022) «Գրեյվզի հիվանդության և Հաշիմոտոյի թիրոիդիտի միկրոմիջավայրում իմունային բջիջներում գեների դիսռեգուլյացիայի և աննորմալ նյութափոխանակության ազդանշանների գլոբալ կարգավորող ցանց»,Իմունոլոգիայի սահմանները, 13, էջ. 879824. doi՝ 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX:
