MIKROOBNE
Bakterite ühilduvus ja immobiliseerimine biosöega parandas tebukonasooli lagunemist, mulla mikrobioomi koostist ja toimimist
Täispikk 16S amplikonide sekveneerimine |PacBio HiFi |Alfa mitmekesisus |Beeta mitmekesisus
Selles uuringus pakkus täispika 16S amplikoni järjestamist PacBio abil ja bioinformaatilist analüüsi Biomarker Technologies.
Esiletõstmised
Biosöega immobiliseeritud tebukonasooli lagundava bakteri Alcaligenes faecalis WZ-2 biolagunemise tõhusust ja mõju tebukonasooliga saastunud pinnasele uuriti võrreldes vabalt lagundava tüvega WZ-2.
1. Biosöega immobiliseeritud WZ-2 lagunes tebukonasoolis tõhusamalt kui vaba WZ-2, vähendades tebukonasooli poolväärtusaega mullas 18,7 päevalt 13,3 päevale.
2. Biosöega immobiliseeritud WZ-2 suutsid taastada natiivse mulla mikroobsete ensüümide aktiivsused, sealhulgas ureaasi, dehüdrogenaasi ja invertaasi jne.
3. Mikroobide profiil biosöega immobiliseeritud WZ-2 töödeldud pinnases, mis on määratud täispika 16S sekveneerimisega, toetas kindlalt seda, et see süsteem võib taastada mulla tervise, parandades tebukonasooli saastumise all olevate bakterikoosluse struktuuri.
Katse (seotud järjestamisega)
Rühmitamine: CK: looduslik pinnas;T: tebukonasooliga rikastatud muld;S: Tebukonasool sisaldas mulda vaba tüvega WZ-2;BC: Tebukonasool sisaldas biosöega mulda;BCS: Tebukonasool sisaldas biosöega immobiliseeritud WZ-2 mulda.
Proovide võtmine: 16S rDNA praimeritega amplifitseeritud kogu mulla DNA ekstraheerimine
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) ja 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),esindab täispikka 16S rDNA-d
Järjestusplatvorm: PacBio RS II
Järjestusstrateegia: CCS HIFI loeb
Andmete analüüs:BMKCloudBioinformaatiline platvorm muudab kuldkala suurepäraseks geneetiliseks mudeliks kalade füsioloogia ja evolutsiooni jaoks.
Tulemus
Mulla mikroobikoosluse struktuur määrati 16S rDNA sekveneerimisega.OTU rikkuse ja alfa mitmekesisuse indeksit, sealhulgas Chao1, Ace, Shannoni ja Simpsoni indekseid hinnati, et paljastada iga süsteemi liikide mitmekesisus.Pärast 60-päevast inkubeerimist näitasid kõik indeksid sarnast suundumust, st tebukonasool võib põhjustada mulla liigirikkuse ja mitmekesisuse vähenemist.Kuid tüve WZ-2 lisamisega taastus mullabakterite kooslus osaliselt nii rikkuse kui ka mitmekesisuse osas.BC, BCS ja CK vahel täheldati piiratud erinevust, mis näitab, et biosöe ja biosöega immobiliseeritud WZ-2 võivad tõhusalt taastada mulla bioloogilist tervist.
Selles uuringus kasutati rühmade beetaversioonide mitmekesisuse näitamiseks kaalumata paarirühma meetodit aritmeetilise keskmisega (UPGMA).Nagu on näidatud järgmisel joonisel, jagasid BC, BSC ja CK mikroobide koostise mustrit võrreldes rühmaga T ja S, mis näitas veelgi, et biosöe kasutuselevõtt tebukonasooliga saastunud mulla bioremediatsioonis võib suuresti hõlbustada mikroobikoosluse taastumist mullas.
Joonis.Bakterite kogukonna UPGMA rühmitamine varjupaiga tasemel erineva ravi korral
Viide
Sun, Tong jt."Bakterite ühilduvus ja immobiliseerimine biosöega parandas tebukonasooli lagunemist, mulla mikrobioomi koostist ja toimimist."Ohtlike materjalide ajakiri398 (2020): 122941.
Uudised ja tipphetked eesmärk on jagada uusimaid edukaid juhtumeid ettevõttega Biomarker Technologies, jäädvustada nii uudseid teadussaavutusi kui ka uuringu käigus kasutatud silmapaistvaid tehnikaid.
Postitusaeg: jaanuar 08-2022