מיקרוביאלית
תאימות חיידקים ואימוביליזציה עם ביוצ'אר שיפרו את פירוק טבוקונזול, הרכב ותפקוד המיקרוביום של הקרקע
רצף אמפליקון 16S באורך מלא |PacBio HiFi |גיוון אלפא |גיוון בטא
במחקר זה, רצף אמפליקון 16S באורך מלא על ידי PacBio וניתוח ביואינפורמטי סופקו על ידי Biomarker Technologies.
עיקרי הדברים
חיידקים מתפוררים ב-Biochar, Alcaligenes faecalis WZ-2, נחקרו על יעילות הפירוק הביולוגי ומשפיעה על אדמה מזוהמת עם טבוקונזול בהשוואה לזן המשפיל החופשי WZ-2.
1. WZ-2 שקבוע ב-Biochar הראה פירוק יעיל יותר ב-tebuconazole בהשוואה ל-WZ-2 חופשי על ידי הפחתת זמן מחצית החיים של tebuconazole באדמה מ-18.7 ימים ל-13.3 ימים.
2. WZ-2 משוקע ב-Biochar הצליחו לשחזר פעילויות אנזימים מיקרוביאליים מקוריים בקרקע, לרבות urease, dehydrogenase ו-invertase וכו'.
3. פרופיל מיקרוביאלי באדמה שטופלה ב-WZ-2 שקבועה בביו-char, שנקבע על ידי רצף 16S באורך מלא, תמך מאוד בכך שמערכת זו יכולה לשחזר את בריאות הקרקע על ידי שיפור מבנה הקהילה החיידקית תחת זיהום טבוקונזול.
ניסוי (קשור לרצף)
קיבוץ: CK: אדמה טבעית;T: אדמה משובצת ב-tebuconazole;S: Tebuconazole הכיל אדמה עם זן חופשי WZ-2;לפני הספירה: Tebuconazole הכיל אדמה עם ביוצ'אר;BCS: Tebuconazole הכיל אדמה עם ביוצאר משותק WZ-2.
דגימה: מיצוי DNA כולל של אדמה מוגבר על ידי פריימרים של 16S rDNA
27F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') ו-1492R (5'-GGTTACCTTGTTACGA),חוזר באורך מלא של 16S rDNA
פלטפורמת רצף: PacBio RS II
אסטרטגיית רצף: קריאת CCS HIFI
ניתוח נתונים:BMKCloudפלטפורמה ביואינפורמטית הופכת את דגי הזהב למערכת מודל גנטית מצוינת לפיזיולוגיה ואבולוציה של דגים.
תוֹצָאָה
מבנה הקהילה המיקרוביאלית בקרקע נקבע על ידי רצף rDNA 16S.אינדקס עושר OTU ומגוון אלפא, כולל מדדי Chao1, Ace, שאנון וסימפסון, הוערכו כדי לחשוף את מגוון המינים בכל מערכת.לאחר 60 ימי דגירה, כל המדדים הראו מגמה דומה, כלומר tebuconazole יכול לגרום להפחתה בעושר המינים ובמגוון באדמה.עם זאת, על ידי הוספת זן WZ-2, קהילת חיידקי הקרקע התאוששה באופן חלקי מבחינת עושר וגיוון כאחד.הבדל מוגבל נצפה בין BC, BCS ו-CK, מה שמעיד על כך ש-biochar ו-Biochar-משוגעת WZ-2 יכולים לשחזר ביעילות את הבריאות הביולוגית של הקרקע.
שיטת זוג-קבוצה לא משוקלל עם אמצעים אריתמטיים (UPGMA) יושמה במחקר זה כדי להראות גיוון בטא בין קבוצות.כפי שמוצג באיור הבא, BC, BSC ו-CK חלקו דפוס דומה יותר של הרכב חיידקים בהשוואה לקבוצה T ו-S, מה שהצביע עוד יותר על כך שהחדרה של ביוצ'אר בביורימדיה של קרקע מזוהמת בטבוקונזול יכולה במידה רבה להקל על התאוששות קהילת החיידקים באדמה.
דמות.מקבץ UPGMA של קהילת חיידקים ברמת הפילום בטיפול שונה
התייחסות
סאן, טונג ועוד."תאימות חיידקים ואימוביליזציה עם ביוצ'אר שיפרו את פירוק טבוקונזול, הרכב ותפקוד המיקרוביום של הקרקע."כתב עת לחומרים מסוכנים398 (2020): 122941.
חדשות ודגשים שואפת לחלוק את המקרים המוצלחים האחרונים עם Biomarker Technologies, ללכוד הישגים מדעיים חדשים כמו גם טכניקות בולטות שיושמו במהלך המחקר.
זמן פרסום: ינואר-08-2022