MIKROBIELT
Bakteriel kompatibilitet og immobilisering med biokul forbedret nedbrydning af tebuconazol, sammensætning og funktion af jordens mikrobiom
Fuld længde 16S amplikon sekventering |PacBio HiFi |Alfa mangfoldighed |Beta-diversitet
I denne undersøgelse blev fuldlængde 16S amplikon sekventering af PacBio og bioinformatisk analyse leveret af Biomarker Technologies.
Højdepunkter
Biokul-immobiliserede tebuconazol-nedbrydende bakterier Alcaligenes faecalis WZ-2 blev undersøgt på bionedbrydningseffektivitet og indvirkning på tebuconazol-forurenet jord sammenlignet med frit nedbrydende stamme WZ-2.
1. Biochar-immobiliseret WZ-2 viste en mere effektiv nedbrydning i tebuconazol sammenlignet med fri WZ-2 ved at reducere tebuconazols halveringstid i jord fra 18,7 dage til 13,3 dage.
2. Biochar-immobiliseret WZ-2 var i stand til at genoprette naturlige mikrobielle enzymaktiviteter i jorden, herunder urease, dehydrogenase og invertase osv.
3. Mikrobiel profil i biochar-immobiliseret WZ-2-behandlet jord bestemt ved fuldlængde 16S-sekventering understøttede kraftigt, at dette system kunne genoprette jordens sundhed ved at forbedre den bakterielle samfundsstruktur under tebuconazol-kontamination.
Eksperiment (sekventeringsrelateret)
Gruppering: CK: Naturlig jord;T: Jord tilsat tebuconazol;S: Tebuconazol indeholdt jord med fri stamme WZ-2;BC: Tebuconazol indeholdt jord med biochar;BCS: Tebuconazol indeholdt jord med biokul immobiliseret WZ-2.
Prøveudtagning: Total jord-DNA-ekstraktion amplificeret med 16S rDNA-primere
27F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') og 1492R (5'-GGTTACCTTGTTACGA),repræsenterende fuldlængde 16S rDNA
Sekvenseringsplatform: PacBio RS II
Sekvenseringsstrategi: CCS HIFI læser
Dataanalyse:BMKCloudBioinformatisk platform gør guldfisk til et fremragende genetisk modelsystem for fiskefysiologi og evolution.
Resultat
Jordens mikrobielle samfundsstruktur blev bestemt ved 16S rDNA-sekventering.OTU rigdom og alfa diversitetsindeks, inklusive Chao1, Ace, Shannon og Simpson indekser blev evalueret for at afsløre artsdiversiteten i hvert system.Efter 60 dages inkubation viste alle indekser lignende tendens, dvs. tebuconazol kunne inducere reduktion i artsrigdom og diversitet i jord.Men ved at tilføje stamme WZ-2 blev jordbakteriesamfundet delvist genvundet med hensyn til både rigdom og mangfoldighed.Begrænset forskel blev observeret blandt BC, BCS og CK, hvilket indikerer, at biochar og biochar-immobiliseret WZ-2 effektivt kunne genoprette jordens biologiske sundhed.
Uvægtet pargruppemetode med aritmetiske midler (UPGMA) blev anvendt i denne undersøgelse for at vise beta-diversitet blandt grupper.Som vist i den følgende figur delte BC, BSC og CK mere lignende mønster af mikrobiel sammensætning sammenlignet med gruppe T og S, hvilket yderligere indikerede, at introduktion af biochar i tebuconazol-forurenet jordbioremediering i vid udstrækning kunne lette genopretning af mikrobielle samfund i jorden.
Figur.UPGMA-klyngning af bakteriesamfund på filumniveau under forskellig behandling
Reference
Sun, Tong, et al."Bakteriel kompatibilitet og immobilisering med biochar forbedrede tebuconazolnedbrydning, jordmikrobiomsammensætning og funktion."Journal of Hazardous Materials398 (2020): 122941.
Nyheder og højdepunkter sigter på at dele de seneste succesfulde cases med Biomarker Technologies, fange nye videnskabelige resultater såvel som fremtrædende teknikker anvendt under undersøgelsen.
Indlægstid: Jan-08-2022