МИКРОБНЫЙ
Бактериальная совместимость и иммобилизация биоуглем улучшают деградацию тебуконазола, состав и функционирование почвенного микробиома.
Полноразмерное секвенирование ампликона 16S |ПакБио Hi-Fi |Альфа-разнообразие |Бета-разнообразие
В этом исследовании полноразмерное секвенирование 16S ампликона с помощью PacBio и биоинформатический анализ были предоставлены Biomarker Technologies.
Основные моменты
Иммобилизованные Biochar бактерии Alcaligenes faecalis WZ-2, разлагающие тебуконазол, изучали эффективность биоразложения и влияние на загрязненную тебуконазолом почву по сравнению со свободным разлагающим штаммом WZ-2.
1. Иммобилизованный с помощью биоугля WZ-2 продемонстрировал более эффективное разложение тебуконазола по сравнению со свободным WZ-2 за счет сокращения периода полураспада тебуконазола в почве с 18,7 дней до 13,3 дней.
2. Иммобилизованные с помощью биоугля WZ-2 смогли восстановить активность местных почвенных микробных ферментов, включая уреазу, дегидрогеназу, инвертазу и т. д.
3. Микробный профиль в почве, обработанной биоуглем WZ-2, определенный с помощью полноразмерного секвенирования 16S, убедительно подтверждает, что эта система может восстановить здоровье почвы за счет улучшения структуры бактериального сообщества при загрязнении тебуконазолом.
Эксперимент (связанный с секвенированием)
Группировка: CK: Природный грунт;Т: Почва с добавлением тебуконазола;S: Тебуконазол содержал почву со свободным штаммом WZ-2;BC: Тебуконазол содержал почву с биоуглем;BCS: Тебуконазол содержал почву с иммобилизованным биоуглем WZ-2.
Отбор проб: выделение общей почвенной ДНК, амплифицированное праймерами 16S рДНК.
27F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') и 1492R (5'-GGTTACCTTGTTACGA),представляющая полноразмерную 16S рДНК
Платформа для секвенирования: PacBio RS II.
Стратегия секвенирования: чтение CCS HIFI
Анализ данных:БМКОблакоБиоинформационный платформер делает золотую рыбку превосходной генетической модельной системой для физиологии и эволюции рыб.
Результат
Структуру почвенного микробного сообщества определяли методом секвенирования 16S рДНК.Индекс богатства OTU и альфа-разнообразия, включая индексы Chao1, Ace, Shannon и Simpson, оценивались для выявления видового разнообразия в каждой системе.После 60-дневной инкубации все показатели показали схожую тенденцию, т.е. тебуконазол мог вызывать снижение видового богатства и разнообразия в почве.Однако при добавлении штамма WZ-2 сообщество почвенных бактерий частично восстановилось с точки зрения богатства и разнообразия.Ограниченная разница наблюдалась между BC, BCS и CK, что указывает на то, что биоуголь и иммобилизованный биоуглем WZ-2 могут эффективно восстанавливать биологическое здоровье почвы.
В этом исследовании применялся невзвешенный метод парных групп со средними арифметическими (UPGMA), чтобы показать бета-разнообразие среди групп.Как показано на следующем рисунке, BC, BSC и CK имели более схожую структуру микробного состава по сравнению с группами T и S, что дополнительно указывало на то, что введение биоугля при биоремедиации почвы, загрязненной тебуконазолом, может в значительной степени способствовать восстановлению микробного сообщества в почве.
Фигура.UPGMA-кластеризация бактериального сообщества на уровне типа при различном лечении
Ссылка
Сан, Тонг и др.«Бактериальная совместимость и иммобилизация биоуглем улучшили деградацию тебуконазола, состав и функционирование микробиома почвы».Журнал опасных материалов398 (2020): 122941.
Новости и основные моменты цель – поделиться последними успешными случаями с Biomarker Technologies, фиксируя новые научные достижения, а также выдающиеся методы, примененные в ходе исследования.
Время публикации: 08 января 2022 г.