MIKROBNI
Bakterijska združljivost in imobilizacija z bioogljem izboljšata razgradnjo tebukonazola, sestavo mikrobioma v tleh in delovanje
Sekvenciranje pomnožev 16S v polni dolžini |PacBio HiFi |Alfa raznolikost |Beta raznolikost
V tej študiji je sekvenciranje amplikona 16S v polni dolžini s PacBio in bioinformacijsko analizo zagotovilo Biomarker Technologies.
Poudarki
Z bioogljem imobilizirane bakterije, ki razgrajujejo tebukonazol, Alcaligenes faecalis WZ-2, so preučevali učinkovitost biorazgradnje in vpliv na tla, onesnažena s tebukonazolom, v primerjavi s prosto razgradljivim sevom WZ-2.
1. Z bioogljem imobiliziran WZ-2 je pokazal učinkovitejšo razgradnjo tebukonazola v primerjavi s prostim WZ-2 z zmanjšanjem razpolovne dobe tebukonazola v tleh z 18,7 dni na 13,3 dni.
2. WZ-2, imobiliziran z bioogljem, je lahko obnovil naravne encimske aktivnosti mikrobov v tleh, vključno z ureazo, dehidrogenazo in invertazo itd.
3. Mikrobni profil v z bioogljem obdelani zemlji, imobilizirani z WZ-2, določen s sekvenciranjem 16S v polni dolžini, močno podpira, da bi ta sistem lahko obnovil zdravje tal z izboljšanjem strukture bakterijske skupnosti pod kontaminacijo s tebukonazolom.
Poskus (povezan z zaporedjem)
Skupine: CK: Naravna tla;T: Tla, posejana s tebukonazolom;S: prst, ki je vsebovala tebukonazol s prostim sevom WZ-2;BC: Tebukonazol je vseboval zemljo z bioogljem;BCS: prst, ki je vsebovala tebukonazol z imobiliziranim bioogljem WZ-2.
Vzorčenje: Celotna ekstrakcija DNK iz zemlje, pomnožena s primerji 16S rDNA
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) in 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),ki predstavlja 16S rDNA polne dolžine
Platforma za sekvenciranje: PacBio RS II
Strategija zaporedja: CCS HIFI bere
Analiza podatkov:BMKCloudBioinformatično platformiranje naredi zlato ribico odličen sistem genetskega modela za fiziologijo in evolucijo rib.
Rezultat
Struktura talne mikrobne skupnosti je bila določena s sekvenciranjem 16S rDNA.Bogastvo OTU in indeks alfa raznolikosti, vključno z indeksi Chao1, Ace, Shannon in Simpson, so bili ocenjeni, da bi razkrili raznolikost vrst v vsakem sistemu.Po 60 dneh inkubacije so vsi indeksi pokazali podoben trend, tj. tebukonazol bi lahko povzročil zmanjšanje bogastva vrst in raznolikosti v tleh.Vendar pa je bila z dodajanjem seva WZ-2 skupnost bakterij v tleh delno obnovljena v smislu bogastva in raznolikosti.Opazili so omejeno razliko med BC, BCS in CK, kar kaže, da lahko biooglje in z bioogljem imobiliziran WZ-2 učinkovito obnovita biološko zdravje tal.
V tej študiji je bila uporabljena neutežena metoda parnih skupin z aritmetičnimi sredinami (UPGMA), da se prikaže beta raznolikost med skupinami.Kot je prikazano na naslednji sliki, so imeli BC, BSC in CK bolj podoben vzorec mikrobne sestave v primerjavi s skupinama T in S, kar je nadalje pokazalo, da bi uvedba biooglja v bioremediacijo tal, onesnažene s tebukonazolom, lahko v veliki meri olajšala okrevanje mikrobne skupnosti v tleh.
Slika.UPGMA združevanje bakterijske skupnosti na nivoju filusa pri drugačnem zdravljenju
Referenca
Sun, Tong, et al."Bakterijska združljivost in imobilizacija z bioogljem sta izboljšali razgradnjo tebukonazola, sestavo mikrobioma v tleh in delovanje."Journal of Hazardous Materials398 (2020): 122941.
Novice in poudarki želi deliti najnovejše uspešne primere z Biomarker Technologies, zajeti nove znanstvene dosežke in vidne tehnike, uporabljene med študijo.
Čas objave: 8. januarja 2022